张霞
- 作品数：9 被引量：97H指数：6
- 供职机构：四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：贵州省科技厅重大专项国家重点基础研究发展计划国家微生物资源平台项目更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程生物学农业科学化学工程更多>>
- 家猪长链非编码RNA的组织特异性表达及其对肉质的影响
- 2023年
- 长链非编码RNA(lncRNA)是一类无法编码蛋白且长度大于200 nt的RNA,lncRNA可参与生物体内多种调控与代谢过程,且在多种生物体内呈现出组织特异性的表达模式。然而,lncRNA在家猪Sus scrofa domestica体内的组织特异性表达模式和功能机制尚不明确。肌肉内脂肪(IMF)是影响猪肉品质的重要因素之一,IMF的沉积受多种机制的调控,而lncRNA对IMF的影响还有待深入研究。本研究利用GEO数据库中家猪RNA-seq数据,通过生物信息学方法共筛选23678个lncRNA,包括14309个新鉴定的lncRNA,其中1218个被鉴定为组织特异性lncRNA(TS lncRNA)。与mRNA相比,lncRNA具有长度较短、表达量更低和外显子数量更少等特点。通过顺式作用与反式作用分别预测了TS lncRNA的潜在作用位点,并通过GO和KEGG分析进行功能注释,发现TS lncRNA的功能总体上与其所属组织或器官的功能相关。此外,发现了潜在影响家猪IMF含量的lncRNA MSTRG.7256.5,并对其进行了RNA干扰与过表达实验,结果表明MSTRG.7256.5会影响PPARγ、SCD等PPAR通路相关的脂质调控基因的水平,并反向调控家猪的脂肪沉积。本研究为生猪养殖和肉类行业未来的研究提供了线索和参考。
- 王浩杰张珍华李琰张霞彭锐
- 关键词：家猪组织特异性
- 番茄转录因子SlWRKY53的分离及生物学功能鉴定被引量：6
- 2013年
- 构建番茄SlWRKY53的过量表达载体,通过农杆菌介导转入番茄(Solanum lycopersicum)品种Ailsa Craig(AC+),获得转基因阳性植株.定量分析显示,这些转基因株系中SlWRKY53基因表达量显著高于野生型.表型分析显示,转基因植株对盐胁迫抗性强于野生型.对抗病性进行检测,转基因植株抗性稍强,但与野生型相比无明显差异.由此推测番茄SlWRKY53基因的过量表达能够一定程度增强植株抵抗盐胁迫的能力.
- 刘畅牛向丽刘继恺唐维张霞张凝李頔刘永胜
- 关键词：番茄农杆菌介导转化抗盐
- 种胚特异性表达番茄SlABI3对水稻冈46B穗萌的抗性研究被引量：6
- 2012年
- 【目的】利用水稻胚特异表达基因OsVP1的启动子驱动与OsVP1同源的番茄SlABI3在穗萌严重的水稻保持系冈46B中表达,以增强冈46B对穗萌的抗性,进而为改良水稻穗萌抗性的分子设计育种提供理论依据。【方法】构建SlABI3的胚特异表达载体pHB-OsVP1P::SlABI3,利用根癌农杆菌介导的遗传转化法将其导入籼稻冈46B中,通过研究转基因和野生型植株的穗萌差异,验证种胚特异表达的SlABI3在穗萌抑制中的生理功能。【结果】获得了pHB-OsVP1P::SlABI3转冈46B的转基因植株;转基因植株种子的萌发速率较野生型冈46B慢,并且萌发后第8天转基因植株的苗长、根长显著(P<0.05)短于野生型冈46B;此外,在不同浓度ABA处理的试验中,随着ABA浓度的升高,转基因和野生型种子的萌发速率都呈现下降的趋势,但转基因种子的萌发速率均比野生型种子慢。【结论】SlABI3在水稻胚中特异表达能够降低种子的萌发速率并且抑制穗萌发生。
- 肖英勇高永峰唐维余进德刘亮亮张霞孟蒙刘永胜
- 关键词：水稻穗萌
- 基于中华猕猴桃“红阳”转录组序列开发EST-SSR分子标记(英文)被引量：16
- 2014年
- 为开发猕猴桃EST-SSR标记,了解28个品种猕猴桃间的遗传多样性和遗传关系,对中华猕猴桃"红阳"的转录组序列进行分析,并根据分析结果设计SSR引物.之后采用CTAB法提取28个品种猕猴桃的DNA作为SSR-PCR的扩增模板,并根据扩增结果进行聚类分析.研究中共得到包含SSR的序列21 848条,其中重复单元为单碱基、双碱基、三碱基、四碱基、五碱基和六碱基的序列分别为1 642、15 965、3 141、248、368和484条,随机选择其中46条序列设计SSR引物.根据初步的PCR扩增,筛选出32对条带较少且明亮的引物分别对28个品种猕猴桃的DNA样本进行扩增,并对引物对应的SSR序列进行定位.结果显示,32对引物对应的序列中有19条能够得到完整的所在基因、染色体以及染色体中具体位置的信息.这些引物中有26对具有多态性,共统计到等位基因120个,每对引物得到1-11个等位基因,平均3.75个.28个猕猴桃品种之间的遗传相似性系数在0.53-0.97之间,在遗传相似系数为0.72的水平上,可将它们分为5大类,分类结果与传统形态学的划分基本一致.本研究揭示的各样本间的遗传关系可为未来猕猴桃的种质改良提供依据.
- 孟蒙唐维刘嘉黄胜雄余进德刘方方林琳张霞刘永胜
- 关键词：中华猕猴桃转录组SSR种质资源
- β-甘露聚糖酶产生菌的筛选及酶学性质研究被引量：2
- 2011年
- 目的筛选产β-甘露聚糖酶的优良菌株,对其进行分类鉴定及酶学特性的研究,并对菌株产生的β-甘露聚糖酶水解魔芋精粉的产物进行分析。方法采用平板划线及摇瓶复筛的方法筛选β-甘露聚糖酶产生菌,通过在Genebank中比对菌株的16SrDNA序列进行鉴定。按照NDS法、单因子试验初步研究该酶的酶活力和酶学性质;利用薄层层析对该酶降解魔芋精粉的产物进行分析。结果筛选到2株β-甘露聚糖酶产生菌E1、B2,分别鉴定为阴沟肠杆菌属、芽孢杆菌属,酶活力分别为11.84～9.98U/ml。B2菌株产生的β-甘露聚糖酶最适温度是50℃,最适pH是6.0;该酶在30～60℃、pH6.0～7.0条件下较稳定;Fe2+,Mn2+对其有促进作用,EDTA,Zn2+,Cu2+对其有较强的抑制作用。薄层层析分析原始发酵液与浓缩发酵液显示,浓缩过程中β-甘露聚糖酶继续作用于魔芋精粉和聚合较大的葡甘露寡糖,最终产物主要是聚合度较小的葡甘露聚糖。结论 B2菌株产生的β-甘露聚糖酶具有良好的酶学性质,且降解魔芋精粉的产物主要是聚合度较小的葡甘露聚糖,在工业上有很好的应用前景。
- 武志芳张霞张胜潮张杰胡承
- 关键词：Β-甘露聚糖酶薄层层析
- 贵州浓香型白酒大曲中霉菌的18S rDNA系统发育分析被引量：29
- 2011年
- 从贵州某名酒厂大曲中分离到104株丝状真菌(霉菌),通过形态特征和生理特性检测等传统鉴定方法,初步把形态和生理生化特征一致的霉菌归类为14个大类群;并采用18S rDNA序列分析,进一步把菌株归类为MJ-Ⅰ至MJ-Ⅴ五个类群,随后构建系统发育树.结果表明,样品中的霉菌以曲霉属(Aspergillus)为主,占总分离菌数的40.38%;犁头霉属(Absidia)也占有相当的比例,达到31.73%;还有16.35%的假埃希氏菌属(Pseudallescheria)、6.73%的茎点霉属(Phoma)以及4.80%的拟青霉属(Paecilomyces).其中,假埃希氏菌属菌株在相似生态环境中还未见公开报道.MJ-Ⅰ菌群的代表菌株MJ-10与烟曲霉(Aspergillus fumigatus)的相似度达到了99%,MJ-Ⅴ菌群的代表菌株MJ-11与伞枝犁头霉(Absidia corymbifera)的相似度达到100%,表明菌株MJ-10和菌株MJ-11已经鉴定到了种.研究表明,在生态环境有差异的情况下,大曲中微生物的多样性既有相似性,也有所差异,这是贵州浓香型白酒区别于其他地方浓香型白酒的一个重要原因,同时也为贵州浓香型白酒的个性化和品质提升提供了理论依据.
- 张霞武志芳张胜潮胡承张文学
- 关键词：丝状真菌大曲系统发育分析
- 贵州浓香型白酒窖池可培养细菌系统发育分析被引量：17
- 2010年
- 从贵州某名酒厂浓香型白酒窖泥和酒醅中分离到477株细菌,通过形态特征和生理特性检测等传统方法鉴定,发现绝大多数为芽孢杆菌(446株),占总细菌株数的93.50%,将形态和生理生化特征一致的芽孢杆菌归类为XJ-1～XJ-20二十大类群。并采用16S rDNA序列分析和测序,构建系统发育树。结果表明,芽孢杆菌属菌株中,以地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)为主,占总芽孢杆菌数的32.96%;枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)和栗褐芽孢杆菌(Bacillus badius)也占有相当的比例,还有一定数量的Bacillus niabensis和巴达维亚芽孢杆菌(Bacillus bataviensis)以及少量的球状芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)和不确定种芽孢杆菌(Bacillus sp.)。除芽孢杆菌属菌株之外,还分离出极少量的短短芽孢杆菌属(Brevibacillus)的不确定种菌株,占已分离总芽孢杆菌数的1.57%。表明贵州地区浓香型白酒窖池中微生物具有明显的多样性,且地衣芽孢杆菌为其明显的优势种群,这和四川境内酒厂中的微生物类群相似,但也有区别。
- 张霞武志芳张胜潮胡承张文学
- 关键词：窖泥酒醅RDNA序列系统发育分析
- 细菌纤维素高产菌株的筛选及鉴定被引量：12
- 2010年
- 以残次的水果为原料,经静置富集培养、多次筛选纯化等步骤,分离出一株细菌纤维素产量较高且遗传性能稳定的菌株G-29。根据第二版《伯杰系统细菌学手册》和第九版《伯杰氏细菌鉴定手册》,对该菌株进行形态、生理生化特征和16SrDNA分子序列分析。初步鉴定该菌为葡糖醋杆菌属(Gluconacetobactersp.)一个新菌种或者中间葡糖醋杆菌(Gluconacetobacter intermedius)的一个亚种。菌株G-29已保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCCNO:M208234。
- 曹海鹏袁帅赵昆张霞胡承
- 关键词：细菌纤维素生理生化特征
- 新型生物材料细菌纤维素的研究进展被引量：12
- 2010年
- 细菌纤维素是一种天然的生物高分子聚合物,具有独特的理化、机械性能,如高持水性,高杨氏模量,很好的机械强度,很好的生物相容性,因此成为一种很有前景的应用材料。本文主要综述了细菌纤维素在各方面的用途及研究现状。
- 武志芳张霞易彬沈才洪胡承
- 关键词：细菌纤维素仿生矿化
