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黄海明

作品数:6 被引量:4H指数:1
供职机构:中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金重大基础研究前期研究专项国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 3篇专利

领域

  • 3篇生物学

主题

  • 4篇酵母
  • 4篇酵母双杂交
  • 3篇结构域
  • 2篇蛋白质相互作...
  • 2篇验证性
  • 2篇诱饵蛋白
  • 2篇双杂交系统
  • 2篇配体结合
  • 2篇酵母双杂交系...
  • 2篇家族
  • 2篇ZO-1
  • 1篇烟草
  • 1篇烟草基因组
  • 1篇文库
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇基因组DNA
  • 1篇核酸
  • 1篇多肽
  • 1篇氨基酸

机构

  • 5篇中国医学科学...
  • 1篇中国医学科学...

作者

  • 6篇黄海明
  • 6篇高友鹤
  • 5篇马素参
  • 4篇宋婀莉
  • 3篇高诗娟
  • 3篇田瑞
  • 1篇郭佳岩
  • 1篇李英娜
  • 1篇张玲

传媒

  • 2篇中国生物化学...
  • 1篇生物工程学报

年份

  • 1篇2012
  • 1篇2007
  • 1篇2006
  • 1篇2005
  • 1篇2004
  • 1篇2003
6 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
随机多肽文库构建方法
本发明涉及一种新的随机多肽文库构建方法,更具体地,本发明涉及利用自然界存在的所有核酸资源而构建随机多肽文库的方法以及由此构建的多肽文库。用本方法构建的文库多肽的长短不一、序列各异,平均长度为21个氨基酸,因此这样的文库应...
高友鹤黄海明
文献传递
通过筛选随机多肽文库研究ZO-1中PDZ1结构域的配体结合特点被引量:1
2006年
选择ZO-1的PDZ1结构域作为研究对象,以酵母双杂交为筛选系统,筛选随机多肽文库和与其它PDZ结构域的配体进行相互作用,阐明ZO-1PDZ1的配体结合特性.ZO-1PDZ1识别配体C末端保守的氨基酸序列通式可以表示为[S/T][F/Y/W][V/I/L/C]-COOH、[S/T][K/R]V-COOH、V[F/Y/W][L/C]-COOH、EYV-COOH.研究发现ZO-1PDZ1的配体同时具有3种传统PDZ结构域配体的特点,不同的是其结合配体-1位对芳香族氨基酸具有强烈的偏好性.并且某些PDZ结构域配体的-1位和-3位对结构域与配体相互作用的特异性和亲和力有重要的作用.随后通过生物信息学的方法在Swiss-Prot数据库找到与此识别规律相符合的天然人类蛋白质.根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择10个配体用酵母双杂交验证相互作用.证实的相互作用配体有4个.本研究希望用这样的研究策略建立一种有效的研究蛋白质相互作用的方法,通过在全蛋白质组规模上对含有结合配体保守氨基酸序列的蛋白质的查询,理论上可以找到现有数据库中所有可能与目的结构域结合的潜在配体蛋白,特别是那些筛选cDNA文库不容易获得的低丰度配体.
田瑞李英娜宋婀莉高诗娟黄海明张玲马素参高友鹤
关键词:蛋白质相互作用PDZ结构域酵母双杂交
利用烟草基因组DNA构建近随机多肽文库
2005年
介绍一种新的方法构建近随机多肽文库。选取从大基因组物种的组织或细胞中提取的基因组DNA ,利用切割频率高的限制性内切酶切割 ,产生的短片段可以近似地认为是随机序列的片段 ,将它们与匹配的载体连接后转化进宿主细胞进行表达 ,从而获得近随机多肽文库。这样的文库可以用于蛋白质相互作用的研究。同一种基因组DNA可以利用不同的酶切 ,再分别连接到表达载体的不同读码框架 ,从而产生不同编码序列的多种近随机多肽文库。介绍了充分利用烟草基因组DNA构建两种不同酶切 ,三种读码框架 ,共六种不同编码序列的近随机多肽文库的方法。
马素参黄海明高友鹤
关键词:烟草基因组DNA
一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法
本发明公开了一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法。该方法包括以下步骤:1)以目的结构域家族中结合特性有代表性的成员为诱饵蛋白筛选酵母双杂交文库;2)收集步骤1)筛选获得的结合配体克隆以及其它已知或可能的目的结构域结合配...
高友鹤宋婀莉高诗娟田瑞马素参黄海明
文献传递
利用随机多肽文库研究ZO-1中PDZ3结构域的配体结合特点被引量:4
2004年
建立一种研究PDZ结构域配体结合特点的简单方法 .利用酵母双杂交技术从随机多肽文库中寻找所有可能与ZO 1中PDZ3结构域结合的C末端序列 ,从现有蛋白质数据库中检索所有具有该C末端蛋白 .利用液体培养物 β 半乳糖苷酶检测实验 ,比较文库中筛选的C末端序列和已知的PDZ3结构域结合配体———JAM的C末端 (SFLV)与PDZ3结构域结合的强弱 .共筛选到 3个阳性克隆 ,其C末端序列分别为 LGWV、 LVWV和 DEWV .前 2者属于第二类PDZ结构域 ,后者属于第三类 .蛋白质数据库检索结果表明 ,有多个蛋白质具有 LGWV、 LVWV末端 ,没有检索到任何具有 DEWV末端的蛋白质 .结合强度实验结果表明 ,它们与PDZ3结构域结合强度依次为 DEWV > LGWV > LVWV > SFLV ,说明筛选的 3个C末端除了反映ZO 1中PDZ3结构域可能的潜在结合配体外 ,也有可能成为JAM蛋白阻断性试剂甚至药物的重要组成部分之一 .利用随机多肽文库 ,可以尽可能寻找所有可能与PDZ结构域结合的C末端序列 。
郭佳岩宋婀莉黄海明马素参高友鹤
关键词:ZO-1蛋白质相互作用酵母双杂交
一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法
本发明公开了一种验证性筛选目的结构域结合配体的方法。该方法包括以下步骤:1)以目的结构域家族中结合特性有代表性的成员为诱饵蛋白筛选酵母双杂交文库;2)收集步骤1)筛选获得的结合配体克隆以及其它已知或可能的目的结构域结合配...
高友鹤宋婀莉高诗娟田瑞马素参黄海明
文献传递
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