段巍巍
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
- 供职机构：南京医科大学公共卫生学院生物统计学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 疾病预后研究的中介分析方法评价被引量：3
- 2017年
- 目的对用于癌症预后研究的五种中介分析方法(VanderWeele法、Baron-Kenny法、Imai法、Sobel法和InverseWeight法)进行评价,为实例分析的方法选择提供依据。方法基于模拟试验,产生不同参数设置下的模拟数据,并评价五种方法的第一类错误、检验效能和分析时间。结果除InverseWeight法在相关系数较大时第一类错误有所膨胀外,其余四种方法的第一类错误在不同参数情况下均在0.05附近。五种方法的检验效能趋势一致,均随着样本量、中介比、总效应的增大而增大,随着删失比的增大而减小。在样本量较小(N=100)且中介比不大于30%的情况下,InverseWeight法的检验效能低于另四种方法。InverseWeight法、Baron-Kenny法和Imai法的分析效率远低于VanderWeele法和Sobel法。结论综合考虑一类错误控制、检验效能及分析效率,推荐VanderWeele法进行预后研究的中介分析。
- 施倩雯魏永越李清雅段巍巍赵杨陈峰
- SMAD4基因多态性与煤工尘肺易感性
- 2010年
- 目的 探讨SMAD4基因单核苷酸多态性（SNPs）与煤工尘肺易感性的关系.方法 采用病例-对照的研究方法,选择438例煤工尘肺患者为病例组,448例同单位、同工种、工龄接近、无尘肺的煤尘接触者为对照组,进行统一的问卷调查;拍摄高仟伏X线后前位胸片;采集外周静脉血,酚-氯仿法提取DNA;根据中国人群HapMap database数据库查找SNP位点,多聚酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测SMAD4 6个SNPs位点的基因型.结果 6个SNPs位点的基因型分布频率中,仅SMAD4（rs10502913）病例组和对照组各基因型分布频率比较,差异有统计学意义（x2=6.512,P=0.038）.携带SMAD4（rs10502913）AA基因型者发生煤工尘肺的危险性明显增高（调整后OR=1.63,95%CI=1.00～2.69,P=0.05）;以是否吸烟为分层分析显示,携带SMAD4（rs10502913）AG基因型的不吸烟者发生煤工尘肺的危险性降低（调整后OR=0.54,95%CI=0.37～0.78,P＜0.01）,而携带SMAD4（rs10502913）AG、AA基因型的吸烟者发生煤工尘肺危险性均增高（AG调整后OR=1.59,95%CI=1.01～2.50,P＜0.05;AA调整后OR=2.28,95%CI=1.09～4.80,P＜0.05）;以煤工尘肺分期为分层分析显示,Ⅰ期尘肺组携带SMAD4（rs10502913）AA基因型者发生尘肺的危险性是携带GG型的2.42倍（调整后OR=2.42,95%CI=1.41～4.14,P＜0.01）.携带SMAD4（rs9304407）GG基因型者煤工尘肺患病危险性与CC基因型比较明显降低（调整后OR=0.65,95%CI=0.43～0.98,P＜0.05）;以是否吸烟为分层分析显示,不吸烟携带SMAD4（rs9304407）GC、GG基因型者发生煤工尘肺危险性明显降低（GC基因型调整后OR=0.60,95%CI=0.36～1.00,P＜0.05;GG基因型调整后OR=0.43,95%CI=0.25～0.74,P＜0.01）.结论 SMAD4（rs10502913）位点AA基因型增加了煤工尘肺的危险性,SMAD4（rs9304407）位点GG基因型可能在尘肺的发生发展中起保护性作用.
- 徐进朱猛蔡宏铨张凯段巍巍王婷王莉王莎莎叶洋倪春辉
- 关键词：尘肺单核苷酸疾病易感性
- 使用肺癌GWAS数据进行遗传风险预测的方法和策略研究被引量：5
- 2015年
- 目的探讨基于肺癌全基因组关联研究数据的遗传风险预测方法和策略。方法将肺癌GWAS数据中的南京子样本和北京子样本分别作为训练集和测试集,分别使用预测全集和最优预测子集两种策略,比较三种预测方法在不同连锁不平衡结构(LD)和初筛检验水准(α)下的预测准确度。结果 w GRS在高LD结构下,随着-log(α)增大,预测准确度呈现上升趋势;RF和SVM对LD结构不如w GRS敏感,但三种方法在低LD结构(r2<0.2)下预测准确度优于高LD结构;w GRS方法下最优预测子集效果略优于预测全集效果,SVM下子集效果与全集近似,但略逊于全集,RF下子集效果则不如全集,且差距较大。结论基于LD结构修剪SNP位点和选择适当的初筛水准可以提高遗传风险预测准确度,此时w GRS方法预测效果优于SVM和RF。
- 段巍巍赵杨张丽伟胡志斌陈峰
- 关键词：肺癌支持向量机单核苷酸多态性
