杨旭宇
- 作品数：14 被引量：51H指数：5
- 供职机构：中南大学湘雅医学院肿瘤研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- SEMA3B基因在鼻咽癌组织中的表达、杂合性丢失和甲基化分析被引量：3
- 2006年
- SEMA3B基因定位于鼻咽癌高频缺失区域3p21.3上,最近被证明具有抑瘤基因的功能.分析了鼻咽癌组织中SEMA3B基因的表达、杂合性丢失(LOH)和甲基化情况.首先应用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测了33例鼻咽癌组织和15例慢性鼻咽炎组织中SEMA3B基因的表达,结果显示75.8%(25/33)鼻咽癌组织中SEMA3B基因表达缺失或下调,显著低于慢性鼻咽炎组织中的表达(P=0.001).进一步选取3个微卫星位点D3S1568、D3S1621和D3S4597分析了20例鼻咽癌组织中SEMA3B基因LOH的情况,结果表明3个位点的丢失率分别为10%、20%和15%,总的丢失率为45%,统计分析发现LOH与基因表达之间存在明显相关(P=0.023).最后,采用甲基化特异性PCR方法分析了SEMA3B基因启动子区甲基化,结果发现在100%的鼻咽癌组织和73.3%的慢性鼻咽炎组织中检测到SEMA3B基因启动子区高甲基化.由此得出结论,SEMA3B基因在鼻咽癌组织中表达缺失或下调,LOH是引起其表达异常的原因之一.
- 易红梅任彩萍彭丹杨旭宇赵明姚开泰
- 关键词：SEMA3B鼻咽癌抑瘤基因杂合性丢失甲基化
- TSG101基因研究进展
- 2003年
- 人 TSG10 1基因是近年来发现的一个新的抑瘤基因候选者 ,定位于 11p15 .1- 15 .2 ,其编码产物TSG10 1蛋白 N端区与泛素连接酶催化区同源。近年来的研究表明 ,TSG10 1基因与多种肿瘤密切相关 ,其产物TSG10 1蛋白具有多种重要功能 ,由于其参与 HIV病毒的感染过程 ,使得研制和开发针对
- 杨旭宇姚开泰
- 关键词：肿瘤艾滋病
- DIG标记DNA探针检测noggin在爪蟾胚胎中的表达被引量：2
- 2002年
- 整体原位杂交 (Whole mountinsituhybridization)用于基因表达定位和表达分布模式的研究 ,已经成为一种非常重要的手段 .PCR方法进行探针标记 ,可以获得特异性高 ,片断大小可变的探针 .采用DIG标记 ,检测已知基因noggin在爪蟾胚胎时空分布 ,所得结果与文献报道一致 。
- 周文冯湘玲杨旭宇王磊姚开泰
- 关键词：DNA探针NOGGIN整体原位杂交
- 鼻咽癌组织中EB病毒潜伏相关基因的表达被引量：6
- 2007年
- 目的:通过检测鼻咽癌组织中EB病毒的潜伏膜蛋白LMP1的序列以及LMP1、EBNA1、EBNA2的mRNA表达来探讨EB病毒的感染状态及其表达产物与鼻咽癌的关系。方法:应用PCR法检测鼻咽癌组织中LMP1 DNA的存在,并对鼻咽癌来源的LMP1和EB病毒永生化狨猴B淋巴细胞系B95-8来源的LMP1进行测序,比较序列的差异。利用巢式RT-PCR检测鼻咽癌组织中LMP1、EBNA1、EBNA2的mRNA表达。结果:47例鼻咽癌组织均含有LMP1 DNA,所有鼻咽癌来源的LMP1 DNA与B95-8来源的LMP1 DNA序列比较均存在着多个单核苷酸变异,最明显的是XhoⅠ酶切位点的丢失。测序后显示鼻咽癌来源的LMP1DNA有30个核苷酸的丢失。巢式RT-PCR显示LMP1、EBNA1、EBNA2在鼻咽癌中的mRNA表达率分别为76.6%、80.0%和74.5%。其中EB-NA1的表达是由Qp启动的,而B95-8细胞中EBNA1的表达是由Cp启动的。结论:鼻咽癌中EB病毒的作用途径比较复杂,LMP1、EBNA1、EBNA2等潜伏期基因还有早期裂解基因BARF1均可能参与鼻咽癌的发生发展过程。
- 尹志华蒋卫红李峰杨旭宇冯湘玲姚开泰
- 关键词：鼻咽肿瘤
- 用生物信息学方法处理基因芯片结果被引量：1
- 2006年
- 基因芯片是一种能够同时检测大量基因在同一组织中表达情况的有力工具.利用前期工作筛选的2210个鼻咽癌差异表达基因和Biocarta信号通路资源库,构建了一个基于信号通路的基因相互作用网络.通过统计学分析,进一步筛选出一批对该基因相互作用网络具有重大影响的基因(特别是RAN、CEL、RELA).随后,采用RT-PCR方法检测候选基因在鼻咽癌活检组织中的表达,发现RAN和CEL基因在高达80%的鼻咽癌组织中高表达.进一步将网络分析结果和ArrayXPath软件分析的结果比较,共计有40%(32/80)基因结果吻合,这验证了网络分析方法的有效性和可行性.最终探索建立了新的分析基因芯片的方法.
- 李辉张宏波杨旭宇王磊周文任彩萍
- 关键词：鼻咽癌微阵列信号通路
- 无饲养层培养人胚胎干细胞方法的建立被引量：9
- 2005年
- 人胚胎干细胞(humanembryonicstemcell,hES细胞)是当前医学研究的热点之一.然而hES细胞培养条件苛刻,通常需要采用鼠胚胎成纤维细胞(mouseembryonicfibroblast,MEFs)饲养层来维持其未分化状态,成为目前hES细胞研究的瓶颈之一.本实验成功地将hES细胞接种在细胞外基质包被的六孔板上培养,传代20次后细胞仍然保持良好的未分化状态,各种hES细胞生物学特性(如表面标志物SSEA-3、SSEA-4、TRA-1-60和TRA-1-81,OCT-4,碱性磷酸酶及体内外分化潜能等)均无改变;其冻存、复苏效果与生长在饲养层上的hES细胞无明显差异.因此,该无饲养层培养体系可以用于培养hES细胞,并为hES细胞转基因研究及大规模培养打下良好的基础.
- 赵明任彩萍蒋星军杨旭宇张宏波单文姣周亮冯湘玲
- 关键词：人胚胎干细胞基因转染
- 不同转移能力鼻咽癌细胞间差异表达基因的筛选及功能初步研究
- 鼻咽癌(Nasopharyngealcarcinoma)是我国南方省份及东南亚高发的一种恶性肿瘤，具有明显的种族聚集性和地域性。目前普遍认为鼻咽癌是在多种因素协同作用下，经过多步骤、多阶段发生发展形成的，其发生可能与遗传...
- 杨旭宇
- 关键词：不同转移能力鼻咽癌差异表达基因消减杂交
- 文献传递
- 成人视网膜假定蛋白基因ARHP的克隆及生物信息学分析被引量：5
- 2003年
- 从UniGene库中选取编号为BG2 2 2 62 4来自人鼻咽组织的表达序列标签 (EST )序列 ,联网到NCBI调用Blast服务器分析 ,发现该EST序列是一个代表新基因的未知序列 .利用Blast检索GenBank的nr数据库和EST数据库 ,构建EST重叠群 ,联网到NCBI的ORFfinder服务器 ,分析发现该EST重叠群具有完整的阅读框架 .分别在cDNA序列阅读框架的起始密码子和终止密码子的两侧设计引物 ,以人胎脑cDNA文库为模板 ,进行PCR扩增 ,测序确定该基因的cDNA全长序列 .该基因cDNA序列全长为 1672bp ,阅读框架位于第 3 0 4～ 1557位之间 ,编码由 417个氨基酸组成 ,分子质量为 46 58ku的蛋白质 ,其理论 pI为 4 2 1.将蛋白质序列通过NCBI的Blast服务器进行序列相似性分析 ,发现该基因编码的蛋白质和成年小鼠视网膜未知蛋白 (BAB3 2 2 14 )同源 .经与国际人类基因组命名委员会协商定名为成人视网膜假定蛋白 (adultretinahypotheticalprotein ,ARHP) ,GenBank登录号为AY174896.生物信息学分析表明 ,该蛋白质可能为一参与转录调控的核蛋白 .ARHP基因定位在染色体 5q3 5,跨越 3 5163bp ,含 4个外显子和 3个内含子 .在基因的 5′非翻译区有
- 李峰蒋卫红尹志华杨旭宇冯湘玲刘卫东姚开泰
- 关键词：基因克隆生物信息学分析表达序列标签
- 鼻咽癌中TSG101基因的突变研究被引量：1
- 2002年
- 应用PCR SSCP方法对鼻咽癌中TSG101基因的编码区进行突变检测,以探讨该基因在鼻咽癌变过程中的作用.16例鼻咽癌标本中未发现TSG101基因编码区存在突变.以上结果可以初步排除TSG101基因在鼻咽癌中突变的可能.
- 杨旭宇王磊冯湘玲周文尹志华姚开泰
- 关键词：鼻咽癌突变研究
- 一种简便高效的人胚胎干细胞转染方法被引量：4
- 2004年
- 目的 :利用Fugene 6基因转染试剂建立一种简便高效的人胚胎干细胞转染方法 ,并建立稳定表达增强型绿色荧光蛋白 (enhancedgreenfluorescentprotein ,EGFP)报告基因的人胚胎干细胞系 ,为人胚胎干细胞研究提供一个非常有用的细胞模型。方法 :通过Fugene 6基因转染试剂成功地将EGFP基因转入无饲养层培养的人胚胎干细胞中 ,嘌呤霉素筛选得到稳定表达EGFP的克隆 ;利用倒置荧光显微镜和流式细胞仪检测EGFP在人胚胎干细胞中的表达情况。结果 :EGFP瞬时转染效率为 30 %～ 40 % ,稳定转染效率约 1 1 0 4～ 5,且稳定转染的人胚胎干细胞均表达EGFP。结论 :Fugene 6是一种良好的基因转染试剂 ,它可以有效地将外源基因转入人胚胎干细胞中 ,为人胚胎干细胞的转基因研究提供新的实验手段。
- 赵明尹志华蒋星军杨旭宇姚开泰任彩萍
- 关键词：人胚胎干细胞EGFP基因稳定转染流式细胞仪检测细胞研究报告基因
