郭建秀
- 作品数：4 被引量：17H指数：2
- 供职机构：电子科技大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学理学更多>>
- 蛋白质折叠速率预测研究进展被引量：15
- 2006年
- 蛋白质折叠速率预测是当今生物物理学最具挑战性的课题之一。近年来,该领域的研究取得了很大的进展,提出了许多经验参数,例如:接触序、长程序、总接触距离、链拓扑参数、二级结构含量、有效长度、螺旋参数、n-阶接触距离等。这些参数都和蛋白质的折叠速率有很好的相关性,基于这些参数的各种预测方法所得到的预测结果也与实验数据较好地吻合。
- 郭建秀马彬广张红雨
- 关键词：蛋白质折叠蛋白质结构
- 基于神经网络的蛋白质折叠速率预测
- 蛋白质是一类最重要的生物大分子,在生物体内占有特殊的地位.蛋白质折叠是蛋白分子从它的变性状态到达其具有生物活性的天然构象的过程,在这一过程中,不同的蛋白质其折叠速率有着很大的差异.
为了揭示蛋白质折叠速率的决定...
- 郭建秀
- 关键词：蛋白质折叠人工神经网络
- 文献传递
- 从氨基酸序列预测蛋白质折叠速率被引量：3
- 2010年
- 蛋白质折叠速率预测是当今生物物理学最具挑战性的课题之一.近年来,许多科研工作者开展了大量的研究工作来探索折叠速率的决定因素,许多参数和方法被相继提出.但氨基酸残基间的相互作用、氨基酸的序列顺序等信息对折叠速率的影响从未被提及.采用伪氨基酸组成的方法提取氨基酸的序列顺序信息,利用蒙特卡洛方法选择最佳特征因子,建立线性回归模型进行折叠速率预测.该方法能在不需要任何(显示)结构信息的情况下,直接从蛋白质的氨基酸序列出发对折叠速率进行预测.在Jackknife交互检验方法的验证下,对含有99个蛋白质的数据集,发现折叠速率的预测值与实验值有很好的相关性,相关系数能达到0.81,预测误差仅为2.54.这一精度明显优于其他基于序列的方法,充分说明蛋白质的序列顺序信息是影响蛋白质折叠速率的重要因素.
- 郭建秀饶妮妮刘广雄李杰王云鹤
- 关键词：蛋白质折叠蒙特卡罗方法
- 蛋白质折叠速率预测方法研究
- 蛋白质是一类重要的生物大分子,是生命活动的主要承担者,在生物体内占有特殊的地位。只有正确折叠成其特定的天然结构,蛋白质才能执行其生物学功能。正确理解蛋白质的折叠机理是当今生物物理学的核心课题之一,不仅具有重要的科学意义,...
- 郭建秀
- 关键词：蛋白质折叠神经网络蒙特卡洛方法网络服务
- 文献传递
