苏斌 作品数:91 被引量:661 H指数:13 供职机构: 安徽省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 安徽省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 文化科学 自然科学总论 农业科学 更多>>
安徽省2017-2018年手足口病柯萨奇病毒A6型基因进化特征分析 被引量:7 2021年 人肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)是引起手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体。近年来非EV-A71和非CV-A16的其他肠道病毒(Enterovirus,EV)已成为HFMD流行或暴发疫情的优势病原体。安徽省HFMD监测数据显示,2017-2018年HFMD样本非EV-A71和非CV-A16其他EV核酸阳性率超过50%,其中大部分为柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)。为了解安徽省2017-2018年HFMD其他肠道病毒构成和CV-A6基因进化特征,本研究收集2017-2018年HFMD咽拭子EV核酸阳性标本,采用人横纹肌肉瘤(RD)细胞进行病毒分离培养,对分离到的CV-A6毒株VP1全长序列基因扩增及核苷酸序列测定。从NCBI GenBank数据库下载CV-A6原型株和代表性毒株基因参考序列,运用生物软件MEGA 6.0构建VP1基因序列系统进化树,分析其基因遗传特征。结果显示,安徽省2017-2018年HFMD实验室确诊病例其他EV占66.1%,CV-A16占23.5%,EV-A71占10.4%。52株CV-A6毒株均为D3a基因亚型,其VP1区核苷酸序列间相似度为93.7%~100%,编码的氨基酸序列相似度为98.3%~100%;与CV-A6 Gdula原型株核苷酸相似度为78%~82.3%,氨基酸相似度为94.6%~96.3%。VP1区15个氨基酸位点有变异,氨基酸位点Q98L和G160S的变异发生率为100%。其他EV已成为安徽省引起HFMD流行的重要病原体,D3基因型CV-A6为优势流行毒株。持续加强其他EV的病原学监测与分析,对安徽省HFMD防控策略制定与疫情处置具有重要意义。 史永林 葛盈露 马婉婉 陈芳 陈国平 孙永 苏斌关键词:D基因型 进化分析 性病门诊患者艾滋病防治知识和行为状况分析 被引量:11 2006年 目的了解艾滋病高发区性病门诊患者的艾滋病(AIDS)相关知识和行为状况,为制定防治策略和措施提供参考依据。方法以安徽省7个艾滋病综合示范区的县级医疗机构的性病门诊为单位,采取整群随机抽样的方法,抽取一定时段内门诊患者,由当地卫生专业人员担当调查员,用结构化问卷,以面访形式对患者进行调查。结果共收集有效问卷952份,应答率为95.2%。艾滋病相关知识总体知晓率为77.8%,对传播途径、防治知识和非传播途径的知晓率分别为83.0%,76.1%和74.1%;男性和中青年知识掌握情况较好,最近3个月内有非婚性伴者260人(27.3%),其中男性36.1%,女性7.5%;与非婚性伴发生性关系时从不使用安全套者127人(48.7%),每次都用者仅10人(3.8%)。结论安徽省艾滋病综合示范区性病门诊患者的AIDS相关知识水平还有待提高,尤其是女性和年长者。安全套使用比例相对较低,行为干预应从知识宣传向促进安全性行为转变。 童连 王德斌 洪倩 苏斌 管建粉 程静 蔡海燕关键词:性病 门诊患者 知识 安徽省艾滋病监测哨点HCV筛查抗体阳性样本补充试验与病毒载量检测结果分析 被引量:5 2019年 目的了解安徽省艾滋病监测哨点丙型肝炎(简称丙肝)病毒(HCV)阳性者在各类人群的分布情况,并对HCV检测实验室常用的抗体检测与核酸检测方法进行分析。方法以2016年安徽省艾滋病监测哨点HCV酶联免疫法(EIA)检测阳性的370例标本为研究对象,进行HCV抗体补充试验,样本量足够的情况下进行HCV核糖核酸(RNA)定量检测,结合流行病学资料进行分析。结果对369例EIA检测HCV阳性标本进行重组免疫印迹试验(RIBA),阳性率99.2%(366例),其中注射吸毒人群占90.4%(331/366),暗娼占4.1%(15/366),性病门诊就诊者占3.0%(11/366),流动人口占1.4%(5/366),孕产妇占0.8%(3/366),男男性行为者占0.3%(1/366);344例样本量足够的标本进行了HCV RNA定量检测,阳性率82.6%(284/344),丙肝核酸阴转率为17.4%(60/344),对RIBA阳性结果的标本进行分条带统计,其中核抗原区出现概率最高,达到99.7%(365/366),其次为NS3-1、NS3-2和NS5,NS4出现概率最低,仅为85.8%(314/366)。结论我省艾滋病哨点中HCV感染和患病者集中在吸毒人群,是防治的最主要人群;HCV EIA检测阳性的标本可直接进行核酸检测,不必进行抗体补充试验,以减少检测成本;但核酸结果与抗体和临床症状相悖时也应考虑随访检测。 缪礼锋 沈月兰 苏斌 程晓莉 吴建军关键词:丙型肝炎病毒 抗体 病毒载量 2020年马鞍山市洪涝灾害期间病媒生物调查结果分析 被引量:2 2022年 目的 了解洪涝灾害期间马鞍山市主要病媒生物的密度及分布,为采取有效应对措施提供科学依据。方法2020年在马鞍山市洪涝灾害较为严重的含山县、和县,选择洪涝灾害居民临时安置点或自然村作为调查实施区域,开展蚊、蝇和鼠类调查,计算媒介密度、路径指数等。结果 蚊类平均密度为34.27只/(台·夜),其中三带喙库蚊为优势蚊种,占总捕获蚊数的67.11%(253/377),蚊类路径指数为2.40处/km;蝇类平均密度为6.40只/笼,其中农贸市场蝇密度最高,为11.33只/笼;夹夜法未捕获鼠类,路径法发现鼠迹数9处,路径指数为7.8处/km。结论 洪涝灾害期间马鞍山市病媒生物密度处于较高水平,需重视洪涝灾害期间的病媒生物防制工作,维护灾后环境卫生。 马李 侯银续 侯赛 陈健 苏斌 黄发源关键词:洪涝灾害 病媒生物 密度调查 艾滋病高危人群相关知识与行为状况调查 被引量:15 2007年 [目的]了解艾滋病综合防治示范区内高危人群的艾滋病相关知识及行为状况,为进一步开展有针对性的行为干预提供依据。[方法]采用概率或非概率抽样法抽取示范区内既往有偿献血员、暗娼、吸毒者、性病门诊就诊者共计3 872人,使用结构化问卷,由受过统一培训的调查员进行单独面访。[结果]4类人群艾滋病知识总体知晓率均高于70%,但对主要传播途径、非传播途径和防治知识不同类别的知识回答正确率不同;电视等大众媒介是各类人群实际接受和期望获得知识的主要途径;高危人群每次使用安全套的频率均不高,如暗娼与非商业性固定性伴发生性关系时使用率仅7.8%;性病门诊就诊者与非婚性伴发生性关系时使用率仅3.8%。[结论]示范区内高危人群艾滋病相关知识知晓率较高,但对不同类别知识的掌握程度不同;电视是示范区各类人群获取知识的最主要来源;高危人群安全套使用率不高,应从单纯关注高危人群的知识了解转变为促进其行为改变。 程静 洪倩 王德斌 苏斌 童连 管建粉 蔡海燕关键词:问卷调查 高危人群 H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列测定方法的建立 被引量:7 2018年 建立以Sanger测序为基础的H9N2亚型禽流感病毒全基因组测序方法。从GenBank和GISAID数据库中选取2000至2012年中国地区和中国国家流感中心病毒序列数据库中H9N2亚型禽流感病毒的8个片段基因序列,通过比对分析在相对保守的区域设计分段扩增引物,共16对。选用1株病例分离毒株和4株环境分离毒株对引物进行验证和进一步优化。优化后的16对引物能够有效扩增5株H9N2亚型禽流感病毒,仅个别反应出现非特异扩增。所有获得的目的片段仍能有效进行后续测序实验。建立了一种能够有效获得新型重配H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列的Sanger测序方法,为该病原分子流行病学研究和开展风险评估提供技术支撑。 何军 李晓丹 何兰 俞俊岭 苏斌关键词:流感病毒 H9N2 全基因组 传染病类疾病负担评价方法研究进展 被引量:11 2019年 疾病负担(burden of disease,BOD)的概念为疾病、残疾和早逝对人群健康损失以及社会经济造成的影响,包括发病、残疾、生活质量下降、死亡、经济损失等内容[1],这一概念量化了疾病对人口健康状况和社会经济负担的影响。自1993年全球疾病负担(GBD)研究推出以来,疾病负担得到了各国广泛的应用,各国研究机构都有采用这种方法来测量不同类型疾病对人群健康的影响程度[2-6]。目前,疾病负担主要被分为流行病学负担和经济负担两个方面,因此疾病负担的研究指标也被相应地分为公共卫生指标学和经济学指标两类,一般多用流行病学方法研究一般健康状况描述指标、寿命和健康损失指标等公共卫生学指标[7-9],多用卫生经济学方法研究经济指标[10-12]。 马婉婉 马婉婉 苏斌 苏斌 吴家兵 龚磊 陈芳 宋丹丹 侯赛 侯赛关键词:疾病负担 既往有偿献血人员艾滋病相关知识和行为现状调查 被引量:4 2007年 [目的]了解安徽省既往有偿献血人员艾滋病相关知识和行为现状。[方法]采取整群随机抽样的方法,抽取安徽省既往有偿献血人群较集中的乡镇,由当地卫生专业人员担当访问员,用结构化的问卷,以入户调查的形式进行调查。[结果]调查有效问卷共1360份,应答率为98.2%。艾滋病相关知识总体知晓率为79.6%,其中对非传播途径、传播途径和防治知识的知晓率分别为84.9%,84.6%和75.3%,男性好于女性(χ2=168.844,P﹤0.01);知识获取途径前3位依次为电视(93.3%)、收音机(56.6%)和家人(52.4%)。献血时间大多为1~3年(91.6%),以单采血浆为主(65.0%),混合献血导致的感染率最高(26.8%);安全套使用情况男性好于女性(χ2=7.718,P﹤0.05),HIV阳性人群好于阴性人群(χ2=146.313,P﹤0.01);接受采血者1350人(98.5%),HIV检测结果阳性者91人(6.8%)。[结论]虽然艾滋病示范区有偿献血员的艾滋病知识掌握情况较好,但仍需加强对其(尤其是女性和中老年)艾滋病预防知识的宣传教育和安全套促进工作。 童连 王德斌 苏斌 王华东 程晓莉 洪倩 管建粉 程静 蔡海燕关键词:艾滋病 有偿献血 知识 安徽省485例抗病毒治疗失败艾滋病患者耐药基因型分析 被引量:5 2019年 目的研究接受高效抗反转录病毒治疗失败的艾滋病患者体内病毒的耐药突变位点,为及时调整药物治疗方案提供依据。方法以安徽省2014年收集的487例病毒载量>1000copies/ml的在治患者标本为研究对象,应用巢式反转录PCR( reverse transcription-polymerase chain reaction, RT- PCR)扩增HIV-1聚合酶( pol)基因区,经DNA测序后与国际耐药数据库比对,确定HIV-1基因亚型,分析耐药突变位点。结果成功获得 pol区序列485条,以B亚型为主,有313例(64.5%),其次是CRFO1_ AE亚型116例(23.9%);突变率排在前三位的蛋白酶抑制剂( PIs)耐药基因突变分别是A71T(30. 4%)、A71V(24. 1%)、L10I(10.7%);突变率排在前三位的核苷类反转录酶抑制剂( NRTIs)耐药相关基因分别是M184V(31.1%)、T215Y(5.2%)和M41L(4.4%);突变率排在前三位的非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药相关基因分别是K103N(14.8%)、Y181C(8. 9%)和G190A(6.1%)。结论安徽省治疗人群仍以 B亚型为主;发生了针对PIs、NRTIs和NNRTIs的不同耐药突变株,了解耐药位点特征对预防和控制耐药株发生有重要意义。 缪礼锋 沈月兰 苏斌 程晓莉 吴建军关键词:艾滋病 抗病毒治疗 耐药 2018-2019年安徽省柯萨奇病毒A组16型B1基因亚型分离株分子特征分析 被引量:4 2022年 目的 了解安徽省2018—2019年手足口病(HFMD)柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分子病原学进化特征。方法 对安徽地区2018—2019年从HFMD患者咽拭子样本中分离的CV-A16毒株,采用反转录聚合酶链式反应(RTPCR)扩增其VP1基因全长核酸片段、测定其核苷酸序列。采用肠道病毒在线分型工具鉴定CV-A16毒株基因亚型,运用MEGA 6.0生物软件最大似然法(maximum likelihood method)构建VP1基因进化树、MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性。结果 安徽省2018—2019年共分离到HFMD CV-A16毒株88株。其中2018年分离到30株,2019年58株。其VP1区全长基因均由891个核苷酸碱基组成,编码297个氨基酸。基因分型鉴定和进化分析显示,88株CV-A16毒株中B1a和B1b基因亚型分别为25株(28.41%)、63株(71.59%)。VP1区遗传进化表明,88株CV-A16毒株均归为B1基因型,其中25株属于B1a基因亚型,63株属于B1b基因亚型。同源性分析显示,B1a基因亚型毒株与CV-A16原型株G-10核苷酸同源性为64.1%~65.3%,氨基酸同源性为90.3%~91.1%;B1b毒株与原型株核苷酸及氨基酸同源性分别为62.8%~66.0%和91.1%~91.8%。88株CVA16与原型株VP1区氨基酸序列比较发现26个氨基酸位点出现变异。结论 安徽地区2018—2019年HFMD CV-A16毒株以B1b与B1a共同流行,B1b为优势基因亚型,应重视CV-A16流行毒株的分子病原学监测。 史永林 葛盈露 马婉婉 孙永 吴家兵 苏斌关键词:柯萨奇病毒A组16型 手足口病 进化分析