闵自信
- 作品数：6 被引量：6H指数：1
- 供职机构：西安交通大学医学部基础医学院生物化学与分子生物学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学电子电信更多>>
- 大鼠20q的一条新miRNA鉴定及其对软骨发育的功能研究
- 目的:通过基因测序、生物信息学及Northem blot的方法证实大鼠20q的一条新miRNA;预测新miRNA的靶基因并对其靶向关系进行验证;过表达和抑制新miRNA,检测部分与软骨发育有关的相关基因表达,初步阐明其对...
- 王权成闵自信郭源旭孙梦瑶吕社民孙健
- miR-23b调控软骨基质代谢的研究
- 骨关节炎(osteoarthritis,OA)是一种由环境因子引起的软骨细胞分化异常和基质的合成与分解代谢失衡,使软骨组织的修复能力丧失和持 续损伤,导致软骨下骨硬化疾病。我们前期通过消减杂交(SSH)方法,筛选OA患者...
- 郭源旭闵自信孙梦瑶Safdar Hussain袁莹郭东贤赵益童许鹏孙健吕社民
- 关键词：骨性关节炎软骨细胞分化
- U6和let-7a作为定量检测miRNAs的内参在大鼠软骨中稳定性的比较
- 2017年
- 目的比较U6和let-7a两种内参在RT-qPCR方法检测大鼠股骨头软骨样本microRNAs(miRNAs)的稳定性。方法取软骨生成过程的新生(D0)、断乳(D21)、性成熟(D42)3个时间节点的雌性近交系DA大鼠股骨头软骨,提取总RNA,用RT-qPCR方法分别在U6和let-7a两种内参体系下,检测miR-1、-25、-26a、-140、-146a、-150、-181a、-195、-223、-337等的表达,并与课题组前期获得的二代测序绝对定量结果进行比较,综合评价两种内参的稳定性。结果在D42样本中U6(P=0.045)、let-7a(P=0.021 5)的相对值出现了显著性差异;在两种内参体系中miR-26a、-140、-223、-337的表达趋势相同,miR-1、-146a差异无统计学意义,miR-25、-150、-181a、-195都出现了显著性差异(P<0.05)。综合二代测序绝对定量结果比较,let-7a稳定性优于U6。结论 let-7a稳定性优于U6,更适合做软骨miRNA定量的内参。
- 易林郭华郭东贤闵自信袁莹赵益童韩燕钟楠楠孙健
- 关键词：软骨内参RT-QPCR
- 大鼠软骨生成过程表达的小分子RNA生物信息学分析
- 2015年
- 目的：分析大鼠软骨形成过程中小分子 RNA（sRNA）表达谱变化及其基因功能,探讨软骨细胞增殖与分化的机制。方法取新生、断乳、性成熟3个时间节点的雌性 SD 大鼠股骨头软骨构建 sRNA 文库,Solexa 测序平台鉴定软骨组织全部 sRNA 序列表达,所得的全部清洁序列与 SD 大鼠基因组信息比对,并做生物信息学分析。结果3个文库筛选出与基因组序列完全匹配序列,分别对应着217921条（41.23%）、196650条（38.74%）、245436条（41.54%）unique sRNA 序列。长度为20~24 nt 的 sRNA 占比：d 0为71.94%、d 21为72.85%、d 42为86.39%；其中,长度为22 nt的 sRNA 约占清洁序列的一半。文库序列分布特征,符合高质量 sRNA 文库的特征。超过总数62%的清洁序列来自于成熟 miRNA 序列,但在3个文库中的占比却仅仅只有0.69%、0.78%和0.63%。约60%的unique sRNA 序列无法与 miRBase 20.0和 Rfam9.1匹配。结论3个 sRNA 文库的 miRNA 这种分布模式,可能暗示着有功能不同或者来源各异的 miRNA,参与了对骨骼发育和骨形成关键阶段软骨细胞增殖与分化的调控。
- 邵世滨闵自信郭源旭王权成孙梦瑶韩燕孙健
- 关键词：SRNA生物信息学
- 两种实时定量RT-PCR方法检测miRNAs表达的技术分析被引量：6
- 2013年
- 目的比较两种实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)方法检测microRNAs(miRNAs)表达含量的技术差异,优化不同实验目的和条件下研究miRNAs表达的技术方法。方法取21d和42d两个时间点的SD大鼠关节软骨组织,采用Trizol法提取总RNA备用。选取rno-miR-15b、rno-miR-16、rno-miR-195、rno-miR-497作为研究对象,分别用茎环引物和试剂公司提供的试剂盒方法反转录总RNA,并应用实时定量PCR方法检测这些miRNAs的表达量。提取人血浆中总RNA,用上述两种RT-qPCR方法实时定量检测has-miR-16的表达量。结果两种方法检测这些miRNAs表达量,在大鼠21d和42d这两个时间点其表达量变化趋势相同,都呈现增高的趋势,这与我们前期Solexa测序结果相同。在血浆中的结果显示,其中茎环引物反转录方法灵敏度相对较高。结论茎环引物法在少量几个重要的miRNAs检测中具有优势,而试剂盒方法适用于大量miRNAs的筛查。
- 闵自信杜小云宁启兰钟楠楠郑悦雯韩燕吕社民张蕊
- 关键词：MIRNAS软骨血浆
- 低硒对DA大鼠关节软骨细胞硒蛋白表达的影响
- 目的:筛选出在骨软骨发育过程中起到关键作用的硒蛋白。研究低硒对关节软骨细胞中硒蛋白表达的影响。方法:1.选择出生后3个不同发育阶段(0d、21d、42d)DA大鼠的肝脏和股骨头软骨细胞,每个时间点10只大鼠,RT-PCR...
- 闵自信孙健钟楠楠赵文祥张蕊阎继东郑悦雯张富军吕社民
- 文献传递
