吴波
- 作品数:14 被引量:65H指数:5
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- 发文基金:广东省科技计划工业攻关项目国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目更多>>
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- 应用抑制性差减杂交技术筛选锦橙CTV应答基因被引量:1
- 2013年
- 【目的】探讨易感柑橘衰退病病毒(Citrus tristeza virus,CTV)品种锦橙CTV应答分子机理,筛选和分析CTV应答基因。【方法】以嫁接CTV强毒株TRL514的锦橙阳性材料叶片为试验方(Tester),用嫁接无毒枝条的CTV阴性锦橙叶片为驱动方(Driver),构建CTV侵染的锦橙的正向差减文库。【结果】随机挑选850个阳性克隆测序,其中742条测序成功,去除载体片段和接头序列后得到有效EST 692条。将所有EST序列对应到柑橘的预测基因组转录物,共涉及137个柑橘基因。应用BLAST2GO对这些特异性表达的基因进行功能归类和KEGG分析。结果表明,受CTV侵染的影响,锦橙能量代谢相关基因上调明显,与光合器官碳固定、氮代谢、淀粉和蔗糖代谢等途径相关的EST出现频率较高。另外,与抗逆防御以及苯基丙氨酸合成、类苯基丙烷代谢、类胡萝卜素合成等与植物防御素类物质合成密切相关的代谢途径相关基因较多。【结论】由于CTV的侵染,CTV易感品种锦橙基础代谢改变明显,须通过增强能量代谢和提高自身防御能力来维持自身生长和发育。
- 程春振曾继吾贝学军吴波阳佳位张永艳姜波朱世平闫树堂钟云钟广炎
- 关键词:柑橘差异表达基因CTV
- NPR1和Defensin双价抗病基因过量表达载体构建及其对沙田柚的遗传转化被引量:1
- 2017年
- 通过PCR技术,从克里曼丁橘和荔枝品种"三月红"叶片中克隆获得了NPR1和Defensin基因序列.以p BI-121作为载体骨架,构建了NPR1和Defensin双价抗病基因过量表达载体,命名为ND-p BI121.通过根癌农杆菌介导的遗传转化,获得了6株PCR检测为阳性的双抗沙田柚植株,为探究NPR1和Defensin基因的过量表达对柑橘黄龙病的抗性影响提供试材.
- 穆一帆钟广炎高峰钟云胡敏伦闫化学姜波吴波
- 关键词:抗病基因柑橘黄龙病沙田柚
- 紫外线照射对梁平柚果皮基因表达的影响被引量:7
- 2011年
- 采用SSH技术以紫外照射的梁平柚[Citrus grandis(L.)Osbeck]果皮作为实验方(tester),以未被照射的正常果皮作为驱动方(driver),构建了一个梁平柚果皮紫外诱导基因的正向差减文库。经菌液PCR检测后随机挑取200个阳性克隆测序,获得168条表达序列标签(ESTs)。比对这168条ESTs,发现有分属于57个基因的114条ESTs与已知基因高度同源,54条ESTs同源性较低或没有同源性。功能分析发现,这些ESTs主要参与抗逆防御、生长发育、细胞凋亡、转录与翻译、细胞分化、信号传导、能量代谢、糖类及氨基酸代谢以及次生代谢等。
- 程春振朱世平吴波阳佳位贝学军马岩岩钟广炎
- 关键词:柑橘紫外辐射抑制性差减杂交
- 枳感染柑橘衰退病病毒后的应答基因分析被引量:3
- 2013年
- 枳(Poncirus trifoliata L.)高抗柑橘衰退病病毒(Citrus tristeza virus,CTV),但相关抗性机理仍不为人所知。以嫁接健康枝条的无毒枳作为对照,用Affymetrix柑橘基因芯片分析了感染CTV后枳叶片中基因的表达变化情况。结果共检测到表达量差异倍数≥2的基因295个,其中216个表达上调,79个表达下调。BLAST2GO分析发现,差异表达的基因中与抗逆反应相关的基因最多,乙烯、茉莉酸、赤霉素、脱落酸、生长素、水杨酸等植物激素代谢和调节相关基因为数不少,一些编码细胞壁形成或组分相关蛋白的基因差异表达明显。本研究可为揭示枳抗CTV的机理提供了转录组学线索。
- 程春振钟云吴波阳佳位贝学军姜波朱世平闫树堂张永艳曾继吾钟广炎
- 利用SNP分子标记分析鉴定不同形态的化橘红(Citrus grandis var.tomentosa)单株被引量:7
- 2015年
- 【目的】在对比化橘红不同品种形态特征的基础上,利用SNP(Single nucleotide polymorphism)分子标记分析其遗传差异,以期获得能准确鉴定化橘红不同品种的有效方法。【方法】依据叶片及果实茸毛特征,从不同果园采集9个代表性的化橘红单株,分别对果实及叶片进行测定。采用14个SNP位点,结合高分辨率熔解曲线分型(High resolution melting analysis,HRMA)技术对供试材料进行遗传多样性分析。【结果】同一采样地‘光青’单株8和9,仅叶片宽度存在显著差异,果实及叶片的其他特性差异不明显;同一采样地单株样4(‘正毛’)与样7(‘副毛’)的叶形指数及果形指数差异不显著,但叶片及果实的其他特性差异显著;同一果园不同品种的单株叶片及果实部分特性差异不显著。不同果园的同一品种单株,因栽培条件及管理等方面的差异,叶片及果实的部分特征存在显著差异。采用14个SNP位点可将9个化橘红样本有效区分,平均PIC(Polymorphism information content)值为0.29,所有SNP位点的平均自交系数为-0.09。【结论】仅凭形态特征很难区分化橘红不同品种的单株,而采用14个SNP位点能有效鉴定化橘红不同品种的单株。
- 姜波钟云吴波李菊钟广炎曾继吾
- 关键词:化橘红单核苷酸多态性
- 常德市鼎城区稻纵卷叶螟发生规律与防治技术的初步研究
- 稻纵卷叶螟Cnaphalocrocis medinalis (Guenée),属鳞翅目(Lepidoptera),螟蛾科(Pyralidae),是一种具有季节性远距离迁飞习性重大害虫,在我国经常暴发成灾,给水稻生产带来了...
- 吴波
- 关键词:稻纵卷叶螟
- 文献传递
- 宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型被引量:16
- 2012年
- 高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRM)可以检测单碱基改变引起的DNA双链熔解温度(Tm)值变化,从而可以对样本在单核苷酸多态性分子标记(Single nucleotide polymor-phism,SNP)上进行基因分型。通过分析NCBI数据库中宽皮柑橘的表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)数据鉴别SNP位点,并用小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型技术(High resolution melting analysis of small amplicons)分析11个宽皮柑橘(Citrus reticulata)品种以及柳橙(Citrus sinensis Osbeck var.‘Liucheng’)的5个SNP位点的基因型。结果显示,小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型可以快速、清楚地分辨纯合与杂合基因型,在校正温度差异后也可以很好地分辨同一个SNP位点不同的纯合型。统计分析表明样本在所有SNP位点上均存在多态性,5个SNP位点的平均多态性信息含量(PIC)为0.3190,显示样本在这组SNP位点上具有较高的杂合率。
- 吴波杨润婷朱世平钟云姜波曾继吾钟广炎
- 关键词:宽皮柑橘高分辨率熔解曲线单核苷酸多态性基因分型
- 外源NO诱导下MAPK基因在采后柑橘果实抗绿霉病中的表达分析被引量:3
- 2018年
- 一氧化氮(NO)是植物逆境响应的重要信号分子,能够诱导激活丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)的活性。为了分析外源NO诱导下MAPK基因在采后柑橘果实抗绿霉病中的表达情况,以埃及糖橙(Citrus Sinensis)果实为材料,使用硝普钠(SNP)溶液处理果实,统计接种柑橘绿霉病菌后果实的发病率和病斑面积,荧光定量PCR检测果实中MAPK基因的相对表达量和变化趋势。结果表明:外源NO能够降低试验期间柑橘果实绿霉病的发病率;果皮中MAPK基因的表达受外源NO诱导;CsMAP1、CsMAP15和CsMAP13-like基因在NO处理1 h即受诱导表达,CsMAP、CsMAP9、CsMAP9-like、CsMAP13-like、CsMAP19-like和CsMAP20-like在NO处理4 h达到表达高峰,CsMAP4-like、CsMAP7和CsMAPNTF3在NO处理12 h达到表达高峰,CsMAP1、CsMAP15、CsMAPMMK1和CsMAPMMK2分别在NO处理4 h和12 h有两个表达高峰。说明外源NO提高了柑橘果实对绿霉病的抗性,果皮中MAPK基因的诱导表达可能在抗病中发挥作用。
- 王苗苗王苗苗于杰钟云姜波吴波
- 关键词:抗病反应一氧化氮柑橘果实
- 套袋对不知火果实品质和果皮类胡萝卜素代谢的影响被引量:10
- 2017年
- 为研究套袋对不知火果实品质和类胡萝卜素代谢的影响,选用生产上常用的外黄内黑双层纸袋对不知火果实进行套袋处理,以不套袋为对照.果实品质相关指标测定结果表明:不知火果实套袋后果实单质量增加,可滴定酸和可溶性固形物质量分数降低,Vc质量浓度、出汁率和可食率变化不大.利用HPLC检测对套袋和未套袋果实果皮紫黄质、9-z-紫黄质、β-隐黄质、a-胡萝卜素、β-胡萝卜素和八氢番茄红素质量比进行了测定,发现套袋果实果皮中这些类胡萝卜素类物质质量比均低于未套袋果实.利用实时荧光定量PCR研究了套袋对果皮CRTISO,LCYb,LCYe,PDS,PSY,ZDS和ZEP基因表达的影响,发现:套袋不知火果皮中这些基因的表达均显著低于未套袋果实.该研究结果表明:套袋可提高不知火外观品质,对不知火果实质量的增加具有一定的促进作用,同时,套袋使不知火果实风味下降.此外,该研究发现套袋还显著降低了不知火果皮类胡萝卜素质量比,这可能是由于果实套袋使得阳光无法透过,进而使得类胡萝卜素代谢相关基因的表达降低引起的.
- 程春振黄勇黄勇张永艳吴波闫树堂
- 关键词:套袋不知火果实品质类胡萝卜素高效液相色谱
- 两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用被引量:20
- 2013年
- 用两种常用的 SNP 分型方法,等位基因特异性 PCR 法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对 16 个柚栽培品种和 8 个柚杂种后代材料进行了 7 个 SNP 位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将 24 个样本分成了 22 种基因型。值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异。‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系。可见,AS-PCR 和 HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定。AS-PCR 法是一种准确、低成本的 SNP 分型方法,适合普通实验室使用,惟对 PCR 反应体系要求严格。HRMA 分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高。
- 杨润婷吴波李翀曾培曾继吾钟云姜波周碧容钟广炎
- 关键词:单核苷酸多态性高分辨率熔解曲线分析基因分型