常怀普
- 作品数:21 被引量:93H指数:7
- 供职机构:西南大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划四川省应用基础研究计划项目国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学文化科学理学更多>>
- 五指山猪IGF2基因5'调控区单核苷酸多态性分析被引量:12
- 2007年
- 利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、梅山猪和大白猪共60个样本的IGF2基因5'调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究。找到13个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T、C6164T、G13520A、G13563A和G13669A。T6029A为T←→A碱基颠换,A5976G、G13520A、G13563A和G13669A为A←→G转换,其他均为C←→T转换。针对13个SNP位点得到23种组合基因型。统计各位点等位基因和基因型以及各组合基因型在总群体与各品种内的分布频率,发现3个小型猪在A5976G、C6164T和G13669A位点上的优势等位基因均分别为G、T和A,而梅山猪和大白猪的优势等位基因均分别为A、C和G;H19型为3个小型猪的特征组合基因型,而另两个猪品种为H15型。同时对123头五指山猪IGF2基因C5888T位点进行了PCR-RFLP分析,研究表明该位点C为优势等位基因(0.8536),CC为优势基因型(0.7235)。卡方检验表明该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。这些结果可为五指山猪等小型猪的生长发育规律、矮小机制等方面的研究提供遗传学依据。
- 常怀普欧江涛钟金城王希龙郭春华宾石玉马志杰
- 关键词:五指山猪IGF2基因SNP
- 五指山猪IGF2基因5'调控区的单核苷酸多态性分析
- 利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、梅山猪和大白猪共60 个样本的IGF2基因5’调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究。结果找到13个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6...
- 常怀普欧江涛钟金城王希龙郭春华宾石玉马志杰
- 文献传递
- 海南地方猪品种种质分子特性研究
- 王希龙欧江涛黄礼光王峰郑心力郭春华黄丽丽常怀普林凯文钟金城林莉李小成王苏何凯
- 该项目测定了海南地方猪种的品种内遗传变异和品种间遗传距离;研究了五指山猪的内源性逆转录病毒基因及其表达情况;测定分析了五指山猪、海南猪、贵州香猪和滇南小耳猪GH基因全序列;克隆了五指山猪SLA基因的全长cDNA,并对五指...
- 关键词:
- 关键词:品种资源
- 五指山猪IGF2基因部分片段的SNP研究
- 海南五指山猪(Wuzhishan Pig)是我国小型猪种中体型最小、体重最轻、濒临灭绝的珍稀畜种,其解剖学、生理学特征及疾病发生机理等都与人类极其相似,具有重要的经济和社会价值。胰岛素样生长因子2(Insulin-lik...
- 常怀普钟金城欧江涛王希龙
- 关键词:五指山猪IGF2基因SNP
- 文献传递
- 五指山猪等5个猪品种IGF2基因部分序列的SNP分析
- 利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、大白猪和梅山猪共 60个样本的胰岛素样生长因子2基因5’调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究。结果找到10个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A597...
- 常怀普欧江涛王希龙钟金城郭春华马志杰罗虹
- 关键词:五指山猪IGF2基因单核苷酸多态性
- 文献传递
- 大额牛HSL基因外显子Ⅰ部分片段的序列测定及分析被引量:7
- 2007年
- 对大额牛HSL基因外显子Ⅰ部分序列进行PCR扩增、测序及氨基酸预测,并同其它牛种的资料进行了比对分析,构建了分子系统进化树。结果表明:大额牛其核苷酸序列与牦牛、普通牛、瘤牛、水牛间的同源性分别为99.6%、99.4%、99.2%、97.0%。相应的氨基酸序列大额牛与水牛的同源性为97.6%;与普通牛、瘤牛、牦牛的同源性均为99.4%,仅在第33位有1个氨基酸变异,即大额牛为异亮氨酸,而其它3个牛种均为缬氨酸,这是由该基因片段的第97位碱基发生转换(A←→G)造成的。从分子系统进化树看,瘤牛和普通牛先聚为一类,再依次与牦牛、大额牛、水牛相聚,这与传统的牛种分类结果一致。
- 常怀普钟金城陈智华胡汉傈马志杰李子良杨蓉生陈玉红张亚美
- 关键词:大额牛
- 家蚕丝腺因子SGF-1的基因克隆及序列结构和表达特征与亚细胞定位被引量:3
- 2016年
- Fox类转录因子在细胞生长、增殖、分化和胚胎发育等过程中发挥重要功能,SGF-1是家蚕丝腺细胞转录因子,属于Fox类转录因子家族。家蚕SGF-1(BGIBMGA005101-TA)基因位于第25号染色体nscaf2823:112743~113792(+strand),含有1个外显子,CDS全长1 050 bp,编码349个氨基酸。家蚕品种大造5龄第3天幼虫的基因芯片表达谱显示,SGF-1基因在大多数组织中有表达,在丝腺中高量表达,其中在前部和中部丝腺的表达量略高于后部丝腺,在雄蚕中的表达量略高于雌蚕。氨基酸组成分析显示,SGF-1蛋白富含脯氨酸、丝氨酸、丙氨酸和亮氨酸,且多数为亲水性氨基酸。序列结构分析表明,SGF-1包含典型的Forkhead结构域,其两端分别为Forkhead_N末端结构域和HNF3_C末端结构域,其中大多数氨基酸残基形成了无规则卷曲结构,α-螺旋与β-折叠结构分别约占18.0%和0.6%。从家蚕后部丝腺克隆了SGF-1基因,并构建麦芽糖结合蛋白标签融合表达载体,表达并纯化了重组SGF-1蛋白。通过RT-PCR与Western blotting检测分别从基因转录水平和蛋白质表达水平上证实,SGF-1在家蚕5龄第3天幼虫丝腺中高量表达。亚细胞定位实验显示SGF-1定位于细胞核中。这些结果为深入研究SGF-1的结构和功能提供了有益的基础信息。
- 王叶菁刘莉娜高春雁李珍珍常怀普赵萍何华伟
- 关键词:家蚕基因克隆表达谱亚细胞定位
- 生命科学实验教学体系改革研究与实践被引量:2
- 2008年
- 以提高学生的科研创新能力为目标,以生命现象从微观到宏观为线索,构建全新的生命科学实验教学体系。文章对生命科学实验教学体系构建的指导思想、建设内容、建设成果等方面进行了详细的阐述,以期能为高校实验教学改革提供一定参考和借鉴。
- 谢洁刘劲常怀普左伟东徐水
- 关键词:生命科学实验教学体系
- 端粒及其研究进展被引量:1
- 2006年
- 端粒是真核生物染色体末端的一种特殊结构,由端粒DNA和端粒相关蛋白组成,它能维持染色体的结构稳定和功能,保护其免受核酸酶降解,防止其末端融合或重排等。端粒长度的维持机制主要有ALT机制和TA机制。端粒长度的维持以及端粒酶的利用在衰老的控制中起重要作用。本文在系统论述端粒的结构、端粒的维持机制以及端粒与衰老的关系等研究进展的基础上,就当前该研究领域中存在的问题提出了个人的观点。
- 常怀普马志杰钟金城
- 关键词:端粒端粒酶衰老
- 牦牛心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因的克隆及序列分析被引量:21
- 2006年
- 目的对牦牛H-FABP基因进行克隆和序列分析,以期为进一步开展牦牛该基因与其肉质性状的相关分析,进行分子标记辅助选择以及基因定位、表达等研究提供理论基础。方法用特定引物对牦牛H-FABP基因进行PCR扩增并进行T-A克隆和测序,在此基础上使用RepeatMasker、DNAMAN4.0、BioEdit4.8.10、ClustalW1.81等生物信息学软件进行序列分析。结果牦牛H-FABP基因(已在NCBI上登录,登录号为DQ026674)由4个外显子和3个内含子组成,CDS序列全长为402bp,前体氨基酸数为133个。4个外显子大小分别为73bp、173bp、102bp和54bp;3个内含子大小分别为3460bp、1892bp和1495bp;外显子与内含子的连接区序列遵循通常的基因组成规律。外显子和内含子个数与普通牛、绵羊、山羊、猪、人、大鼠、小鼠、鸡、斑马鱼各物种相同。牦牛H-FABP基因序列中,重复序列所占比率为13.07%。内含子Ⅰ含有5个重复元件,包括1个SINE/Artiodactyls元件、1个SINE/MIR3元件、1个SINE/Bov-tA1元件和2个SINE/MIR元件;内含子Ⅱ无重复元件;内含子Ⅲ有3个重复元件,其中SINE/MIR元件、LINE/L2元件、SINE/Artiodactyls元件各1个。SINEs短重复序列所占比率为11.85%,哺乳动物分散性重复序列MIRs比率为6.44%。LINEs所占比率为1.22%,小于SINEs元件。其中,LINE1、BovB/Art2、L3/CR1重复元件以及LTR类反转录元件和DNA转座子元件在牦牛该基因区域中不存在。不同物种间在该基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列上有较高的保守性。牦牛与普通牛、绵羊、山羊、猪、人、大鼠、小鼠、鸡、斑马鱼各物种在H-FABP基因编码区核苷酸序列上同源性大小分别为99.8%、97.8%、97.0%、92.8%、88.8%、83.3%、83.1%、76.4%、68.7%;相应的氨基酸序列间同源性大小为100%、96.9%、96.9%、92.4%、88.7%、85.7%、85.7%、77.4%、69.9%。结论牦牛H-FABP基因由4个外显子和3个内含子组成,其中外显子I、外显子Ⅱ、外显子Ⅲ和�
- 钟金城马志杰陈智华字向东常怀普刘盛纲
- 关键词:牦牛H-FABP基因克隆