李天科
- 作品数：11 被引量：41H指数：5
- 供职机构：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所更多>>
- 发文基金：甘肃省科技重大专项计划国家肉牛牦牛产业技术体系项目甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- FASN基因与牦牛肌内脂肪酸组成的相关性研究被引量：8
- 2014年
- 为研究牦牛肌肉中脂肪酸组成特征及其形成机制,以牦牛和黄牛背最长肌为材料,利用气象色谱-质谱联用仪(GC-MS)进行脂肪酸的定性定量分析,并通过Real-time PCR技术检测FASN基因在牦牛和黄牛背最长肌中mRNA的表达水平,同时分析了其与脂肪酸组成的相关性。结果发现,牦牛背最长肌中单不饱和脂肪酸(MUFA)和多不饱和脂肪酸(PUFA)含量均极显著高于黄牛(P<0.01),而饱和脂肪酸(SFA)显著低于黄牛(P<0.05)。牦牛背最长肌中FASN基因的mRNA表达水平极显著高于黄牛(P<0.01)。牦牛FASN基因mRNA表达量只与牦牛C10:0呈极显著正相关(P<0.01),与黄牛脂肪酸组成无显著的相关性(P>0.05)。
- 秦文吴晓云李天科阎萍
- 关键词：牦牛黄牛表达量脂肪酸
- 南德温杂交肉牛生长分化因子10基因多态性与体尺性状的关联分析被引量：7
- 2014年
- 以98头南德温杂交肉牛血样为材料,随机抽样构建混合DNA池,利用高分辨率熔解曲线分析技术和直接测序法检测生长分化因子10(growth differentiation factor 10,GDF10)基因的序列变异,研究分析GDF10基因的多态性。采用SHEsis和PHASE软件对GDF10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS 17.0进行基因多态位点和单倍型组合与体尺性状关联性分析。结果显示,南德温杂交肉牛GDF10基因检测到3个多态位点1113(G/A)、9569(G/A)和9628(G/A);关联分析表明,南德温杂交肉牛GDF10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围和管围差异显著(P<0.05);单倍型分析后在群体中发现8种单倍型组合,其中AAA、GGA与南德温杂交肉牛的体高、体斜长、胸围和管围显著相关(P<0.05)。由此推断,南德温杂交肉牛GDF10基因3个多态位点和2个单倍型组合与体斜长、体高、胸围和管围显著相关,可以作为肉牛生产性状的候选分子标记,为肉牛遗传资源开发与利用提供科学依据。
- 郭宪李天科裴杰包鹏甲秦文阎萍
- 关键词：多态性单倍型体尺性状
- 甘南牦牛GDF-10基因多态与生产性状的相关性分析被引量：10
- 2014年
- 【目的】GDF-10基因又称作骨形成蛋白3b,最早通过骨形成蛋白寡聚核苷酸序列的PCR扩增所得,与骨骼的形成和发育有关。很多研究已经表明GDF-10基因在骨骼的形态变化过程中发挥着重要作用。本实验通过研究甘南牦牛GDF-10基因多态性与生产性状间的相关性,证明GDF-10基因与骨骼发育的相关性,发现与牦牛生产性状相关的分子标记,为加快牦牛选育进程,提高牦牛生产性能提供参考。【方法】以298头甘南牦牛血样为材料,随机选取其中的30个DNA样混合组成DNA池,设计9对引物对GDF-10基因外显子1,2和3进行扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶回收后测序。运用BLAST和Chromas软件通过测序峰图找出突变位点,然后采用高分辨率熔解曲线分析技术(high resolution melting curve,HRM)进行基因型分型和统计等位基因频率。采用SHEsis和PHASE软件对GDF-10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS17.0进行基因多态位点与生产性状关联性分析。【结果】检测到甘南牦牛GDF-10基因外显子3的3个多态位点12116(G/A)、12152(C/T)、和13041(T/C)。群体遗传学分析显示,3个多态位点均表现为低度多态(PIC<0.25);2检验表明牦牛群体在13041(T/C)位点未达到Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),其它两个多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);多态位点配对连锁不平衡分析发现,三个突变位点之间存在弱连锁平衡;关联分析表明,甘南牦牛GDF-10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围、体重差异显著或极显著(P<0.05或P<0.001),与管围差异不显著(P>0.05);单倍型分析后在群体中发现了7种单倍型组合,其中ATC和ATT组合与牦牛的体尺性状和体重显著相关。【结论】甘南牦牛GDF-10基因3个多态位点和两个单倍型组合与牦牛的体高、体长、体重和胸围显著相关,可以尝试作为牦牛生产性状的候选分子标记,为牦牛遗传资源的保护、开
- 李天科梁春年郎侠裴杰吴晓云褚敏秦文阎萍
- 关键词：牦牛单倍型生产性状
- 天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 采用DNA混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10(Growth differentiation factor 10,GDF-10)基因编码区的多态性,应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质特性。结果表明,天祝白牦牛生长分化因子-10基因编码区序列存在8个突变位点,其中90C→G、124C→G、1005G→A和1232G→C为错义突变,导致了编码氨基酸的改变,132T→C、822A→G、873G→T和888T→C为同义突变;天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏水性区域和跨膜螺旋区;其存在信号肽,说明可能在细胞质中发挥生物学作用;天祝白牦牛生长分化因子-10编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主;氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4%,与人、小鼠、大鼠4个物种间同源性较高。
- 李天科梁春年郎侠裴杰吴晓云刘建秦文阎萍
- 关键词：天祝白牦牛多态性生物信息学分析
- 牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析被引量：2
- 2013年
- 以牦牛的脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因为研究对象,根据GenBank收录的牛的A-FABP基因的mRNA序列设计一对特异性引物,以牦牛背最长肌为材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛A-FABP基因的CDS区,并对其进行生物信息学分析。结果表明,牦牛A-FABP基因的CDS区全长399 bp,编码132个氨基酸;其编码的蛋白属于亲水性蛋白。二级结构主要由α-螺旋、β-折叠、延伸链以及无规卷曲组成,含有11个磷酸化位点。牦牛A-FABP基因编码的氨基酸序列与黄牛和水牛的同源性最高且都为97%,与其他物种的同源性也较高,说明在进化关系上A-FABP氨基酸序列较保守,此蛋白序列具Cytosolic fatty-acid binding家族蛋白功能结构域,无信号肽。
- 秦文阎萍裴杰吴晓云李天科
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- CALCA基因遗传变异及其与肉质性状关联分析被引量：1
- 2014年
- 旨在分析早胜牛及其杂交牛CALCA基因第4外显子的多态性及其与肉质性状的相关性,发现与肉质性状相关的分子标记,为加快肉牛选育进程提供参考。利用PCR-SSCP技术对早胜牛、南杂牛、秦杂牛和西杂牛共362个个体的CALCA基因第4外显子进行了遗传变异检测,并运用SPSS 17.0软件对早胜牛(平凉类群)遗传变异与经济性状关联性进行了分析。结果表明,CALCA基因第4外显子存在2个突变位点T3237A和G3289A,并检测到AA和AB2种基因型。相关性分析表明,CALCA基因突变位点与剪切力、眼肌面积、热胴体重和熟肉率显著相关(P<0.05),AA基因型个体剪切力、热胴体重和熟肉率显著高于AB基因型个体(P<0.05),而AB基因型个体眼肌面积显著高于AA基因型个体(P<0.05),其他性状在各基因型间差异不显著。因此,初步推测CALCA基因的突变位点可以作为评定早胜牛肉质性状的遗传标记。
- 张彩霞赵生国李天科雷赵民
- 关键词：肉牛SNP肉质性状
- 高寒草甸草场牧草营养成分测定与分析被引量：6
- 2018年
- 对青海省海西州天峻县海拔在3 741~4 045 m的高寒草甸草场枯草期、青草期牧草进行主要营养成分测定及分析。结果表明,枯草期干物质(DM)含量94.60%,粗蛋白(CP)含量4.35%,粗脂肪(EE)含量0.97%,粗纤维(CF)含量28.04%,粗灰分(Ash)含量7.33%,Ca含量0.8%,P含量0.03%,无氮浸出物(NFE)含量53.91%;青草期干物质(DM)含量87.67%,粗蛋白(CP)含量5.80%,粗脂肪(EE)含量6.32%,粗纤维(CF)含量22.94%,粗灰分(Ash)含量5.90%,无氮浸出物(NFE)含量52.61%,Ca含量1.20%,P含量0.50%。枯草期粗蛋白含量比青草期粗蛋白含量损失1.45个百分点,枯牧草中粗脂肪比鲜牧草损失5.35个百分点;枯牧草中粗纤维(28.04%)显著高于鲜牧草粗纤维(22.94%)(P<0.05),枯牧草中Ca、P含量也低于鲜牧草中Ca、P含量,干物质、无氮浸出物、粗灰分的含量鲜牧草低于枯牧草。
- 扎西卓玛王宏博李桂香吴琴张玉花王成林李天科赵娟花
- 关键词：高寒草甸草场营养成分
- 盘羊PPAR-γ基因的分子特征
- 本文通过运用在线分析工具及软件对盘羊PPAR-Y基因的分子特征进行了预测。结果表明，盘羊PPAR-y蛋白由797个氨基酸组成，整个多肤链表现为亲水性。盘羊PPAR-γ蛋白二级结构以螺旋和无规则卷曲结构为主。盘羊PPAR-...
- 李天科阎萍郎侠梁春年吴晓云
- 关键词：盘羊分子特征
- 牦牛GDF-10、IHH、MC4R基因的多态与生长性状的相关性研究
- 本研究选取了3个地方牦牛品种（甘肃甘南牦牛、甘肃天祝牦牛、西藏帕里牦牛）和1个培育品种（青海大通牦牛）为研究对象，应用分子生物技术对牦牛GDF-10基因、IHH基因、MC4R基因多态性与生长性状的相关性进行研究，同时应用...
- 李天科
- 关键词：牦牛MC4R基因HRM单核甘酸多态性
- 文献传递
- 部分肉牛类群CAPN1基因第9外显子多态性及其与肉质性状的相关性被引量：3
- 2014年
- 通过研究部分肉牛类群CAPN1基因第9外显子多态性及其与肉质性状的相关性,发现与肉牛生产性状相关的分子标记,为加快肉牛选育进程,提高肉牛生产性能提供参考。采用PCR-SSCP技术对早胜牛(庆阳类群、平凉类群)、南杂牛(南德温牛×早胜牛庆阳类群)、秦杂牛(秦川牛×早胜牛平凉类群)、西杂牛(西门塔尔牛×早胜牛平凉类群)、荷斯坦奶公牛和澳洲黑牛共391头个体的CAPN1基因外显子9进行遗传变异检测,运用SPSS17.0软件分析早胜牛平凉类群遗传变异与肉质性状的关联性。结果表明,CAPN1基因第9外显子存在突变位点G458C,并检测到GG、GC和CC 3种基因型。相关性分析表明,CAPN1的G458C位点与pH、剪切力和滴水损失差异显著相关(P<0.05),CC基因型剪切力和滴水损失显著低于GG和GC型(P<0.05),其他性状在各基因型间差异不显著。因此,推测CAPN1基因的突变位点G458C可以作为牛肉嫩度的遗传标记。
- 张彩霞吴建平赵生国蔡原李天科张娟雷赵民
- 关键词：肉牛CAPN1基因SNP肉质性状
