李红蕾
- 作品数:10 被引量:191H指数:5
- 供职机构:中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 栉孔扇贝野生种群与养殖群体的遗传结构
- 栉孔扇贝(Chlamysfarreri)在我国主要分布在辽宁省、山东省、江苏省等沿海地区,是具有重要经济价值的海产资源。近年来,随着栉孔扇贝养殖的高密度、规模化、集约化和工厂化生产的发展,病害不断爆发流行,造成大规模死亡...
- 李俊强李红蕾宋林生
- 关键词:栉孔扇贝种群RAPD
- 栉孔扇贝不同种群的遗传结构及其杂种优势被引量:43
- 2002年
- 采用来自韩国野生的栉孔扇贝和中国养殖的栉孔扇贝以及发病区存活个体作为亲本 ,构建韩国野生×韩国野生、韩国野生×中国养殖、韩国野生×中国养殖发病区存活个体以及中国养殖×中国养殖共 4个交配组合 ,通过对F1 代个体壳宽、壳高和体重的测量 ,比较不同群体的生长情况。同时采用RAPD技术对F1 代不同群体的遗传结构进行比较 ,研究群体内的遗传变异与杂种优势的关系。结果表明 ,杂交后代具有明显的生长优势 ,说明栉孔扇贝种内不同种群之间存在杂种优势。韩国野生种群和中国养殖群体以及发病区存活群体的遗传距离分别为 0 0 3 6 6和 0 0 0 5 7,以上 4个F1 代群体的平均杂合度的理论值分别为 0 2 83、0 2 6 7、0 2 6 8和 0 2 6 6 ;多态位点比例分别为 0 76 5、0 76 0、0 76 0、0 73 5。表明栉孔扇贝不同地理种群之间存在遗传分化 。
- 李红蕾宋林生刘保忠崔朝霞相建海刘升平曲善村姜广亮
- 关键词:栉孔扇贝种群杂种优势RAPD体重
- 栉孔扇贝中分子遗传标记的研究及应用
- 利用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群和养殖群体的遗传结构及其分化进行了研究。在对20个野生栉孔扇贝和20个养殖栉孔扇贝的基因组DNA的检测中,20个随机引物共扩增出153条清晰可分辨的DNA片段,片段大小在200-30...
- 李红蕾
- 关键词:栉孔扇贝杂种优势RAPDESTS微卫星标记
- 文献传递
- AFLP和RAPD标记技术在栉孔扇贝遗传多样性研究中的应用比较被引量:18
- 2003年
- AFLP和RAPD标记技术是近年来发展最快的基于PCR基础上的两种DNA标记技术 ,本文比较了两种标记技术在我国栉孔扇贝群体遗传多样性研究中的应用。共筛选 2 0个RAPD引物和 7个AFLP引物组合 ,检测到AFLP标记的有效等位基因数和平均多态信息量稍低于RAPD标记 ,但AFLP标记在每单位分析中扩增到的野生和养殖群体的多态性条带数 ( 2 3 8,2 4 8)分别高于RAPD标记 ( 5 6,5 6) ,AFLP多态性检测效率显著高于RAPD标记。AFLP和RAPD两种标记技术所揭示的野生种群与养殖群体间的近交系数、遗传距离两项指标均表明 ,我国栉孔扇贝养殖群体和野生种群之间尚未出现明显的遗传分化。研究结果表明 :RAPD和AFLP这两种标记技术均可用于栉孔扇贝遗传多样性的分析 ,其分析结果是一致的。
- 王玲玲宋林生李红蕾胥炜李俊强常亚青
- 关键词:栉孔扇贝AFLPRAPD
- AFLP和RAPD标记技术在栉孔扇贝遗传多样性研究中的应用比较
- AFLP 和 RAPD 标记技术是近年来发展最快的基于 PCR 基础上的两种 DNA 标记技术,本文比较了两种标记技术在我国栉孔扇贝群体遗传多样性研究中的应用。共筛选20个 RAPD 引物和7个 AFLP 引物组合,检测...
- 王玲玲宋林生李红蕾胥炜李俊强常亚青
- 关键词:栉孔扇贝AFLPRAPD
- 文献传递
- 栉孔扇贝热休克蛋白70基因cDNA的克隆与分析
- 克蛋白70Heat shock protein 70,HSP70是热休克蛋白超家族中最重要的成员之一,它在机体抗逆,细胞保护以及新生肽链折叠中起着十分重要的作用。本研究应用表达序列标签法,获得了栉孔扇贝HSP70基因cD...
- 吴龙涛宋林生胥炜邱丽华李红蕾苏建国相建海
- 关键词:栉孔扇贝CDNA文库热休克蛋白基因克隆
- 用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群与养殖群体的遗传结构及其遗传分化的研究被引量:71
- 2002年
- 利用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群和养殖群体的遗传结构及其分化进行了研究。在对 2 0个野生栉孔扇贝和 2 0个养殖栉孔扇贝的基因组DNA的检测中 ,2 0个 1 0碱基的随机引物共扩增出 1 5 3条清晰可分辨的DNA片段 ,片段的长度为 2 0 0~3 0 0 0bp其中多态性片段分别为 1 1 6和 1 1 2条 ,野生种群和养殖群体的多态位点比例分别为 75 82 %和 73 47% ,杂合度分别为 0 2 7和 0 2 6。根据基因频率计算出两个群体的近交系数为 0 0 0 1 2 9,遗传距离为 0 0 2 8。栉孔扇贝野生种群的多态位点比例和杂合度处于较高水平 ,说明我国栉孔扇贝野生种群的遗传多样性水平较高 ,种质资源尚处于较好状态 ,应制定相应的渔业生产和管理措施加以保护。养殖群体的多态位点比例和杂合度都低于野生种群 ,这与人工累代养殖过程中 ,群体较小 ,近交机会增加有关。
- 宋林生李俊强李红蕾崔朝霞李成华胥炜常亚青
- 关键词:野生种群养殖群体遗传分化栉孔扇贝RAPD
- 栉孔扇贝脂多糖葡聚糖结合蛋白(LGBP)基因的克隆及其特征分析被引量:2
- 2004年
- 作为模式识别蛋白的脂多糖葡聚糖结合蛋白(Lipopolysaccharide and beta-1,3-glucan binding protein,LGBP)在无脊椎动物的免疫系统中发挥着重要作用。本研究以鳗弧菌作为病原感染栉孔扇贝,构建全个体cDNA的质粒文库,用T3引物对文库进行随机测序得到一个667bp的cDNA片段(编号:c1305ct320cn336),它与普通蚯蚓的体腔裂解因子前体基因、海胆的β-1,3-葡聚糖酶、非洲疟蚊的革兰氏阴性细菌结合蛋白等有同源性。用T7引物对该克隆测序得到其3’末端。通过SMART-RACE技术克隆得到该克隆的全长cDNA序列。栉孔扇贝LGBP基因由1850个核苷酸组成,它有一个poly A尾巴,编码一条440个氨基酸的多肽。该多肽的分子量估计为47159.076Da,等电点为5.095。推导的氨基酸序列与蓝虾、斑节对虾、海胆、非洲疟蚊、淡水螫虾、普通蚯蚓及普通红蚯蚓等无脊椎动物模式识别蛋白具有高度的同源性。经用Garnier法预测,栉孔扇贝LGBL的二级结构包含螺旋构象10%,折叠片构象17%,转角构象21%,无规则卷曲53%,各种构象所占比例与普通红蚯蚓的体腔裂解因子前体相近。
- 苏建国宋林生胥炜李红蕾吴龙涛蔡中华
- 关键词:栉孔扇贝基因克隆养殖业免疫防御
- 栉孔扇贝热休克蛋白70基因cDNA的克隆与分析被引量:19
- 2003年
- 应用表达序列标签法,获得了栉孔扇贝HSP70基因cDNA的部分序列,然后利用锚定PCR技术克隆到了该基因的全长cDNA。克隆到的HSP70 cDNA全长2553bp,编码区全长1902bp,可以编码634个氨基酸。Blast分析表明该序列与其他生物的HSP70基因具有很高的相似性。在该cDNA序列编码的氨基酸序列中含有3个HSP70家族的特征模体,结合Blast分析的结果,可以确认所获得的cDNA序列是栉孔扇贝HSP70的编码序列。该基因的克隆为进一步深入研究栉孔扇贝的抗逆机理以及指导扇贝的遗传选育和遗传改良都具有重要的理论意义。
- 吴龙涛宋林生胥炜邱丽华李红蕾苏建国相建海
- 关键词:热休克蛋白基因克隆技术病害防治
- 栉孔扇贝EST中微卫星标记的筛选被引量:60
- 2003年
- 使用RepeatMasker软件在栉孔扇贝的 6 935条ESTs中发现了 4 2条微卫星序列。选取其中的 7个序列 ,根据微卫星位点的旁侧序列设计引物 ,并对设计出的引物在中国、日本、韩国野生群体中进行多态性检测 ,发现有 6对引物能产生扩增产物 ,其中有 3对引物可望在以后的群体分析及连锁图谱的构建中加以应用。该结果初步证实了在栉孔扇贝的ESTs序列中存在微卫星位点 ,从而为扇贝生物中微卫星标记的筛选开辟了新的途径。
- 李红蕾宋林生王玲玲胥炜相建海
- 关键词:栉孔扇贝微卫星标记生物多样性环境保护