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孙富林: 作品数：11 被引量：60H指数：4; 供职机构：中国科学院南海海洋研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目广东省科技计划工业攻关项目更多>>; 相关领域：生物学天文地球农业科学环境科学与工程更多>>

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长毛对虾海水养殖环境以及虾肠道微生物群落结构研究被引量：24: 2014年; 为了研究长毛对虾养殖环境以及对虾肠道微生物种群结构的特征,实验分别采集养殖区进水口水体、养殖池底泥、养殖池水体以及长毛对虾肠道样品,采用构建16S rRNA基因克隆文库的方法对不同样品间的微生物群落组成进行了研究。结果表明,4组样品中共获得621条序列,操作分类单元(OTU)总数达212个,表明养殖环境微生物群落结构具有高度的多样性。从遗传进化树分析发现,进水口水体中细菌优势种群为蓝细菌(53.97%)、α-变形杆菌(13.76%)和γ-变形杆菌(10.58%);养殖池水体细菌优势种群为蓝细菌(33.55%)、γ-变形杆菌(14.84%)、厚壁菌(14.19%)、拟杆菌(12.26%)和α-变形杆菌(9.68%);养殖池底泥细菌优势种群大部分属于厚壁细菌(79.12%);对虾肠道细菌优势种群为厚壁细菌(75.79%)、梭杆菌(13.68%)和γ-变形杆菌(10.53%)。在目分类水平上,养殖池底泥、养殖池水体和对虾肠道中芽孢杆菌占有较高的比例,分别占克隆数的69.78%、13.55%和72.63%;进水口水体和养殖池水体中红细菌的比例较高,分别占克隆数的10.05%和9.68%。本研究分析了养殖环境以及对虾肠道微生物的群落结构,揭示微生物从水源到对虾肠道内的演替规律。总体上,本养殖系统微生物群落结构良好,但在养殖池水体和对虾肠道中也检测到黄杆菌类群和少量的弧菌。本研究有助于了解养殖环境对于对虾肠道微生物组成的影响,并为长毛对虾病害的预防提供参考。; 王春忠林国荣严涛郑志鹏欧清峰陈斌孙富林; 关键词：长毛对虾细菌群落

珠江口水体浮游细菌种群多样性空间分布特征被引量：1: 2011年; 为认识珠江口水体浮游细菌的多样性分布规律,运用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和多维尺度分析(MDS)的方法,研究了春季珠江口十个站位表底水层浮游细菌种群16S rRNA基因多样性特征。研究结果表明,珠江口浮游细菌种群具有丰富的基因多样性;不同站位细菌群落结构和优势种群变化显著:大多数站位表底层细菌群落结构比较相似,河口外站位(A12,A14和C5),表底层细菌群落结构差异性较大:多样性分析表明A14,B6和C5站位底层细菌多样性大于表层。遗传发育分析表明,序列归属于变形细菌(Proteobacteria),酸杆菌(Acidobacteria),蓝细菌(Cyanobacteria),厚壁细菌(Firmicutes)和放线菌(Actinobacteria)。变形细菌(Proteobacteria)种类最多,从河口内淡水区到河口外海水区都有大量分布,是珠江口水域占优势的菌群;同时也检测到种类丰富的放线菌(Actinobacteria)的存在,也是珠江口水域的优势菌群。; 孙富林王友绍; 关键词：珠江口细菌群落结构 PCR-DGGE 多维尺度分析

一种基于快速气液平衡装置的二氧化碳分压精确测量系统: 本发明公开了一种基于快速气液平衡装置的二氧化碳分压精确测量系统，用于精确测量海水二氧化碳分压，包括测量系统、快速气液平衡装置、气瓶、控制电脑和基于NDIR技术的二氧化碳测量仪；所述快速气液平衡装置、气瓶、二氧化碳测量仪均...; 许占堂施震李伟孙富林张纪龙周雯杨泽明李彩

一种新型手持水下二氧化碳气体测量仪: 本发明公开了一种新型手持水下二氧化碳气体测量仪，包括气液分离装置、具有伸缩性能的伸缩单元、控制单元和检测单元；气液分离装置由内而外依次设有气体室、气液分离层和液体通道，气液分离层为透气不透水的分离层；气液分离装置的壳体设...; 李伟施震李骏旻许占堂孙富林张纪龙周雯杨泽明李彩

湛江特呈岛红树植物群落结构特征被引量：4: 2010年; 2008年6月，采用样方调查法对湛江特呈岛红树植物群落结构及白骨壤（Avicennia marina）的种群特征进行了全面调查。结果表明：该地区红树林是白骨壤纯林以及白骨壤为主，有红海榄（Rhizophorastylosa）、木榄（Bruguieragymnorrhiza）和桐花树（Aegicerascorniculatum）的混交林。白骨壤在潮滩上连续分布，红海榄、木榄和桐花树生长于近陆林缘及潮滩的中部，物种多样性指数由陆缘向海缘呈降低趋势。通过分析白骨壤种群的株高、地径在潮滩上的变化规律得出年幼的个体聚集于近陆林缘，近海林缘较少。白骨壤种群的年龄结构为增长型，但是根据生境条件及白骨壤种群在海滩上的分布格局，分析得出该红树林资源处于退化的状态。; 李楠王友绍林立孙翠慈吴梅林宋晖王玉图崔海平孙富林邓超彭亚兰; 关键词：白骨壤红树植物群落结构

海水混养池塘虾蛤肠道与养殖环境的微生物多样性被引量：12: 2018年; 【背景】海水混养池塘环境微生物以及动物肠道微生物的群落结构已有研究,但对混养环境中多品种动物肠道与环境微生物群落的关系尚未见报道。【目的】研究海水虾蛤混养环境中微生物多样性以及与养殖动物健康之间的关系。【方法】采用Illumina高通量测序技术测定冬季莆田市北江养殖区2个混养池塘中水体、底泥以及虾蛤肠道的菌群结构。【结果】同一池塘水体与底泥之间、不同池塘水体或底泥之间的微生物结构存在一定的差异;同一养殖区2个混养池塘虾与蛤肠道微生物结构之间具有极高的相似性,与养殖环境存在显著的差异。微生物多样性和丰富度差异很大,表现出底泥>水体>肠道;虾蛤肠道微生物以厚壁细菌和γ-变形细菌为主;池塘水体以放线菌、α-变形细菌以及拟杆菌为主,底泥以γ-变形细菌和δ-变形细菌为主。养殖动物肠道微生物主要优势种为乳球菌属和假单胞菌属,池塘环境内存在较高丰度的黄杆菌类潜在致病菌,而在虾和蛤的肠道中基本未检出。2个池塘底泥硫还原细菌含量较高,增加了底质产生硫化氢等有害物质的风险。【结论】比较混养池塘中水体、底泥以及虾蛤肠道三者之间微生物群落结构的差异,揭示虾、贝混养模式微生物与养殖环境的关系,为池塘养殖虾、贝疾病防治和混养结构的优化提供参考。; 林国荣王春忠孙富林郑志鹏; 关键词：细菌群落对虾

生态学理论与技术创新引领我国热带、亚热带海洋生态研究与保护被引量：4: 2019年; 中国科学院大亚湾海洋生物综合实验站在30余年长期生态监测与研究的基础上,揭示了核电站温排水不会影响大亚湾生态系统的变化趋势,解决了国际上有关核电站温排水对生态系统影响与否的长期争论,推动交叉新学科"计量海洋生态学"的发展;阐明了南海区域海洋生物种群多样性与生产机制,推动了生物海洋学发展;揭示了台风、海啸等引发的突发性藻华过程的三维结构与生消规律,拓展了遥感技术在海洋生态学研究中的应用;揭示了红树林氧化酶系统、II型金属硫蛋白和CBF/DREB2等基因抗逆境分子生态学机制,引领了国际红树林分子生态学研究;提高了我国海洋生态保护和生物资源利用技术的研究水平,推动了我国海洋生态保护与海洋生物高技术产业跨越发展。该站研究成果奠定了我国热带、亚热带海域生态系统演变过程与规律的理论基础,在国内外产生了重要影响,为我国海洋生态环境保护与生物资源可持续发展提供了重要的理论基础和技术支撑。; 王友绍孙翠慈王玉图宋星宇孙丽华孙富林; 关键词：海洋生态系统

南海海滩岩微生物群落结构和特定菌株对其成因机制的启示: 2024年; 热带—亚热带潮间带沉积物中丰富的菌—藻类微生物及其复杂的生命活动对颗粒的早期胶结过程起重要作用。本文通过16S r RNA高通量基因测序方法分析西沙群岛石屿、全富岛及海南龙湾珊瑚礁滨岸带海滩岩表生微生物群落结构,确定主导海滩岩快速胶结的共性菌株/微生物功能群。表层生长草皮海藻的全富岛海滩岩原核生物多样性最高。龙湾潮间带上部暴露时间较长的海滩岩比潮间带下部海滩岩原核生物多样性高。相对固结的石屿海滩岩原核生物多样性最低。4个取样点具有较为相似的细菌门类组成,物种丰度由大到小依次为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteriota)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、芽单胞菌门(Gemmatimonadota)和脱硫杆菌门(Desulfobacterota)。不同点位的海滩岩形成环境中蓝细菌主要种类大体相同,其中眉藻(Calothrixsp.)是主导海滩岩早期胶结的共性钙化菌株,通过分泌胞外聚合物成为碳酸盐矿物沉淀的“热点”。群落中检出的反硝化细菌和硫酸盐还原菌表明海滩岩内部氧化还原梯度较大,表面下极浅处即存在缺氧微环境。微生物群落内强烈的光合作用、硫酸盐还原作用和反硝化作用不断提高微环境pH值,有利碳酸盐矿物在粒间孔内的成核和生长并加速颗粒胶结。; 刘玓玓张喜洋孙富林王明壮谭飞施祺王冠王冠; 关键词：原核生物群落结构蓝细菌海滩岩

基于浒苔暴发海水池塘的微生物生态特征研究被引量：8: 2017年; 为研究浒苔对海水养殖环境微生物生态的影响,采用Illumia高通量测序技术测定冬季垦区进水区、浒苔暴发的池塘和排水区水体以及底泥中菌群结构,分析进水区、池塘养殖区和排水区的环境微生物结构演变过程。结果表明:(1)γ-变形细菌、α-变形细菌、放线菌、拟杆菌和δ-变形细菌为海水养殖区的优势细菌门类;(2)进水区水体和底泥微生物种类和多样性指数均高于浒苔池塘和排水区;浒苔暴发的池塘和排水区微生物群落结构较为相似;(3)浒苔池塘的水体微生物以异养细菌为主,底泥以脱硫杆菌等厌氧细菌为主,增加了底泥潜在产生硫化氢的危害;(4)进水区水体含有丰度较高的弧菌和鱼立克次氏体等条件致病性病原菌,而浒苔池塘中含量较低,说明浒苔对弧菌等有一定的抑制作用;但浒苔暴发的池塘和排水区中另一种潜在致病菌黄杆菌类的丰度较高,养殖品种务必防患此类病菌感染疾病的发生。本文从微生态学角度全面揭示浒苔对近岸海区、海水池塘和排水区微生态演变过程的影响,发现了浒苔具有抑制和增加不同致病菌的双重作用,这对水产养殖有一定指导,也为浒苔发生原因、预报、预防等研究提供一定理论参考。; 王春忠孙富林侯代云肖懿哲林国荣严涛; 关键词：细菌群落弧菌黄杆菌

一种收集微表层水样的玻璃平板采样器及其采样方法: 本发明公开了一种收集微表层水样的玻璃平板采样器，包括玻璃平板和固定采样支架；固定采样支架包括外框支架、第一玻璃刮条、第一塑料板、中部隔板、收集水样瓶、固定隔板、第二玻璃刮条和第二塑料板；第一塑料板和第二塑料板分别设置在外...; 孙翠慈王友绍岳维忠孙富林; 文献传递

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