程灿灿
- 作品数：3 被引量：23H指数：3
- 供职机构：南方医科大学南方医院更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 16S rDNA和ITS2基因序列分析用于难鉴定病原菌分子诊断被引量：3
- 2015年
- 目的利用16S rDNA和转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)基因序列分析方法对难鉴定病原菌进行分子诊断。方法对某三甲医院4年来的220株难鉴定细菌和130株难鉴定真菌,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)分别扩增16S rDNA和ITS2基因并测序PCR扩增布鲁氏菌特异基因,并测序进行区分布鲁氏菌和人苍白杆菌,直接从血液标本中提取细菌DNA进行16S rDNA扩增,并与BD Phoenix100微生物分析仪结果进行对比。结果 220株中8株尚未在国内临床感染标本中报道,2株尚未在国外临床报道;130株真菌中2株尚未在国内临床感染中报道。布鲁氏菌特异基因BCSP31可区分布鲁氏菌和人苍白杆菌。100例血培养标本中发现10例16S rDNA和仪器法鉴定结果不一致,以16S rDNA鉴定结果为准。结论核糖体基因序列分析可以作为临床难鉴定细菌和真菌的分子生物学诊断方法,某些细菌的特异基因检测可作为辅助鉴定方法。
- 陆文婷程灿灿芮勇宇
- 关键词：RDNA
- 6株超级细菌NDM-1基因环境研究被引量：7
- 2014年
- 目的:研究6株超级细菌NDM-1基因环境,探讨耐药基因水平转移机制。方法:收集耐碳青霉烯的G-杆菌400株,利用PCR方法检测NDM-1基因,并测序验证。根据目前报道的NDM-1基因环境常见类型设计系列引物,步移法特异性扩增NDM-1基因上下游序列,并对扩增产物测序和序列分析。步移法检测阴性的菌株进行全基因组HindⅢ酶切,将NDM-1基因及基因环境克隆到pET28a质粒后再测序。结果:400株对碳青霉烯类耐药的G-杆菌中有6株NDM-1阳性。步移法检出其中5株菌的基因环境,包括不动杆菌基因种13TU、产酸克雷伯菌、不动杆菌基因种3、肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌。这5株菌的基因环境与文献报道基本一致。产气肠杆菌的NDM-1基因环境经DNA克隆测序获得,从上游至下游为:部分缺失的转座酶Tn3、IS26及ISAba125,blaNDM-1,ble,部分缺失的异构酶trpF和SSen4元件。结论:NDM-1基因上下游常包含转座子或插入序列等元件,为其水平转移奠定基础。
- 程灿灿芮勇宇
- 关键词：超级细菌NDM-1
- 泛耐药鲍曼不动杆菌耐药机制和传播机制研究被引量：13
- 2013年
- 目的:了解我院泛耐药鲍曼不动杆菌的耐药机制和传播机制。方法:利用PCR、RFLP分型和测序技术对临床分离的77株泛耐药鲍曼不动杆菌进行整合子I、ISCR1和常见碳青霉烯酶基因研究,并利用ERIC-PCR研究其传播机制。结果:77株菌中58株(75%)整合酶I阳性,50株(65%)整合子I阳性;48株(62%)ISCR1阳性,45株(58%)ISCR1携带qnrA1和ampR耐药基因盒;8株检出复杂性整合子I;1株检出NDM-1基因,62株(80%)检出OXA-23-like基因,4株(5%)检出OXA-58-like,OXA-51-like基因100%携带,未检出KPC和OXA-24-like基因。ERIC-PCR聚类分析60%的相似水平上被聚为16个类群。结论:整合子I、ISCR1和OXA类酶在鲍曼不动杆菌介导多重耐药方面有重要作用,ERIC-PCR是进行泛耐药鲍曼不动杆菌同源性分析的有效方法。
- 郑芬程灿灿芮勇宇
- 关键词：泛耐药鲍曼不动杆菌整合子碳青霉烯酶ERIC-PCR
