张金耀
- 作品数：7 被引量：17H指数：2
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- 发文基金：国家科技基础性工作专项福建省高校产学合作科技重大项目福建省高等学校科技项目更多>>
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- 鸭PRLR基因拷贝数的变异
- 2016年
- 本研究以台湾褐色菜鸭为试验动物,采用荧光定量PCR技术,使用2-ΔΔCt换算法对PRLR基因拷贝数进行定量,分析了其多态性与台湾褐色菜鸭生产性能的相关性.结果表明,PRLR和Ldh-B标准曲线的R2分别为0.991和0.990,扩增效率分别为111.68%和108.429%,斜率分别为-3.070和-3.135,PRLR和Ldh-B的扩增效率近似一致,可通过2-ΔΔCt方法对PRLR基因进行定量分析.在94羽台湾褐色菜鸭的样品中共检测到5种拷贝数(1、2、3、4、5)变异类型,拷贝数变异与台湾褐色菜鸭的蛋壳厚度和蛋形指数显著相关(P<0.05),拷贝数为2的个体蛋壳厚度显著高于拷贝数为1和5的个体;拷贝数为3的个体蛋形指数显著低于拷贝数为1、2和4的个体;其余性状均无显著相关(P>0.05).因此,PRLR基因拷贝变异区域可能影响蛋壳厚度和蛋形指数.
- 叶炎汪稳张金耀黄守婷钟志新周世业肖天放
- 关键词：拷贝数变异多态性PRLR基因
- 槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释被引量：7
- 2016年
- 为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.
- 杨建敏胡宇平林威敏张金耀黄守婷叶鼎承肖天放
- 关键词：槐猪杜洛克猪背最长肌转录组测序
- 莆田黑猪DNA甲基化差异研究
- 本研究采用MSAP技术检测莆田黑猪不同生长发育阶段不同组织基因组甲基化模式，并应用 BSP技术分析莆田黑猪、杜洛克猪及其与莆田黑猪杂种杜莆猪的不同组织H-FABP基因启动子甲基化状态，旨在为地方猪选育和猪脂肪沉积的分子育...
- 张金耀
- 关键词：DNA甲基化莆田黑猪分子育种
- 鸭微卫星标记的筛选及其遗传多样性分析被引量：1
- 2014年
- 采用磁珠富集法从AFLP片段中筛选微卫星标记,并对5个福建地方鸭品种的遗传多样性进行检测。基因组DNA用EcoRⅠ/MseⅠ内切酶酶切的同时与接头连接,酶切连接产物与用生物素标记的探针杂交,应用磁珠捕获100~2000bp含有微卫星序列的DNA片段并通过pGEM-T载体转化到大肠杆菌DH5a感受态细胞中,构建富集微卫星序列的基因组文库。随机挑选46个阳性克隆,测序获得14条含有微卫星的DNA序列并递交到GenBank（登录号：FJ599499~FJ599512）。设计合成14对微卫星引物,通过PCR优化从中选择5对引物用于5个福建地方鸭品种的遗传多样性分析。结果显示,5对微卫星引物共检测到31个等位基因,各微卫星基因座的有效等位基因数为1.969 7~2.834 4,多态信息含量和杂合度的平均值分别为0.5133和0.7480,遗传多样性丰富,说明磁珠富集法适合用于鸭微卫星标记的分离与筛选,筛选得到的5个微卫星位点可作为有效的遗传标记用于福建省地方鸭品种遗传多样性的研究。
- 黄守婷叶炎何桂娟杨建敏张金耀雷祖建肖天放
- 关键词：磁珠富集微卫星
- 莆田黑猪A-FABP基因的群体遗传结构分析被引量：2
- 2015年
- 为了研究莆田黑猪脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因的群体遗传结构,试验采用PCRRFLP技术对112头莆田黑猪A-FABP基因的多态性进行检测。结果表明:在A-FABP基因BsmⅠ酶切位点检测到多态性,由2个等位基因控制,定义为B和b,存在3种基因型,即BB、Bb和bb,BB基因型出现的频率较高,基因型频率为0.696 4,B为优势等位基因,基因频率为0.803 6。群体遗传分析结果表明,A-FABP-BsmⅠ位点属于中度多态。卡方检验结果表明,A-FABP-BsmⅠ位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。
- 张金耀杨建敏叶炎黄守婷何桂娟彭辉肖天放
- 关键词：PCR-RFLP基因多态性莆田黑猪
- 非参数检验在畜牧生产中的应用及其SPSS实现被引量：2
- 2013年
- 两样本的比较问题在畜牧生产实践中经常遇到。解决该问题常用的检验方法是U检验、t检验等参数检验方法。但是,在实际应用中,由于各种原因所处理的数据并不满足U检验或t检验的条件,因此采用非参数检验方法来解决该类问题更有效。结合实例,本文阐述了两独立样本的Mann-Whitney非参数检验原理及其使用SPSS软件在畜牧生产中的具体应用。
- 黄守婷何桂娟王景伟叶炎张金耀
- 关键词：SPSS软件
- 莆田黑猪不同组织DNA甲基化的MSAP分析被引量：2
- 2017年
- 为研究莆田黑猪不同组织间基因组DNA甲基化水平差异及各组织甲基化水平在不同生长发育阶段之间的变化规律,采用甲基化敏感扩增片段多态性(MSAP)方法检测了1、25和210日龄莆田黑猪的心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾6个组织基因组DNA的甲基化水平.结果表明:心脏和肝脏组织的甲基化水平随日龄增长呈下降趋势,且日龄间的甲基化水平差异显著(P<0.05);25日龄肌肉组织的甲基化水平与1日龄的差异不显著(P>0.05),但显著高于210日龄(P<0.05);25日龄脂肪和耳组织的甲基化水平显著高于1和210日龄(P<0.05);3个日龄间尾组织的甲基化水平差异不显著(P>0.05);3个日龄的肝脏与脂肪组织之间、肝脏与耳组织之间的甲基化水平均存在显著差异(P<0.05),表明DNA甲基化在肝脏与脂肪组织之间、肝脏与耳组织之间存在组织特异性.
- 胡宇平张金耀林瑞意林威敏陈静汪稳肖天放
- 关键词：DNA甲基化莆田黑猪
