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叶玉珍
作品数:
11
被引量:47
H指数:4
供职机构:
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
国家高技术研究发展计划
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
生物学
化学工程
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合作作者
丁达夫
中国科学院上海生命科学研究院生...
汤海旭
中国科学院上海生命科学研究院生...
费浩
中国科学院上海生命科学研究院生...
黄鹤
中国科学院上海生命科学研究院生...
杨晟
中国科学院上海生命科学研究院生...
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5篇
中国科学院上...
作者
5篇
叶玉珍
5篇
丁达夫
1篇
解涛
1篇
汤海旭
1篇
张磬
传媒
3篇
生物物理学报
1篇
科学通报
年份
2篇
2001
1篇
2000
1篇
1999
1篇
1998
共
11
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用自洽系综最优法预测溶剂化蛋白质突变体的结构
被引量:3
1998年
ChristopheLee等发展的自洽系综最优化方法(self-consistentensembleoptimization,SCEO),在预测核内残基突变体的结构中取得了很好的效果。我们在Lee的基础上发展了该方法,且在自洽最优化过程中,引入水的溶剂化效应,使自洽最优化方法能更好用于表面残基突变体结构的预测。9个表面残基突变体的结构预测表明这个新方法是有效的。
叶玉珍
汤海旭
丁达夫
关键词:
突变体
蛋白质功能基团三维模体及其应用
被引量:7
2000年
用一维序列模体和三维结构模体刻画与识别蛋白质功能区是蛋白质功能预测和分子设计中的重要课题.目前三维模体的提取与搜索均以残基为单位进行,特异性有限.鉴于残基的功能基团才是其发挥功能的关键要素,提出以功能基团为单位来表征三维模体(称为功能基团三维模体),并发展了相应的搜索算法,用于阐释蛋白质功能的结构基础以及预测未知蛋白质的功能.以从胰蛋白酶(PDB代码为1mct)中提取的“三联体和氧穴”功能基团三维模体及其搜索为例,在整体结构极不相似的胰蛋白酶。枯草杆菌蛋白酶和α/β水解酶中均搜索到了此功能基团三维模体,为三者具有相似催化机制提供了解释.对一些具有“变异三联体”的酶亦能用此功能基团三维模体给予识别.对蛋白质结构库的搜索结果充分展示了其在功能预测中的应用.与其他三维模体搜索及序列模体搜索的结果相比较表明,功能基团三维模体是蛋白质功能区的更好的表示,在蛋白质功能预测中有更高的灵敏度。
叶玉珍
解涛
丁达夫
关键词:
蛋白质
甾体激素受体功能特异性的结构基础
被引量:10
2001年
甾体激素受体家族包括雌激素受体、雄激素受体等五个亚家族 ,在机体组织细胞的生长分化、发育生殖、内环境稳定等几乎所有生理过程中都起着重要的作用。研究甾体激素受体亚家族的特异性可以加深对该家族功能的理解 ,并且具有潜在的临床应用价值。采用进化踪迹方法对该家族的配体结合域 (LBD)进行分析 ,探讨了决定亚家族功能特异性的结构基础。结果表明 ,甾体激素受体的各亚家族可能同相应的内源性配体存在着共进化关系 ;配体结合处的踪迹残基决定了受体-配体间的氢键作用和疏水相互作用模式并导致了亚家族的配体结合特异性。上述结论可用于甾体激素受体的配体结合特异性的改造以及新型组织选择性配体 (如选择性雌激素受体调节剂 ,SERM)
张磬
叶玉珍
丁达夫
关键词:
甾体激素受体
配体结合域
特异性
蛋白质骨架库的构建及其在功能蛋白质设计中的应用
1999年
利用活性位点嫁接设计新的功能蛋白质的方法需要功能模体和蛋白质骨架两种构件。出于活性位点嫁接的需要,我们构建了一个蛋白质骨架库,且提供搜索与功能模体相配骨架的工具及其评估方法。并用两个活性位点的嫁接进行了检验。
叶玉珍
丁达夫
关键词:
功能蛋白质
甾体激素受体配体结合域的进化印迹分析:揭示亚家族中的功能特异性位点
甾体激素受体的配体结合域(LBD)在配体结合、辅激活因子结合及受体二聚化过程中起着重要作用.为了加深对这一结构域的了解,探讨其与相应内源性配体间特异性结合的分子基础,我们对雌激素受体(ER)及雄激素受体(AR)的LBD部...
张磐
叶玉珍
丁达夫
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