吴杨
- 作品数：14 被引量：20H指数：3
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- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 河八王转录组SSR和SNP序列特征及系统发育分析
- 2023年
- 【目的】对甘蔗野生种河八王转录组SSR和SNP序列特征及系统发育进行分析,为深入研究甘蔗属植物分子标记开发、种质资源利用、种群遗传结构和分化历史动态提供参考。【方法】基于河八王转录组数据,利用MISA和SOAPsnp软件对获得的Unigenes进行SSR和SNP位点发掘及序列特征分析,并从JGI数据库下载二穗短柄草、水稻、谷子、高粱、玉米物和拟南芥转录组数据,采用最大似然(ML)方法构建系统发育进化树,并估算物种分歧时间。【结果】通过河八王转录组测序共获得171000000条Raw reads,经过数据过滤获得156800000条Clean reads,经进一步组装后获得130393条Unigenes,其中有14233条Unigenes含有16372个SSR位点,发生频率为12.56%。含有1个以上SSR位点的Unigenes有1839条,复合型SSR位点有656个。SSR重复基元类型丰富,从单核苷酸到六核苷酸重复均有分布,共有612种SSR重复基元种类,数量最多的类型为三核苷酸重复类型(49.16%),其次是二核苷酸重复(25.54%)和单核苷酸重复(18.30%)。在所有的核苷酸重复类型中,重复基元占SSR位点总数比例<0.50%的类型有14种,出现频率较高的3种重复基元分别为CCG/CGG、A/T和AG/CT。SSR序列长度为12~191 bp,其中长度≤25 bp的SSR位点共有15123个,占SSR位点总数的96.23%,其中长度为15 bp的数量最多,占SSR位点总数的32.16%。SSR重复基元的重复次数为4~24次,且以5、6和7次重复为主。河八王转录组序列共有222106个SNP位点,平均每条Unigenes上有1.70个SNP位点,核苷酸转换类型的比例(65.92%)明显高于颠换类型(34.08%),6种单核苷酸变异类型中,A/G发生频率最高(33.07%),其次是C/T(32.84%)。系统发育分析和物种分化时间估算结果显示,河八王与高粱的亲缘关系最近,分化时间为14.6百万年(Ma)。【结论】河八王转录组中SSR和SNP位点非常丰富,具有较高的遗传多态性,说明利用转录组测序开发甘蔗SSR和SNP分子标记�
- 李海碧吴杨祝开桂意云韦金菊周会张荣华唐利球覃天贤刘昔辉
- 关键词：SSRSNP转录组系统发育分析
- 美国和越南引进甘蔗新种质隔离检疫及农艺性状评价被引量：1
- 2019年
- 为了检测从美国和越南引进的甘蔗材料是否携带有检疫性的斐济病和白条病等病害,并观察其在广西蔗区的农艺性状,以筛选出健康优良的甘蔗新种质。根据引种检疫程序,本研究对引进的41个甘蔗材料在隔离种植期间进行检疫性病害甘蔗斐济病和白条病分子检测。PCR(RT-PCR)结果显示斐济病和白条病均呈阴性,无检疫性病害发生。大田试验对赤腐病、黄斑病、轮斑病、梢腐病、花叶病、黑穗病、锈病和褐条病等常见病害进行了观察,有18份种质未发现有上述病害。根据病害检测结果及田间农艺性状的表现,筛选出8份美国甘蔗种质和4份越南甘蔗种质进入下一轮品种比较试验,为进一步的抗病育种提供优良抗源材料和科学依据。
- 韦金菊宋修鹏张荣华张小秋覃振强魏春燕桂意云周会谭宏伟黄东亮李海碧吴杨李杨瑞刘昔辉
- 关键词：甘蔗种质检疫分子检测农艺性状
- 植物抗线虫分子机制研究进展被引量：1
- 2011年
- 从线虫侵染及致病相关目标基因、线虫与植物的互作、植物抗性反应等方面综述了国内外有关分子水平上植物抗线虫机制的研究进展。指出未来10年内分子植物线虫学将在粮食安全和环境保护方面发挥巨大作用;源于生物技术的抗线虫作物品种商业化将使种植业者获得巨大利益,同时也将为环境带来很大益处。
- 吴杨周会黄诚华
- 关键词：植物寄生线虫线虫防治抗线虫基因
- 甘蔗近缘属种23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列分析被引量：1
- 2013年
- 【目的】探讨叶绿体23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列在甘蔗近缘属种系统进化中的应用,为深入研究甘蔗近缘属种系统进化提供参考。【方法】以14个甘蔗近缘属种材料为研究对象,测序分析其23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列,并应用BLAST分析其在禾本科中的变异情况。【结果】23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列在14个甘蔗近缘属种材料间的同源性为100%,属于高度保守区域,但在禾本科各亚科间表现出一定的变异,且在各亚科中都存在其特异的变异位点。【结论】23S-4.5S-5S rDNA内转录间隔区序列在甘蔗近缘属种间属于高度保守的区域,不适合用于甘蔗近缘属种间系统进化的分析,但可为禾本科亚科系统进化的分析提供有用的信息。
- 吴杨周会李杨瑞
- 关键词：RDNA
- 桂糖43号和桂糖44号在蔗区示范种植表现被引量：1
- 2018年
- 桂糖43号和桂糖44号是广西农业科学院甘蔗研究所选育的甘蔗优良新品种,根据广西区域试验结果,两个品种的产量、糖分和宿根性表现均优于对照新台糖22号;2016/2017年榨季和2017/2018年榨季桂糖43号和桂糖44号分别累计种植面积7.07和52.12万亩;2017年在崇左扶绥、金光农场、桂中农场示范种植,两个品种的平均产量均高于7吨。
- 庞天张荣华周慧文李海碧邓智年王维赞吴杨
- 甘蔗叶绿体DNA微卫星在禾本科中的进化分析被引量：5
- 2012年
- 为开发甘蔗属内及近缘属叶绿体微卫星,或称简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记,以甘蔗叶绿体SSRs(chloroplast simple sequence repeats,cpSSRs)及其侧翼序列为参照,应用BLAST程序对18种禾本科植物进行多序列比对,分析甘蔗cpSSR在禾本科中的进化。结果表明,cpSSRs及其两侧翼区域是进化过程中发生突变的热点区域,禾本科植物cpSSRs的数量在进化过程中处于动态变化的过程,但在亚科水平上保持动态平衡;在禾本科叶绿体基因组不同结构位置中反向重复序列(inverted repeat,IR)中的cpSSRs在进化过程中稳定程度最高,小单拷贝(small single copy,SSC)中的cpSSRs稳定程度次之,大单拷贝(large single copy,LSC)中的cpSSRs稳定程度最低;编码区中cpSSRs的稳定性远远高于非编码区,非编码区为cpSSRs突变发生的主要区域;应用编码区cpSSRs信息构建系统进化树结果最为精确,在涉及亚科以上水平的进化分析时使用非编码区的cpSSRs信息可能会造成结果有误。
- 吴杨周会李杨瑞
- 关键词：甘蔗禾本科叶绿体微卫星
- 美国新引进甘蔗亲本开花习性及其遗传分析
- 2019年
- 【目的】明确12个美国新引进甘蔗亲本的开花习性,为甘蔗育种的亲本选配提供参考依据。【方法】于2013/14～2017/18年连续5年杂交季对该亲本的始花期、抽穗率和花粉染色率进行调查和分析。【结果】甘蔗亲本始花期、抽穗率和花粉染色率的广义遗传力分别为0. 9518、0. 7961和0. 9384;始花期最早的亲本是CP07-1618和CP09-4448,最迟的是CP07-2137,2015/16杂交季各亲本的始花期普遍最晚,其它年份杂交季各亲本的始花期差异不明显;抽穗率低的亲本是CP01-2390、CP07-2137和CP09-4707,均属于难开花亲本,其余9个亲本均属于易开花亲本;花粉染色率低的亲本是CP00-1630、CP06-3458、CP07-1618和CP07-2137,其花粉染色率历年均不超过30%,杂交时只能作为母本,CP06-2422和CP09-4448的花粉染色率最高。【结论】甘蔗亲本始花期、抽穗率和花粉染色率的广义遗传力均属遗传力较高的性状,可在杂交组合配制阶段对该亲本进行较严格的选择。
- 雷敬超周会高丽花韦金菊黄海荣邓宇驰李翔李杨瑞杨荣仲吴杨高轶静
- 关键词：甘蔗亲本开花习性
- 轻型基质网袋在甘蔗组培苗上的应用被引量：1
- 2022年
- 选用3个甘蔗品种‘桂糖42号’、‘桂糖58号’和‘桂果蔗1号’组培苗,通过轻型基质网袋(T)和传统塑料穴盘加黄泥土(CK)2种种植方式,假植后对苗的生长、大田种植初期抗干旱时间、大田移栽成活率以及2种种植方式的优缺点进行对比。结果表明,轻型基质网袋育苗能提高‘桂果蔗1号’组培假植苗成活率,比CK提高1.94个百分点;利用轻型基质网袋育苗,3个甘蔗品种的绿叶数比CK多1~2片,株高增加了22.00%~27.10%;‘桂糖42号’、‘桂糖58号’和‘桂果蔗1号’的根重分别增加了46.5%、36.90%和22.54%。将‘桂糖42号’假植苗种植到大田,在未浇定根水的条件下,对比CK,轻型基质网袋育苗3、4月份抗干旱时间能力提高了3~4倍,在温度较高、阳光较强的6、7月,抗干旱时间能力提高了8倍。大田种植下,轻型基质网袋育苗成活率约为100%,成活率提高了3.26~3.68个百分点。轻型基质网袋育苗具有重量轻、根系发育好、根量多、缩短假植时间、大田种植无缓苗期、运输方便和适合机械化种植等优点,值得在甘蔗组培育苗上大力推广。
- 桂意云吴杨李海碧韦金菊刘昔辉祝开周会赵培方张荣华
- 关键词：甘蔗组培苗育苗
- 甘蔗叶绿体基因组研究进展被引量：5
- 2013年
- 随着现代分子生物学技术的发展,目前已经完成了多种植物叶绿体基因组的全序列测定,并研究了这些基因的结构、功能与表达。大部分高等植物的叶绿体基因组结构稳定,基因数量、排列顺序及组成上具有保守性。随着甘蔗叶绿体基因组测序工作的完成,为甘蔗叶绿体相关研究奠定了良好基础。文章从甘蔗叶绿体基因组图谱、结构和功能基因、叶绿体RNA编辑以及甘蔗属叶绿体系统进化等方面综合概述了甘蔗叶绿体基因组研究取得的成果,并从甘蔗叶绿体遗传转化、甘蔗及近缘属叶绿体基因组测序和叶绿体基因组cpSSRs开发利用等方面指出甘蔗叶绿体基因组今后的研究方向。
- 吴杨周会
- 关键词：甘蔗叶绿体基因组RNA编辑系统进化叶绿体转化
- 甘蔗健康种茎稀植栽培技术被引量：3
- 2018年
- 文章介绍了在多年采用稀植法种植甘蔗健康种茎的生产实践基础上,总结出了甘蔗健康种茎稀植栽培技术要点及其技术优势、推广模式等。为该技术在蔗区的大面积推广应用提供依据及保证。
- 庞天何海波吴杨邓智年王维赞吴凯朝张荣华
- 关键词：甘蔗稀植栽培技术
