徐鹏
- 作品数:9 被引量:20H指数:3
- 供职机构:广西医科大学更多>>
- 发文基金:广西省自然科学基金广西研究生教育创新计划项目广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>
- DNA条形码(ITS2)在葫芦科鉴定中应用价值的评估被引量:5
- 2012年
- 探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对ITS2序列作为DNA条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物ITS2序列组成的3个资料组,其中Dataset1为实验样本,Dataset2由实验样本及Gen-Bank数据库样本组合,Dataset3为从Dataset2中去除部分序列后所得。通过比较3个资料组的种间、种内的变异、Barcoding Gap及鉴定成功率,评估纳入分析的数据选择差异对ITS2鉴定能力的影响。结果显示ITS2序列在3个资料组属水平上的鉴定成功率均达到100%;种水平上,用BLAST1法鉴定成功率分别为100%、67.8%、90.6%,Nearest Distance法鉴定成功率分别为100%、52.5%、66.5%。可见纳入分析的数据选择有差异时,会导致鉴定成功率的较大变化。3个资料组中,ITS2分析仅有Dataset2的Barcoding Gap不够显著。因此对于DNA条形码分析中的数据纳入标准,值得进一步研究。
- 唐银琳刘镛姚辉陈振东吴耀生徐鹏蒋东
- 关键词:葫芦科ITS2
- 替拉扎明调节乏氧诱导鼻咽癌细胞HIF-1α和OPN mRNAs的表达及放射增敏作用的研究
- 目的:研究HNE-1EB+和CNE-1EB-人鼻咽癌细胞乏氧相关基因乏氧诱导因子1 α(HIF-1 α)和骨桥蛋白(OPN)的差异表达以及替拉扎明(TPZ)的放射增敏作用。
方法:在常氧和乏氧条件下,用MTT法测定...
- 徐鹏
- 关键词:鼻咽癌放射增敏乏氧诱导因子1Α
- 文献传递
- 替拉扎明调节乏氧诱导鼻咽癌细胞HIF—1α和OPN表达及放射增敏作用的研究
- 目的:研究HNE-1和CNE-1人鼻咽癌细胞乏氧相关基因乏氧诱导因子1α(HIF-1α)和骨桥蛋白(OPN)的差异表达以及替拉扎明(TPZ)的放射增敏作用。方法:在常氧和乏氧条件下,用MTT法测定TPZ对HNE-1和CN...
- 徐鹏黄建鸣任源查晓邓碧芳吴俊辉郎锦义
- 文献传递
- 绞股蓝RAPD标记及序列分析被引量:3
- 2010年
- 目的利用绞股蓝RAPD标记有效鉴别绞股蓝及其伪品。方法用19条引物对17个绞股蓝样品和一个乌蔹莓样品进行RAPD-PCR扩增,并对绞股蓝DNA特异条带克隆测序及序列分析。结果获得一个绞股蓝RAPD标记。经克隆测序,8个序列高度保守,片段长度在766~770 bp,相似性均在97%以上。结论获得的RAPD标记可以作为合成探针的基础,用于鉴别绞股蓝及其伪品。
- 周娟罗育吴耀生李科志徐鹏赵瑞强
- 关键词:绞股蓝RAPD标记
- 3种广西钩藤属药用植物的RAPD多态性分析被引量:3
- 2012年
- 目的运用随机扩增多态性技术探索广西钩藤属药用植物的遗传多态性,为其种质鉴定提供依据。方法采用优化的试剂盒提取法提取大叶钩藤、白钩藤、毛钩藤3种植物的总DNA。用经过筛选的18条10个碱基的随机引物进行PCR扩增。结果优化后的试剂盒提取法可有效获取3种钩藤属植物的基因组DNA,18条随机引物扩增得到条带共260条,其中多态性条带231条,多态率达到88.9%,扩增效果好。按UPGMA法进行聚类分析,计算其遗传相似系数,结果显示,5份钩藤供试材料聚为3类。结论 3种广西钩藤属药用植物的聚类结果与其种和地理区域远近一致,与形态学观察可能存在差异。所得RAPD标记可用于钩藤属药用植物的多态性研究,并为今后开发遗传鉴定的分子标记奠定基础。
- 徐鹏吴耀生黄瑞松周娟罗育李科志唐银琳刘镛
- 关键词:基因组DNARAPD多态性
- 8份广西产绞股蓝种质的RAPD引物筛选及其遗传多样性分析被引量:5
- 2010年
- 本研究的目的在于筛选合适的RAPD随机引物,应用RAPD技术对药用植物绞股蓝进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。研究结果表明,我们利用生物信息学方法挑选出的20条引物中有19条引物的扩增条带清晰且多态性好;在清晰稳定出现的354条带中,294条具有多态性;其中有3条引物的扩增条带可清楚区分绞股蓝与混淆品种乌蔹莓,可建立其DNA指纹图谱。按UPGMA法进行聚类分析,计算其遗传相似系数,结果显示,8份绞股蓝供试材料聚为两类,聚类结果与其地理区域远近和生长环境一致。本研究中筛选出的19条引物适用于绞股蓝遗传多样性分析,且获得的DNA指纹图谱可用于鉴别绞股蓝。
- 周娟罗育吴耀生李科志蒋军富徐鹏
- 关键词:绞股蓝RAPD
- 广西钩藤属药用植物的RAPD多态性和18S rDNA序列分析
- 中药钩藤为多源中药材,药典收载的原植物品种有茜草科植物钩藤Uncaria rhyncho-phylla (Miq.) Jacks、大叶钩藤Uncaria macrophylla Wall...毛钩藤Uncaria hir...
- 徐鹏
- 关键词:RAPDSCAR标记
- 文献传递网络资源链接
- 调强放射治疗致鼻咽癌放射性颞叶坏死的剂量-体积研究
- 目的:本研究通过回顾性分析研究鼻咽癌调强放射治疗(Intensity-modulated radiation therapy,IMRT)后放射性颞叶坏死(Radiation induced temporal lobe n...
- 范习刚郎锦义徐鹏王卫东任静
- 关键词:鼻咽癌调强放射治疗
- 采用随机引物组合对绞股蓝作RAPD分析及SCAR鉴定被引量:5
- 2011年
- 为寻找简单、可重复的分子鉴定方法,对绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum(Thunb.) Makino)新鲜品、药材干品及其混淆品乌蔹莓(Cayratia japonica(Thunb.) Gagnep)进行了鉴定。首先从2000余条10碱基的随机引物中筛选出20条,并以5条为1组随机分成4组,然后采用RAPD方法对7份不同来源的绞股蓝新鲜品进行扩增,对扩增得到的绞股蓝特征条带进行基因克隆、测序,分析序列特征,再设计特异性引物,最后,用绞股蓝新鲜品、药材干品及其混淆品乌蔹莓等样品进行PCR验证。结果显示:RAPD扩增能够得到7份绞股蓝新鲜品重复的共有特征条带;经基因克隆、测序并设计特异性引物后进行PCR验证,获得了绞股蓝特异序列扩增区域标志(Sequence-characterized amplified region maker,SCAR)。初步建立了区分绞股蓝及其混淆品乌蔹莓的分子鉴定标准,并首次将SCAR应用于绞股蓝分子鉴定中。
- 罗育吴耀生周娟李科志徐鹏
- 关键词:绞股蓝RAPDSCAR