石鸥燕
- 作品数：23 被引量：47H指数：3
- 供职机构：天津医科大学基础医学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划天津市卫生局科技基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术文化科学更多>>
- 单核苷酸多态性rs4839469在分析检测脊柱裂易感性方法中的应用
- 本发明涉及一种单核苷酸多态性rs4839469在分析检测脊柱裂易感性方法中的应用，所述rs4839469为VANGLl基因多态性位点，VANGLl基因rs4839469位点的基因多态性与脊柱裂的发生密切相关。本发明首次在...
- 蔡春泉石鸥燕王春祥王东随沈永明王旖旎
- 文献传递
- 基于MATLAB的隐马尔可夫模型预测蛋白质结构类
- 2012年
- 目的准确预测蛋白质结构类，为研究其空间结构及生物功能打下基础。方法应用隐马尔可夫模型（HMM）预测蛋白质结构类，分别构建3-状态HMM和8-状态HMM。数据来源于Chou和Zhou构建的蛋白质数据集，分别包含有204条蛋白质序列和498条蛋白质序列，通过留-法预测其准确率。结果所构建的3-状态HMM和8-状态HMM对全d类的预测准确率最高，尤其是3-状态HMM的预测准确率达到95％以上。与Chou数据集相比，Zhou数据集对于全B类和α／β类的预测准确率也有所提高，同时，总体预测率也提高了2％左右；但仅＋B类的预测准确率有所下降。结论将整条蛋白质序列作为预测模型的输入信息所构建的HMM模型能有效地预测蛋白质的结构类。
- 杨惠云石鸥燕乔海晅田心
- 关键词：隐马尔可夫模型
- 中国北方汉族人群VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用与神经管缺陷的关系
- 2014年
- 目的探讨VANGL1、FZD3和FZD6基因单核苷酸多态性（SNPs）位点间的交互作用对中国北方汉族人群神经管缺陷（NTDs）患病风险的影响。方法选取VANGLI基因2个SNPs（rs4839469和rs34059106），FZD3基因2个SNPs（rs2241802和rs28639533）以及FZD6基因3个SNPs（rs827528、rs3808553和rs12549394），采用PCR扩增和测序的方法对135例NTDs患者和135例正常对照者进行基因分型，使用多因子降维法软件（MDR）分析基因-基因交互作用。结果VANGLI基因rs4839469位点基因型分布在病例组与对照组之间有差异（P〈0．05），FZD6基因rs3808553位点基因型分布在病例组与对照组之间有差异（P〈0．05）；MDR分析结果显示VANGLI、FZD3和FZD6基因交互作用存在于两位点模型（rs4839469-rs3808553）（OR=3．18，95％CI：1．85～5．44；X^2=18．39，P〈0．0001），3位点模型（rs4839469-rs2241802-rs3808553）（DR=4．17，95％CI：2．43-7．14；X2=28．5，P〈0．0001）以及4位点模型（rs4839469-rs2241802-rs827528-rs3808553）（OR=7．34，95％CI：3．98～13．54；X2=45．3，P〈0．0001）。结论VANGL1、FZD3和FZD6基因存在交互作用，并可能增加NTDs的发病风险。
- 石鸥燕蔡春泉黎小沛孙伟沈永明
- 关键词：神经管缺陷
- 应用优化的隐马尔可夫模型预测蛋白质二级结构被引量：2
- 2008年
- 针对3-状态隐马尔可夫模型(HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出了7-状态和15-状态 HMM。研究对象为 CB513数据集合中筛选出的492条蛋白质序列,将其随机均分7组。分别应用7-状态和15-状态 HMM 对以上数据集进行二级结构预测,对预测准确率进行了7-交叉验证,并将预测结果与应用3-状态 HMM 的预测结果进行了比较。结果表明,应用7-状态 HMM,Q_3准确率提高3.11%,SOV 提高6.15%,Q_E提高6.49%;应用15-状态 HMM,Q_E比7-状态 HMM 又提高5.74%。在15.状态 HMM 预测中加入序列的同源信息后,Q_3准确率比单序列15-状态 HMM 增加8.76%。结果表明,7-状态HMM 预测能力优于3-状态 HMM,15-状态 HMM 总体预测能力和7-状态 HMM 相当,但β折叠预测能力强于7-状态 HMM。
- 石鸥燕杨惠云杨晶田心
- 关键词：蛋白质二级结构预测
- 蛋白质结构预测模型的研究
- 目的：
本论文的研究目的是提出和实施了以下两个思路，提高预测蛋白质结构的准确率和效率：
1.在应用3-状态隐马尔可夫模型(HiddenMarkovModel，HMM)预测蛋白质二级结构的基础上，提出和...
- 石鸥燕
- 关键词：蛋白质二级结构预测BP神经网络
- 文献传递
- Agent技术及其在网络教学系统中的应用
- 2004年
- Agent是人工智能及计算机软件领域内的一个新兴技术．本文探讨了Agent技术以及如何把Agent技术应用于网络教学中，以提高网络教学系统的智能性．并给出了智能Agent在网络教学系统中的应用模式与实现方法．简要分析了Agent技术给网络教育带来的优点。
- 石鸥燕杨文万张菊芳
- 关键词：AGENT技术人工智能网络教学客户程序学习环境
- 叶酸代谢关键酶基因多态性与儿童神经管缺陷的相关性被引量：16
- 2016年
- 目的研究叶酸代谢通路中关键酶单核苷酸多态性（SNPs）与中国北方汉族儿童神经管缺陷（NTDs）的相关性。方法以中国北方汉族152例NTDs患儿和169例对照者为研究对象进行病例一对照研究。采用SequenomMassARRAYSNP分型技术对5个基因的16个SNPs位点进行基因分型。应用SIFT和PolyPhen程序预测评价点突变对蛋白质功能的影响。结果亚甲基四氢叶酸脱氢酶1（MTHFDl）基因rs2236225位点等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义（X2=5．292、6．080；P=0．021、0．048），且A等位基因和AA基因型携带儿童发生NTDs的风险高于G等位基因和GG基因型携带者（OR=1．500，95％CI1．061～2．120；OR=2．862，95％CI1．022～8．015）。亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因rsl801133位点等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义（X2=7．403、6．973；P=0．007、0．031），且T等位基因和，IT基因型携带儿童发生NTDs的风险高于C等位基因和cc基因型携带者（OR=1．552，95％C11．130～2．131；OR=2．344，95％C11．233—4．457）；甲硫氨酸合成酶还原酶（MTRR）基因rsl801394位点等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义（z2=6．365、6．219；P=0．012、0．045），且G等位基因和GG基因型携带儿童发生NTDs的风险高于A等位基因和AA基因型携带者（OR=1．553，95％CI1．102～2．188；OR=2．355，95％CI1．044～5．312）。MTHFR基因rsl801133和MTRR基因rsl801394的SIFT预测结果为damaging，PolyPhen预测结果为probablydamaging，均提示为有害突变。结论MTHFDI基因rs2236225、MTHFR基因rsl801133及MTRR基因rsl801394位点多态性与中国北方汉族儿童NTDs发生具有相关性，证实叶酸代谢通路中关键酶基因的变异是NTDs遗传易感性因素之一。
- 石鸥燕吴波张瑞苹张鹏王春祥沈永明马骁张庆江蔡春泉
- 关键词：神经管缺陷多态性叶酸代谢易感性
- 基于J2EE的多Agent网络教学系统的研究与实现
- 论文概要地分析了远程教学系统的发展背景、现状及未来趋势,并针对目前网络教学系统的现状,引用Agent技术,构建了一个多Agent的网络教学系统。该系统由J2EE技术支持,在一定程度上实现了个性化教学。
...
- 石鸥燕
- 关键词：网络教学AGENTJ2EE
- 文献传递
- 结合蛋白质二级结构信息预测蛋白质空间结构中的二硫键被引量：3
- 2011年
- 在蛋白质空间结构预测中,二硫键的确定可以大大减少蛋白质构象的搜索空间。为提高二硫键预测的准确率,对形成二硫键的半胱氨酸及其周围的氨基酸残基在蛋白质二级结构形成上的偏性进行了分析,并提出将蛋白质二级结构信息加入到BP神经网络预测模型的输入编码信息中。研究对象为从Swiss-Prot数据库中选取的252条蛋白质序列,随机均分四组,对预测准确率进行4交-叉验证,各项准确率均比未加入蛋白质二级结构信息前有明显提高。结果表明,结合蛋白质二级结构信息的编码方式是可行且有效的。
- 石鸥燕蔡春泉孙伟杨晶黎小沛
- 关键词：二硫键神经网络蛋白质二级结构
- 计算机文化基础课程与素质教育有机融合的教学探索被引量：1
- 2021年
- 在全面实施素质教育的背景下,计算机文化基础课程作为一门基础课,其教学目的已不再是仅仅培养大学生的计算机应用能力,而是更应该承担起素质教育的重任,引导大学生树立正确的人生观,世界观和价值观。本文以提升大学生综合素质作为切入点,探讨如何在计算机文化基础课程的教学过程中融入素质教育的方法,将素质教育引入课堂,提高大学生的整体素质。
- 杨惠云石鸥燕李洋
- 关键词：素质教育计算机文化基础课程
