巨韩芳 作品数:36 被引量:184 H指数:9 供职机构: 天津市结核病控制中心 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 天津市科委资助项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 哲学宗教 更多>>
天津市监狱羁押人群结核病患者分离菌株的分子流行病学研究 2021年 目的研究天津地区监狱流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)菌株的主要基因型,菌株间的进化关系以及结核病在监狱羁押人员中传播的主要模式。方法选取天津市结核病控制中心参比实验室菌株库中保存的2013年1月至2016年6月来自天津市监狱管理局羁押人员不同结核病患者痰标本中分离培养的124株MTB菌株,采用多重PCR试验检测菌株基因组中RD105差异区域的缺失情况以鉴定北京基因型MTB;使用15个VNTR位点对菌株开展基因分型研究,根据菌株的成簇情况评估天津地区监狱羁押人员结核病近期传播的水平。结果天津监狱结核病患者分离培养的124株MTB菌株中,北京基因型MTB为116株,占全部分析菌株的93.5%。全部124株MTB菌株的VNTR基因分型显示93株(75.0%)为基因分型同簇株,共形成了18个基因分型簇,其中最大的分型簇由25株北京基因型MTB组成,其余的31株MTB为基因分型独特型。基因分型数据经最小生成树算法分析显示,124株MTB被分为3个基因型。其中116株北京基因型MTB组成了其中的1个基因型;8株非北京基因型菌株中,3株MTB和5株MTB分别组成另外2个基因型。结论天津监狱羁押人员中,北京基因型MTB传播的最为广泛,是绝对优势菌株。基因分型表明近期传播(外源性感染)是MTB在监狱羁押人群中传播的主要模式。 赵慧 谢彤 王春花 巨韩芳 孙蕊 李旭关键词:分子流行病学 可变数目串联重复序列 监狱 116株结核分枝杆菌链霉素耐药菌株rspL和rrs基因突变特征研究 被引量:5 2010年 谢彤 李桂莲 巨韩芳 赵德福 赵慧 穆成 王撷秀关键词:耐药菌株 链霉素 结核分枝杆菌 突变特征 氨基糖苷类抗生素 RPSL基因 天津市监狱羁押人员中结核病患者临床分离菌株的基因型分析 2019年 为揭示结核分枝杆菌(MTB)北京基因型菌株中基于差异区域(RD)多态性形成的各个进化分支在天津监狱羁押人员中的流行情况,笔者收集2013年1月至2016年6月从天津市监狱羁押人员结核病患者痰标本中分离培养获得的124株MTB菌株进行基因型分析。结果发现,124株菌株中经鉴定为北京基因型者有116株(93.5%)。116株北京基因型菌株中,96株(82.8%)为北京基因型现代株,20株(17.2%)为北京基因型古代株。基于大片段多态性分析,北京基因型MTB分为4个进化分支。20株北京基因型古代株中有7株(6.0%)为RD181(+)菌株,13株(11.2%)为RD181(-)菌株;96株北京基因型现代株中,95株(81.9%)为RD150(+)菌株,仅1株(0.9%)为RD150(-)菌株。北京基因型MTB的各个进化分支中,RD150(+)北京基因型现代株在监狱中传播流行最为广泛。结果提示需加强RD150(+)北京基因型现代株在天津监狱羁押人员中流行的监测工作。 谢彤 王春花 赵慧 巨韩芳 穆成 王志锐 孙蕊关键词:基因测定 基因型 囚犯 结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究 被引量:5 2018年 目的揭示结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)北京基因型菌株的进化路径,在进化过程中产生的各个进化分支,以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株,首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207(RD207)的缺失情况,以鉴定收集的菌株是否为北京基因型;然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况,以及菌株基因组NTF(noise transfer function)区中插入序列6110(IS6110)的存在情况。结果567株临床分离的MTB菌株中,517株(91.2%)为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中,447株(86.5%)为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株;70株(13.5%)为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析,北京基因型菌株被分为5个亚型,其中RD181(+)的北京基因型菌株为22株(4.3%),且全部为北京基因型古代株。RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的北京基因型古代株分别为41株(7.9%)和7株(1.4%)。447株现代菌株中,RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的分别为404株(78.1%)和43株(8.3%)。结论MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株;北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支,其中RD181(-)/RD150(+)的北京基因型现代株为主要的流行分支。 谢彤 孙蕊 巨韩芳 王春花 穆成 王志锐 赵慧关键词:基因型 基因缺失 生物进化 天津地区结核病患者耐药情况分析 目的掌握天津地区2015年结核病患者耐药情况,为制定耐药结核病防治策略提供基础数据支持。方法收集2015年天津地区所有培养阳性患者菌株,采用比例法药物敏感性试验分析不同来源患者菌株链霉素(SM)、异烟肼(INH)、利福平... 王春花 巨韩芳 孙蕊 王志锐 赵慧 傅衍勇关键词:结核分枝杆菌 耐药 文献传递 四种分枝杆菌培养方法的应用评价 目的评价改良罗氏培养基、BACTEC MGIT 960系统、液体培养荧光判读仪判读和液体培养紫外灯箱判读四种分枝杆菌培养方法的优劣。方法对疑似肺结核病人的痰标本进行直接涂片,萋-尼氏染色,顺序选取100份阳性和100份阴... 赵慧 穆成 谢彤 巨韩芳 赵德福药物外排泵基因表达与结核分枝杆菌耐药关系的探讨 被引量:12 2011年 目的 探讨MTB药物外排泵基因的表达与耐药表型、耐药相关基因突变型的关系.方法 从2007年天津市结核病控制中心参比室库存菌株中选择对异烟肼、利福平、链霉素和乙胺丁醇联合或单一耐药的全部耐药MTB菌株45株及对以上4种药物全敏感的MTB菌株26株(全敏组).采用直接测序法检测异烟肼耐药相关基因katG、inhA、oxyR-ahpC、ndh,利福平耐药相关基因rpoB,链霉素耐药相关基因rpsL、rrs和乙胺丁醇耐药相关基因embB、embC、embA的突变情况.提取菌株RNA后逆转录并采用real-time PCR方法检测药物外排泵基因Rv1410c、Rv2136c、Rv0783c和Rv1819c的表达量,并用方差分析和t检验的方法分析药物外排泵基因表达量在不同菌株耐药表型、耐药相关基因突变型菌株中的差异.结果 Rv1410c表达量在耐链霉素组[(8.48±6.33)×10-5],耐异烟肼组[(8.43±6.38)×10-5],耐利福平组[(9.59±7.27)×10-5],耐多药组[(10.37±7.86)×10-5],耐异烟肼+链霉素组[(9.39±6.81)×10-5],均高于全敏组表达量[(5.67±3.29)×10-5],差异有统计学意义(t′值分别为2.18、2.20、2.29、2.34、2.43,P均〈0.05).Rv2136c表达量在耐异烟肼组[(3.51±2.43)×10-5],耐多药组[(4.21±2.94)×10-5],耐异烟肼+链霉素组[(3.81±2.46)×10-5]均高于全敏组表达量[(2.50±1.44)×10-5],差异有统计学意义(t′值分别为2.03、2.22、2.28,P均〈0.05).rpoB 531突变型菌株Rv0783c的表达量[(5.41±3.03)×10-6]高于野生型耐利福平菌株[(2.29±1.62)×10-6],差异有统计学意义(t′=2.81,P〈0.05).结论 Rv1410c和Rv2136c表达量高低与MTB对多种药物耐药有关,Rv0783c的高表达与利福平耐药株rpoB 531位密码子突变可能相关. 李桂莲 王撷秀 谢彤 巨韩芳 赵慧 穆成 赵德福关键词:分枝杆菌 细菌 细菌蛋白质类 膜转运蛋白质类 ATP结合匣式转运子 直接涂片法与沉淀涂片法检测结果评价 目的直接痰涂片法具有简便、快速和廉价特点,当天出结果,但敏感性低,通常需5000~10000菌/ml才能够得到阳性结果。就直接涂片法与离心沉淀涂片法检测结果进行比较分析,评价离心沉淀涂片法在筛查涂阳肺结核患者的应用价值。... 吴振萍 穆成 巨韩芳 谢彤 赵德福关键词:涂片方法 文献传递 基于可变数目串联重复序列分型方法的结核分子流行病学研究 目的:初步探讨15个可变数目串联重复(Variable Number Tandem Repeat,VNTR)位点在天津地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)中的多态性、天津地区的... 巨韩芳关键词:结核分枝杆菌 基因分型 分子流行病学 文献传递 利用可变数目串联重复序列基因分型方法鉴定结核分枝杆菌混合感染 目的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis MTB)的基因分型研究证实了肺结核患者可以同时感染2株或2株以上的 MTB。该研究目的是评估由12个 VNTR 位点组成的结核分枝杆菌散在分布重复单... 赵德福 谢彤 巨韩芳 吴振萍 王撷秀文献传递