张梦晖
- 作品数：12 被引量：46H指数：4
- 供职机构：上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科委国际合作基金上海市科技兴农重点攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 人头皮微生物与相关头皮疾病的研究进展
- 2021年
- 近年来基于DNA测序和分子生物学技术的研究表明,头皮微生物特别是主要细菌和真菌与头皮生理指标、免疫状态、屏障功能等相关并且影响头皮健康。人头皮屑、脂溢性皮炎、斑秃、头皮型银屑病等头皮疾病常伴随微生物失衡。针对关键微生物及其相互平衡的干预可缓解或治疗疾病。本文总结了头皮微生物特别是细菌和真菌的研究概况、头皮微生物与头皮疾病,比较了目前的实验室研究方法,为头皮健康的维护、头皮产品开发和实验室研究方法提供参考。
- 杨芳李雪静马英鑫张萌萌张梦晖张延
- 关键词：DNA测序
- 土壤微生物在不同纤维素富集条件下的多样性被引量：8
- 2007年
- 应用PCR-DGGE分子技术并结合聚类分析、主成分分析(PCA)等统计分析方法,对土壤微生物在几种不同的纤维素富集培养条件下的多样性进行分析。结果发现,不同的纤维素富集培养条件对土壤微生物的多样性有不同程度的影响:CMC和PCS两种培养基在50℃时所回收的土壤微生物的菌群结构和组成比较相似;纤维素富集培养基(J培养基)同CMC两种培养基所回收的土壤微生物菌群结构和组成却有很大的差异;50℃条件下所回收的土壤微生物其菌群结构和组成同28℃、37℃两个温度相比也相差较大。这一结果表明,组合不同的纤维素富集培养条件,结合分子和统计分析,可以对土壤样品在不同纤维素富集培养条件下微生物的多样性进行检测和评估,同时还可以为分离目标菌时富集培养条件的选择提供很有价值的参考。
- 张晶张晓君张梦晖陈小云赵立平
- 关键词：土壤微生物DGGE聚类分析
- 利用荧光标记酶切基因进行微生物群落结构分析的方法
- 一种生物技术领域的利用荧光标记酶切基因进行微生物群落结构分析的方法，包括如下步骤：提取样本的基因组总DNA，扩增微生物系统发育标记基因；利用限制性内切酶对扩增得到的标记基因进行酶切，得到带有粘性末端的限制性片段；对所有限...
- 赵立平王婷婷张晓君张梦晖
- 文献传递
- 以废水处理样品微生物元基因组序列拼接细菌基因组的方法
- 本发明公开了一种以废水处理样品微生物元基因组序列拼接细菌基因组的方法，所述方法包括如下步骤：步骤一，获得样品的元基因组序列；步骤二，根据群落结构信息确定优势细菌的分类地位；步骤三，依据优势细菌的相似菌的参考基因组序列，从...
- 张晓君吴国军王芸姚翔宇张梦晖
- 文献传递
- 二甲肼诱发大鼠大肠癌癌前病变模型的肠道双歧杆菌数量研究被引量：3
- 2007年
- 目的:探讨二甲肼(DMH)诱发的大肠癌癌前病变模型大鼠的肠道内双歧杆菌数量与大肠癌癌前病变的关系。方法:应用双歧杆菌属特异性引物实时定量PCR,对实验第3与第9周8只模型组大鼠以及同年龄的7只正常对照组大鼠肠道中的双歧杆菌数量进行检测。结果:第9周的正常对照组大鼠未见明显异常隐窝灶(aberrant crypts foci,ACF),同年龄的模型组平均每只大鼠大肠可形成(37.7±2.6)个ACF。第3周正常对照组与同年龄的模型组大鼠肠道双歧杆菌数量差异无统计学意义,P=0.652;第9周模型组大鼠肠道双歧杆菌数量低于同年龄的正常对照组,但差异无统计学意义,P=0.090。结论:肠道内双歧杆菌的数量与大鼠大肠癌癌前病变没有明显相关性。
- 魏华张昕张晨虹王婷婷董立吴大正张梦晖庞小燕赵立平
- 阴沟肠杆菌B29菌株脂多糖合成基因(waaL,waaG)缺失突变株的构建及分析被引量：6
- 2014年
- 脂多糖(LPS)在革兰氏阴性细菌中的功能作用在不同菌株中已有研究,但尚未有对肠杆菌属LPS结构与功能的报道。本研究试图构建能引起肥胖的阴沟肠杆菌B29菌株waaL和waaG基因的缺失突变株,以了解突变体菌株产生的LPS结构与活性与野生菌株产生的LPS的差异。根据同源重组技术原理,利用广宿主自杀性质粒构建成敲除载体pKNG101△waaL和pKNG101△waaG,转化E.coli SM10菌株,并与B29菌株进行双亲杂交,再以抗生素和蔗糖筛选条件筛选waaL和waaG基因缺失突变株;利用多重PCR、ERICPCR、PCR-DGGE、DNA测序结果均证实突变株B29△waaL和B29△waaG构建成功;最后,对野生菌株B29与两个突变株生物学特性的差异进行了比较。银染实验结果表明野生型B29菌株的脂多糖为光滑型结构,突变株的LPS结构明显缺失O抗原,B29△waaG突变株同时还缺失了外部核心部分;用鲎试剂法检测LPS的内毒素活性显示,突变株的内毒素活性与野生型相比有较大幅度下降;B29△waaL突变株的生长速率与野生型相当,而B29△waaG突变株的生长速率则相对降低。本研究成功构建两种内毒素活性下降的突变株,为下一步利用突变株研究B29菌株在肥胖发生中的机制奠定基础。
- 王金星费娜王睿瑞吴国军张梦晖赵立平张晓君
- 关键词：阴沟肠杆菌脂多糖
- 油藏样本潜在核心功能微生物群的宏基因组挖掘
- 2021年
- 【背景】识别出具有驱油功能的内源性微生物群是当前设计高效微生物采油技术的迫切需求。【目的】通过宏基因组分析找出原位油藏微生物中具有产酸/产气功能的潜在核心微生物群。【方法】利用室内模拟体系,对原位油藏微生物进行有机营养(从有氧到无氧)的激活,运用生物信息、多元统计分析以及网络分析等方法,寻找潜在内源性核心功能微生物群。【结果】有机营养激活了原位油藏样本中以Bacillus licheniformis为核心的产酸菌群(包括Coprothermobacter proteolyticus、Marinobacterspp.、Anaerobaculumhydrogeniformans和Petrotogamobilis),该菌群具有以丙酮酸/乙酰辅酶A为原料发酵乳酸、乙酸以及甲酸的功能;激活了以Enterococcus faecium为核心的产气菌群(包括Shinella zoogloeoides、Paracoccus denitrificans、Paracoccus spp.和Enterobacter cloacae),该菌群具备以(亚)硝酸盐、(亚)硫酸盐、石油烃为原料生产含氮/硫/碳等气体的能力。2个核心菌群内部分菌同时具有产酸和产气通路基因,激活过程中2个菌群的丰度变化呈负相关关系。【结论】利用有机营养激活体系及宏基因组测序分析技术,筛选出了油藏样本中具备产酸、产气能力的核心功能菌群,为后续进一步的功能菌株研究提供了潜在靶标及功能指向。
- 李志华隋维康向宝玉胡婧曹功泽吴晓灵林军章孙刚正张晓君张梦晖
- 关键词：宏基因组
- ERIC-PCR指纹图谱技术分析糖尿病小鼠肠道细菌群落变化被引量：14
- 2007年
- 目的通过比较1型糖尿病模型组和空白对照组雄性小鼠肠道菌群结构的变化,探索糖尿病造模与肠道菌群的关系。方法收集造模2周后空白对照组(n=5)、STZ造模成功组(n=5)和造模不成功组(n=3)ICR小鼠的新鲜粪便样品,提取粪便样品的总DNA,ERIC-PCR扩增形成DNA指纹图谱,借助多变量统计分析方法研究各组样品肠道菌群结构上的异同。结果ERIC-PCR指纹图谱结合偏最小二乘法(PLS-DA)分析表明造模成功组和造模不成功组小鼠的肠道菌群结构显著区别于空白对照组,而造模不成功组小鼠的肠道菌群结构与造模成功组仍有一定的区别。结论STZ诱导的1型糖尿病会造成小鼠的肠道菌群结构的变化,而部分小鼠造模失败可能与这些小鼠的肠道菌群结构有关。
- 徐灵筠赵琴丽庞小燕张梦晖倪艳徐朝晖贾伟赵立平
- 关键词：STZERIC-PCR偏最小二乘法
- 胆管结扎对大鼠肠道双歧杆菌组成的影响被引量：3
- 2007年
- 目的分析胆管结扎对SD大鼠肠道双歧杆菌菌群结构组成的影响。方法采集手术前3 d和手术后2周5只模型组和5只对照组大鼠的粪便样品,提取粪便样品中微生物的混合DNA进行双歧杆菌类群特异性PCR-DGGE,结合主成分分析技术比较2组大鼠在手术前后肠道内双歧杆菌结构组成的变化。结果DGGE图谱及其主成分分析表明手术后对照组和模型组大鼠肠道双歧杆菌菌群的结构组成明显不同,主要表现在假长双歧杆菌的数量在模型组显著增加,而动物双歧杆菌却明显减少。结论胆管结扎导致SD大鼠肠道双歧杆菌结构发生异常变化。
- 赵琴丽龙爱华刘平庞小燕张梦晖张延赵立平
- 关键词：胆管结扎双歧杆菌DGGE
- 利用荧光标记酶切基因进行微生物群落结构分析的方法
- 一种生物技术领域的利用荧光标记酶切基因进行微生物群落结构分析的方法，包括如下步骤：提取样本的基因组总DNA，扩增微生物系统发育标记基因；利用限制性内切酶对扩增得到的标记基因进行酶切，得到带有粘性末端的限制性片段；对所有限...
- 赵立平王婷婷张晓君张梦晖
- 文献传递
