高利海
- 作品数：3 被引量：11H指数：1
- 供职机构：华南理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 南美白对虾养殖底泥中氨氧化细菌与氨氧化古菌多态性分析被引量：11
- 2011年
- 【目的】本研究皆在了解虾养殖底泥中氨氧化细菌与氨氧化古菌群落多态性。【方法】以功能基因为基础,构建氨氧化细菌(AOB)与氨氧化古菌(AOA)的氨单加氧酶α亚基基因(amoA)克隆文库。利用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术将克隆文库阳性克隆子进行归类分析分成若干个可操作分类单元(Operational Taxa Units,OTUs)。【结果】通过序列多态性分析,表明AOB amoA基因克隆文库中所有序列都属于变形杆菌门β亚纲(β-Proteobacteria)中的亚硝化单细胞菌属(Nitrosomonas)及Nitrosomonas-like,未发现亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)。AOA amoA基因克隆文库中只有一个OTU序列属于未分类的古菌(Unclassified-Archaea),其余序列都属于泉古菌门(Crenarchaeote)。AOA群落结构单一且存在一个绝对优势类群OTU3,其克隆子数目占克隆文库的57.45%。AOB和AOA amoA基因克隆文库分别包括13个OTUs和9个OTUs,其文库覆盖率分别为73.47%和90.43%。AOB amoA基因克隆文库的Shannon-Wiener指数、Evenness指数、Simpson指数、Richness指数均高于AOA。【结论】虾养殖塘底泥中存在氨氧化古菌的amoA基因,且多态性低于氨氧化细菌,表明氨氧化古菌在虾养殖塘底泥的氮循环中可能具有重要的作用。
- 高利海林炜铁
- 关键词：AMOA基因PCR-RFLP分析
- 南美白对虾养殖底泥氨氧化细菌与氨氧化古菌多态性分析
- 氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria, AOB)在氮素的生物地球化学循环中起着重要的作用,是硝化作用氨氧化的限速步骤,主要由属于变形杆菌门的β-亚纲和γ-亚纲的Nitrosococcus ha...
- 高利海
- 文献传递
- 一种对虾养殖水体菌群多态性检测的方法
- 本发明公开了一种对虾养殖水体菌群多态性检测的方法，该方法包括以下步骤：(1)虾养殖水体样品中混合微生物总基因组DNA的提取；(2)设计特异性T-RFLP-PCR通用引物，PCR循环反应；(3)产物纯化，用特异限制性内切酶...
- 林炜铁高利海张星朱雅楠罗剑飞
- 文献传递
