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褐藻胶裂解酶的基因克隆及表达条件优化被引量：2: 2017年; 采用大肠杆菌(Escherichia coli)表达海洋弧菌(Vibrio sp.)X511的褐藻胶裂解酶基因,以实现对该酶的大量制备及酶学性质研究。通过序列分析,预测该酶的前20个氨基酸为信号肽,去除信号肽后的蛋白质分子质量约为30 254.28 Da,等电点8.75,分子式为C1368H2100N364O401S6,对应的基因序列命名为alg1987。按如下方案构建重组菌:设计特异性核酸引物,PCR扩增得到alg1987;将重组质粒p ET-30(a)-alg1987导入大肠杆菌Trans5α进行测序;提取阳性p ET-30(a)-alg1987质粒导入大肠杆菌BL21,利用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达。十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测诱导后的重组菌胞液上清,发现异源表达的褐藻胶裂解酶分子质量大小与预测值相近。对重组菌中的褐藻胶裂解酶进行表达条件优化,结果显示,最适参数为诱导温度16℃,诱导时间16 h,诱导剂IPTG浓度0.8 mmol/L。; 许超黄桂媛王巧贞卢明倩张荣灿廖威张云开黄庶识; 关键词：褐藻胶裂解酶基因克隆

植物根尖细胞离体线粒体的激光镊子拉曼光谱研究: 线粒体对维持细胞能量代谢和正常功能活动起重要作用.研究小组应用激光光镊拉曼光谱(LTRS)系统,研究水稻和蚕豆根尖细胞离体单个线粒体的RAMAN光谱特征,以及钙离子胁迫下蚕豆根尖细胞线粒体光谱的变化.结果显示,水稻和蚕豆...; 卢明倩王巧贞廖威陈丽梅黄庶识; 关键词：MITOCHONDRIA; 文献传递网络资源链接

基于比较转录组分析海洋弧菌X511的褐藻胶代谢途径: 2018年; 【目的】从北海涠洲岛海域腐烂的马尾藻中分离得到的海洋弧菌(Vibrio X511)具有较强的利用褐藻胶能力,本文利用转录组测序的方法以研究弧菌X511的褐藻胶代谢途径。【方法】采用Illumina Hi Seq2500测序平台对菌株在褐藻胶及葡萄糖培养下的转录组进行测序;比较和分析差异转录本,利用荧光定量PCR验证测序结果;采用GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)对差异转录本进行功能和Pathway注释。【结果】经比较发现,菌株在褐藻胶培养下相对于葡萄糖的培养共有2024个差异表达基因,其中1066个基因上调,958个基因下调;某些普遍存在于代谢途径中的基因在不同培养条件下也存在差异表达;海洋弧菌X511中涉及褐藻胶利用的所有基因以及合成乙醇的关键基因其转录量均有一定程度的上调;此外,通过分析发现该菌株具有独特的褐藻胶利用方式,其中的一个代谢过程尚未在弧菌中被报道。【结论】成功解析了海洋弧菌X511的褐藻胶代谢途径,丰富了生物方法降解褐藻胶的研究,为大型海藻生物质能源的研究提供有价值的数据支持。; 许超熊亚茹黄桂媛王巧贞卢明倩张荣灿廖威张云开黄庶识; 关键词：转录组荧光定量基因功能褐藻胶代谢途径

广西北部湾海域表层海水细菌多样性及其潜在生物合成基因研究被引量：2: 2022年; 本研究选取广西北部湾3处近海海域,以其表层海水作为研究对象进行细菌多样性分析,旨在挖掘潜在抗生素生物合成的菌株。选用传统稀释涂布法和基于16S rRNA基因序列的系统发育树分析海水中可培养细菌多样性,并对其基因组DNA进行抗生素生物合成基因聚酮合酶(PKS)基因、非核糖体肽合成酶(NRPS)基因及卤化酶(Halo)基因的扩增及检测。从海水中共分离到252株细菌,隶属于4门37属52种,变形菌门(Proteobacteria)是绝对优势类群(占总株数的68.25%),其后依次为放线菌门(Actinobacteria,17.06%)、厚壁菌门(Firmicutes,8.73%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,5.95%)。在属水平,假单胞菌属(Pseudomonas)、链霉菌属(Streptomyces)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)和芽孢杆菌属(Bacillus)是主要的优势类群,共占总株数的38.89%。在4种分离培养基中,2216E培养基中分离细菌的数目与种类最多(83株,37种),其多样性指数均较高。分离获得的细菌新颖性突出,10株细菌与其近缘菌株16S rRNA基因的最高相似度低于98.65%,推测其为潜在的新种。此外,22株细菌的基因组DNA均扩增出至少1种次级代谢产物合成基因。综上所述,广西北部湾海域表层海水中可培养细菌多样性丰富,新颖性突出,可对含有抗生素生物合成基因的菌株进一步开展次级代谢产物的化学研究。; 李菲苏芯莹李喆王巧贞黄庶识杨慧欢覃仙玲; 关键词：细菌多样性

海洋红球菌分离鉴定及其产油脂和色素的研究被引量：1: 2020年; 该研究从海洋环境中分离到一株橙黄色细菌,编号TH-22,经形态观察、生理生化特征和16S rRNA基因序列分析鉴定,该菌归属于赤红球菌(Rhodococcus ruber)。通过单因素实验确定菌株TH-22的培养条件,并初步研究其利用多种糖类物质产油脂和色素的潜力。结果表明,在10 g/L葡萄糖作为碳源、培养温度35℃、摇床转速150 r/min、初始pH为7.5和NaCl含量为1%的条件下发酵5 d,油脂和色素的产量最高,分别为(2.87±0.15)g/L和(3.89±0.28)mg/L。菌株TH-22能够利用多种糖类物质产油脂和色素,为进一步开发研究红球菌利用木质纤维素等生物质资源提供科学依据。; 李锋王巧贞黄德娜黄庶识; 关键词：油脂色素木质纤维素

基于多波长透射光谱对多种细菌的鉴别方法研究: 2021年; 目的基于紫外分光光度计能利用多波长透射光谱有效反应细菌的内部结构以及化学成分,对快速检测水体细菌,保护人类的生命健康具有重要意义。方法利用S1(相关系数法)、S2(相似学原理)、S3(皮尔森相关系数)、S4(余弦相似度)、S5(欧几里得距离表示的相似度)、S6(曼哈顿距离表示的相似度)6种相似度算法以及max-min归一化数据预处理方法对芦荟微球菌(Micrococcus aloe)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、球形赖氨酸芽胞杆菌(Bacillus lysine globulus)、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)、水莱茵默菌(Rheinheimera aquimaris)等5种细菌的数据进行研究;并利用S2、S5、S63种相似度较好的计算方法研究了随机样本与它相应的模板的识别率。结果S2、S5、S6、拥有2种最大值指向、3种最大值指向5种方法对5种细菌的总体识别率分别为90%、100%、90%、92%和100%。结论本文微生物的检测方法具有一定的可靠性。; 任显宗王巧贞杨玲廖威黄庶识刘军贤; 关键词：细菌数据预处理

镉胁迫下硒对罗汉果组培苗光合特性的影响被引量：3: 2013年; 实验以罗汉果组培苗为材料,室内栽培在内装市售营养土的塑料盆中,以0、10、50、100、200mg·kg-1浓度镉离子和1mg·kg-1浓度硒处理,培养20d后分析罗汉果幼苗的相关光合生理指标。结果表明:低浓度Cd2+对叶片叶绿素含量、光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)影响不大或稍有上升,但高浓度镉离子处理植株叶片的叶绿素含量、光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)明显下降;随Cd2+处理浓度的增加,叶片胞间CO2浓度(Ci)呈现上升趋势;加硒则延缓叶绿素下降,促进光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)上升,降低叶片胞间CO2浓度(Ci)。表明高浓度镉离子的毒害导致罗汉果组培苗叶片光合性能受到伤害,从而影响罗汉果幼苗生长。镉硒混合处理反映出硒对镉的毒害有缓解作用。; 石贵玉黄雅丽王巧贞韦宇静李冰; 关键词：光合特性镉硒

乙酸胁迫酵母细胞凋亡过程中单个线粒体损伤的拉曼光谱分析: 2015年; 应用激光光镊拉曼光谱技术(LTRS)作为一种非入侵分析线粒体的工具,结合氧电极法、紫外分光光度计法,研究乙酸胁迫酵母细胞后提取的线粒体,以及直接胁迫正常酵母细胞的离体线粒体的拉曼光谱。结果显示,乙酸胁迫酵母细胞后提取的线粒体的拉曼光谱,归属于核酸的谱峰(1081和1301 cm!1)、蛋白质的谱峰(872,1445,1604和1657 cm!1)、脂类的谱峰(1125,1301,1445和1657 cm!1)、Cyt c的特征峰(750和1125 cm!1)、线粒体呼吸特征峰(1604 cm!1),都随着诱导程度的加深而降低,与常规法测定的指标呼吸率,磷氧比,细胞色素C含量的降低,MDA含量的升高的变化趋势相似;乙酸直接胁迫线粒体的拉曼光谱,归属于核酸的谱峰(1081和1301 cm!1),蛋白质的谱峰(872,1445,1604和1657 cm!1),脂类的谱峰(1125,1301,1445和1657 cm!1),Cyt c的特征峰(750和1125 cm!1),线粒体呼吸特征峰(1604 cm!1),都随着诱导程度的加深而降低,与常规法测定的指标呼吸率、磷氧比、细胞色素C含量的降低,MDA含量的升高的变化趋势相似。结果表明,乙酸胁迫细胞过程中,乙酸进到细胞内可能直接作用于线粒体,引起线粒体内物质的释放,导致依赖于线粒体途径的细胞凋亡。; 李冰卢明倩王巧贞石贵玉廖威黄庶识; 关键词：拉曼光谱酵母细胞线粒体凋亡

基于傅里叶变换红外光谱的鸦胆子主要成分分析: 2024年; 基于傅里叶变换红外光谱原理方法,对不同产地鸦胆子石油醚提取物成分差异进行分析。对比分析不同产地鸦胆子红外光谱数据,其成分含量变化与9个特征峰强度的变化相关,分别是3 471、2 931、2 854、1 743、1 463、1 377、1 238、1 165、723 cm^(-1)。不同产地鸦胆子在特征峰上的含量具有明显的差异,广西玉林和广东湛江产地鸦胆子的油酸和亚油酸含量相对较高,其次为广西百色的靖西、右江,广西田林与广州,含量最低为广西柳州。; 黄敏桃刘文佳黄庶识王巧贞梁梅华朱昌叁温中林; 关键词：鸦胆子傅里叶变换红外光谱油酸亚油酸

海洋细菌ShewanellahaliotisBP-1降解褐藻酸的代谢途径及机理研究: 黄庶识何小英陈小玲刘晖赖钧灼王何健陈姗姗潘诗翰王巧贞李; “海洋细菌Shewanella haliotis BP-1降解褐藻酸的代谢途径及机理研究”是广西自然科学基金重点项目(合同编号：2014gXNSFDA118012)，由广西科学院承担完成。海藻酸是最丰富的海洋生物多糖...; 关键词：; 关键词：褐藻酸基因表达

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