杜民
- 作品数：47 被引量：140H指数：7
- 供职机构：红河学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金山东省“泰山学者”建设工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程医药卫生更多>>
- 基于Cyt b基因序列研究6种裸胸鳝属鱼类的进化关系被引量：9
- 2009年
- 为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用PCR扩增产物克隆到T载体后进行序列测定,获得黄边裸胸鳝(Gymnothorax flavimarginatus)、斑点裸胸鳝(G.meleagris)、波纹裸胸鳝(G.undulatus)、云纹裸胸鳝(G.chilospilus)、匀斑裸胸鳝(G.reevesi)5种裸胸鳝的线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)基因全序列1140bp。结合GenBank中的蠕纹裸胸鳝(G.kidako)Cyt b同源序列进行比较分析,结果表明:(1)1140个位点中共有367个核苷酸位点存在变异(32.2%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为3.223;云纹裸胸鳝和斑点裸胸鳝遗传距离差异最大,为0.226;(3)以花鳗鲡(Anguilla marmorata)为外群,采用NJ法和MP法构建系统发育树,在所分析的6种裸胸鳝属鱼类中,斑点裸胸鳝和波纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置,其余4种聚为另外一支。蠕纹裸胸鳝样本来源于日本海,其余5种裸胸鳝来源于中国南海,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异。
- 杜民齐兴柱尹绍武霍蕊张本陈国华
- 关键词：细胞色素B基因
- 半滑舌鰨养殖群体雌雄比例与自然性逆转率被引量：7
- 2013年
- 利用半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis Günther）性别连锁微卫星标记scaffold1128_343和性腺组织切片的方法,研究半滑舌鳎8个普通家系和养殖场雄性亲鱼遗传性别与性逆转情况。首先,8个普通家系（28、30、38、39、40、44、57、69）遗传性别检测结果显示,遗传雌性比例最低为39家系（37.93%）,最高为38家系和40家系（55.00%）。对其中4个家系（28、39、44、57）的两次遗传性别比例检测结果对比发现,家系间遗传雌性比例存在差异。其次,对4个家系（28、39、44、57）和养殖场雄性亲鱼的遗传与表型性别鉴定结果表明,不同家系表型雌鱼比例为18.75%~46.88%,低于各家系的遗传雌性比例,不同家系间自然性逆转率存在显著性差异（P＆lt;0.05）。研究还发现,繁育场所用的普通雄性亲鱼中平均有28.42%的伪雄鱼。本研究结果表明,自然性逆转现象在半滑舌鳎养殖群体中普遍存在,半滑舌鳎不同家系的表型雌鱼比例存在显著差异,这为培育半滑舌鳎高雌性苗种提供了理论依据。
- 梁卓陈松林张静宋文涛杜民刘姗姗胡乔木
- 关键词：半滑舌鳎养殖群体家系
- 巨魾线粒体DNA ND6基因克隆及多态性分析被引量：2
- 2016年
- 利用GenBank数据库中鮡魾科鱼线粒体ND6基因序列保守区设计引物,采用PCR技术克隆并测序,共得到12尾巨魾ND6基因全序列。用DNAMAN 5.0软件比对序列,MEGA 5.0软件分析科不同鱼类的进化关系,结果表明:巨魾ND6基因序列全长为516 bp,碱基含量分别为14.20%、34.50%、40.20%、11.00%,其中"A+T"含量(54.40%)高于"G+C"含量(45.50%),存在4个单倍型,发生3次颠换;12个个体4个单倍型间的平均相对遗传距离为0.003;将巨魾与其他14种鱼类的ND6基因用Neighbore-Joining(NJ)法构建系统发育树,发现巨魾单独聚为1支。研究将为今后鱼类线粒体基因组的研究提供科学依据。
- 牛宝珍杜民刘艳红白莉艾家灵
- 关键词：线粒体多态性系统进化
- 大菱鲆亲子鉴定的微卫星多重PCR方法
- 本发明涉及一种大菱鲆亲子鉴定的微卫星多重PCR方法，包括大菱鲆个体DNA提取、大菱鲆多态性微卫星标记筛选和引物合成、大菱鲆多重PCR体系的构建及家系和亲子鉴定。本发明建立了进行大菱鲆家系和亲子鉴定的2个多重PCR反应体系...
- 陈松林苗贵东杜民杨景峰徐营
- 基于细胞色素b基因的裸胸鳝属鱼类分子系统学研究
- 裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类隶属硬骨鱼纲(Osteichthyes)鳗鲡总目(Anguillomorpha)鳗鲡目(Anguilliformes)海鳝科(Muraenidae)，是广泛分布于热带和亚热带的岩礁鱼...
- 杜民
- 关键词：分子生物学细胞色素鳗鲡
- 文献传递
- 半滑舌鳎家系建立及其生长和抗病性能初步测定
- 本文以半滑舌鳎渤海野生群体和人工养殖群体为基础群体，建立了半滑舌鳎家系18个，其中半同胞家系6个，全同胞家系12个。对不同家系鱼苗进行荧光标记后放在同池进行生长比较研究，表明不同家系鱼苗生长速度差异显著。利用鳗弧菌感染其...
- 陈松林杜民杨景峰胡乔木徐营翟介明
- 关键词：半滑舌鳎抗病性能荧光标记
- 基于Cyt b基因序列研究中国南海裸胸鳝属鱼的进化关系
- 本研究以分布于我国南海裸胸鳝属常见的5种鱼类(黄边裸胸鳝、斑点裸胸鳝、波纹裸胸鳝、云纹裸胸鳝、匀斑裸胸鳝、蠕纹裸胸鳝)为对象，采用聚合酶链式反应将PCR扩增产物克隆到T载体后进行Cyt b基因全序列测定，并用花鳗鲡(An...
- 杜民尹绍武齐兴柱张本霍蕊陈国华
- 关键词：进化关系聚合酶链式反应
- 文献传递
- 4种裸胸鳝的分子遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析被引量：8
- 2013年
- 采用29个随机引物,对海南近海及西沙的野生群体黄边裸胸鳝(Gymnothorax flavimarginatus)、云纹裸胸鳝(Gym-nothorax chilospilus)、波纹裸胸鳝(Gymnothorax undulatus)及细斑裸胸鳝(Gymnothorax fimbriatus)的基因组DNA进行了RAPD分析,并用UPGMA法对这4种裸胸鳝进行聚类分析。研究结果表明:(1)黄边裸胸鳝、云纹裸胸鳝、波纹裸胸鳝及细斑裸胸鳝4种裸胸鳝群体内遗传多样性都较高,其多态位点比率分别为68.65%、57.00%、50.80%、67.42%,平均杂合度分别为0.222 1%、0.207 4%、0.166 6%、0.221 2%,表明南海野生裸胸鳝遗传变异水平较高,种质资源状况良好;(2)4种裸胸鳝种间遗传距离及聚类分析表明,黄边裸胸鳝与细斑裸胸鳝遗传距离最近(0.340 6);黄边裸胸鳝与云纹裸胸鳝的次之(0.386 8);云纹裸胸鳝与波纹裸胸鳝的最远(0.531 2)。(3)在7个引物中,有区分云纹裸胸鳝、波纹裸胸鳝及细斑裸胸鳝的特异性片段,可用于这些裸胸鳝的鉴定。
- 杜民尹绍武刘艳红牛宝珍齐兴柱张本廖经球霍蕊
- 关键词：分子遗传多样性亲缘关系RAPD分析
- 基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究被引量：8
- 2010年
- 采用聚合酶链式反应直接测序法,获得细斑裸胸鳝、黄纹裸胸鳝、云纹裸胸鳝、黑点裸胸鳝、褐裸胸膳5种裸胸鳝属鱼类的细胞色素氧化酶Ⅱ（cytochrome oxidaseⅡ,COⅡ）基因序列（691 bp）。结合GenBank上蠕纹裸胸鳝COⅡ同源序列,采用多个生物软件对6种裸胸鳝属鱼类序列变异和碱基组成进行分析,共发现196个核苷酸位点存在变异（28.36%）;计算了它们的相对遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,6种裸胸鳝属鱼类的序列差异为0.012~0.199,其中云纹裸胸鳝与褐裸胸鳝的序列差异最大,为0.199,细斑裸胸鳝与黄纹裸胸鳝序列的差异最小,为0.012;总体来说,序列中的转换明显多于颠换,转换和颠换的比值（Ts/Tv）为2.7;以长鳝为外群构建NJ、ME、MP系统树,长鳝分为独立的一支,6种裸胸鳝为另外一支,分为3个平行进化的分支。
- 齐兴柱尹绍武张本霍蕊杜民
- 关键词：系统进化
- 巨魾细胞色素氧化酶基因多态性及系统进化研究被引量：3
- 2016年
- 采用PCR技术克隆得到12尾巨魾(Bagarius yarrelli)的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)、细胞色素氧化酶Ⅱ(COⅡ)和细胞色素氧化酶Ⅲ(COⅢ)的基因序列。结果显示:巨魾COⅠ基因序列全长1 551 bp,12个个体共出现9个单倍型,13个突变位点;COⅡ基因序列全长691 bp,12个个体共出现5个单倍型,5个突变位点;COⅢ基因序列全长784 bp,12个个体出现7个单倍型,8个突变位点。通过最小进化法Minimum Evolution(ME)构建系统发育树分析显示,巨魾与14种鮡科鱼在序列上有一定的同源性,并且COⅠ、COⅡ和COⅢ都与中华纹胸鮡(Glyptothorax sinense)、福建纹胸鮡(Glyptothorax fukiensis)、三线纹胸鮡(Glyptothorax trilineatus)和长丝黑鮡(Gagata dolichonema)在同一个分支,表明巨魾与纹胸鮡属和黑鮡属有较近的亲缘关系。
- 杜民牛宝珍王婷婷艾加林刘艳红
- 关键词：系统发育
