刘晨鸣
- 作品数：16 被引量：25H指数：3
- 供职机构：兰州生物制品研究所有限责任公司更多>>
- 发文基金：“十一五”国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学化学工程农业科学更多>>
- 麻疹病毒F基因测序及其进化关系的初步分析被引量：3
- 2010年
- 研究麻疹病毒疫苗株S191毒种及其传代的病毒溶血素F(Haemolysin,HL)基因稳定性;对该序列一些重要位点的氨基酸进行比较,推测其功能结构及生物学活性变化;同时对该基因与M蛋白基因之间的非编码序列进行比对分析。利用RT-PCR方法扩增S191减毒株MeV23、26、27代及一株流行株YunnanLC-10的F基因,测序后进行比对分析。S191传代病毒F基因序列之间核苷酸同源性为99.8%,氨基酸同源性为99.5%～99.6%;S191疫苗株与流行株之间核苷酸序列同源性达95.2%;疫苗株与流行株1003nt的非编码区序列同源性为85.0%。S191传代病毒F基因具有较高遗传稳定性,关键功能位点氨基酸未发生传代改变;1003nt非编码区序列变异速度较快。
- 冯德杰刘晨鸣赵雅静魏然高雪军朱莉萍
- 关键词：麻疹病毒F基因RT-PCR
- 风疹病毒松叶株E2基因的遗传特征
- 2008年
- 目的研究风疹疫苗病毒松叶株(Matsuba)传代病毒E2基因的遗传特征及其基因稳定性。方法将Matsuba株毒种RV14在原代兔肾细胞上连续传代至第23代,取第14、16、17、18和23代病毒,利用RT-PCR方法扩增其E2蛋白基因,并与pUC18质粒连接后测序,对各代病毒及参考株的E2基因序列进行比对分析。结果Matsuba株E2基因全长846bp,传至23代时仍有很高的同源性,第14、16、17、18和23代与一致序列的核苷酸同源性分别为100%、100%、99.8%、99.8%和99.6%,氨基酸同源性分别为100%、100%、100%、99.3%和99.2%。Matsuba株E2基因与参考株核苷酸序列同源性为91.0～98.7%。Matsuba株各代病毒核苷酸、氨基酸序列高度保守,各关键功能区未发生变异。结论风疹病毒Matsuba疫苗株E2基因遗传特性稳定,为在分子水平保证Matsuba株毒种及其生产疫苗的安全性提供了依据。
- 高雪军可美毓刘晨鸣赵雅静魏至栋朱莉萍
- 关键词：风疹病毒E2基因
- 轮状病毒LLR疫苗株VP7基因的遗传变异研究被引量：6
- 2008年
- 目的研究轮状病毒(RV)LLR疫苗株VP7基因的遗传特征,为疫苗的质量控制和发展提供依据。方法将LLR株轮状病毒毒种LLR38在原代牛肾细胞上连续传至49代。提取第38、43、44、49代病毒RNA。通过RT-PCR扩增VP7基因片段,将其克隆入质粒pGEM-T中,进行序列测定与分析。结果LLR株VP7基因全长1062bp,含编码326个氨基酸的单一的开放读码框架(ORF)。各代次病毒的VP7基因核苷酸与推导的氨基酸变化完全一致,与GenBanK中LLR参考株(L11602)同源性分别为99.9%和99.7%。与14株G10血清型RV毒株之间,核苷酸与推导的氨基酸序列同源性分别为84.3%～87.4%和92.7%～94.9%;与不同血清型RV代表株间,VP7基因核苷酸与推导的氨基酸同源性分别为62.2%～76.8%和72.9%～83.1%;在A、B、C3个重要抗原表位,LLR株与同一血清型RV代表株B223氨基酸同源性高达97.5%,而与不同血清型仅为42.5%～62.5%。结论轮状病毒LLR疫苗株VP7基因具有良好的遗传稳定性,与来自不同国家同一型别的RV株VP7蛋白氨基酸序列之间无明显差异,在遗传上密切相关,从VP7基因分子水平证明LLR株毒种及其制备的疫苗是安全可靠的。
- 赵雅静高雪军刘晨鸣魏至栋冯德杰朱莉萍
- 关键词：轮状病毒VP7基因
- 风疹病毒松叶株全基因序列测定与分析
- 2012年
- 目的对我国现用风疹病毒(Rubella virus,RV)疫苗生产毒株松叶株(Matsuba)进行全基因组测序,分析其在减毒过程中的遗传与变异特点,为其安全性评价及遗传学质量控制的标准化提供依据。方法利用RT-PCR法分段扩增我国现用Matsuba疫苗株主代种子基因组全序列,分别将产物插入到T-A克隆载体pGEM-T easy中,构建病毒cDNA文库,进行全基因组序列测定与分析。结果我国现用Matsuba疫苗株主代种子基因组全长9 762 nt,含2个ORF,分别位于核苷酸41～6388位和6512～9700位,编码2 116、1 062个氨基酸;与GenBank中登录的Matsuba.GMK3野毒株和Matsuba疫苗株核苷酸同源性分别为97.5%和99.9%,氨基酸同源性分别为98.8%和99.9%;其在减毒的过程中共有37个氨基酸位点发生变异,其中非结构蛋白P150有18个氨基酸位点发生突变,结构蛋白E1和E2主要抗原位点氨基酸未发生变异,E1-177位糖基化位点突变丢失。结论我国现用风疹病毒Matsuba疫苗株与同类减毒株具有较高的同源性,其主要的抗原位点在减毒保种过程中高度保守,为在分子水平上保证Matsuba株毒种及其生产疫苗的安全性提供了依据。
- 刘晨鸣冯德杰赵雅静魏然魏至栋高雪军朱莉萍
- 关键词：风疹病毒基因组
- 流行性乙型脑炎病毒减毒株SA14-14-2E基因稳定性研究被引量：2
- 2006年
- 为研究乙脑病毒减毒株SA14-14-2 E蛋白基因稳定性,将乙脑病毒减毒株SA14-14-2在原代地鼠肾细胞(PHK)上传至18代,应用RT-PCR分别扩增PHK6代、PHK7代、PHK8代、PHK13代、PHK18代E蛋白基因并测序后,与Genebank中乙脑病毒减毒株SA14-14-2(D90195)进行比较分析。PHK6、PHK7、PHK8代病毒与D90195 E蛋白核苷酸和氨基酸序列完全相同。PHK13、PHK18代病毒与D90195E蛋白核苷酸序列同源性分别为99.8%、99.7%,与D90195E蛋白氨基酸序列同源性分别为99.6%、99.4%。各代次病毒E蛋白与减毒相关氨基酸未发生改变,同时所有突变的氨基酸均非SA14原有的,故不是恢复性突变。结果表明乙脑病毒减毒株SA14-14-2的遗传学特性稳定,从分子水平证明乙脑病毒减毒株SA14-14-2及其生产的疫苗具有安全性。
- 高雪军赵雅静刘晨鸣邹勇魏然郑学刚朱莉萍
- 关键词：E基因RT-PCR
- 轮状病毒的LLR疫苗株全基因组克隆及结构蛋白VP6基因遗传特征被引量：2
- 2015年
- 目的 了解轮状病毒（RV）的LLR疫苗株全基因组基因和蛋白特征、完善关键基因遗传稳定性研究,为疫苗的质量控制和研发提供依据.方法 将LLR株毒种第38代在原代牛肾细胞上连续传至49代,提取第38、43、44、49代病毒RNA.通过RT-PCR方法扩增LLR株（38代）全基因组11个dsRNA片段和传代病毒VP6基因,分别将其克隆到pGEM-T载体中,进行序列测定与分析.结果 LLR株全基因组11条RNA,由18 498个核苷酸组成,共编码5 796个氨基酸;全基因组研究表明,所克隆的LLR株属于G10P[15]/NSP4[A]/SG Ⅰ基因型.LLR株VP6基因全长1 356 bp,含编码397个氨基酸的单一的开放读码框架（ORF）.各代次病毒的VP6基因核苷酸与推导的氨基酸变化完全一致,与GenBank中LLR参考株（L11595）同源性分别为99.9％和99.7％.与16株SG Ⅰ亚群RV代表株之间,核苷酸与推导的氨基酸序列同源性分别为84.0％ ～ 99.7％和97.0％ ～ 99.2％;与不同亚群RV代表株之间,VP6基因核苷酸与推导的氨基酸同源性分别为77.7％ ～ 82.2％和92.2％ ～93.5％;LLR株各代病毒VP6基因核苷酸、氨基酸序列高度保守,各关键功能区未发生变异.结论 LLR疫苗株关键基因遗传特性稳定,为在分子水平保证LLR株毒种及其生产疫苗的安全性提供了依据;其全基因组克隆,为进一步研究RV生物学、免疫学和确定该病毒的分类学地位提供了科学依据.
- 赵雅静魏然冯德杰刘晨鸣魏至栋高雪军朱莉萍
- 关键词：轮状病毒VP6基因
- 麻疹病毒F基因克隆测序及其进化关系初步分析
- 本文研究了麻疹病毒(MeV)疫苗株S191毒种及其传代病毒以及流行株血溶素F(HL)基因稳定性，对该序列一些重要位点的氨基酸进行了比较，推测了其功能结构及生物学活性变化，对该基因与M蛋白基因之间的非编码序列进行比对分析。...
- 冯德杰刘晨鸣赵雅静魏然高雪军
- 关键词：麻疹病毒核苷酸序列基因克隆进化关系
- 文献传递
- 狂犬病病毒aG株全基因组序列测定及遗传稳定性分析被引量：2
- 2016年
- 目的探究狂犬病病毒（Rabies virus,RV）aG株全基因组序列特征及遗传稳定性。方法严格按疫苗生产工艺进行传代,提取主种子批、工作种子批及疫苗原液病毒RNA,通过RT-PCR技术扩增全基因组各片段基因,然后分别将其克隆到p GEM-T载体中,并进行序列测定;采用DNAStar软件包对aG株与Gen Bank中4aGV参考株（JN234411）以及18株基因1型RV参考株进行同源性分析。结果 aG株全基因组由11 925个核苷酸组成,共编码3 600个氨基酸。疫苗原液与主种子批全基因组核苷酸和氨基酸同源性均为100%,而工作种子批与主种子批的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.97%和99.92%;aG株与4aGV参考株全基因组核苷酸与推导的氨基酸同源性均为99.9%,其与18株基因1型参考株核苷酸与氨基酸序列同源性分别为84.2%~97.6%和93.7%~98.3%;aG株传代病毒与4aGV参考株全基因组氨基酸序列高度保守,且各主要功能区未发生变异。结论狂犬病病毒aG株在实验室长期生产传代过程中,全基因组遗传特性稳定。
- 赵雅静魏然刘晨鸣冯德杰邹勇高雪军朱莉萍
- 关键词：狂犬病病毒基因组
- 麻疹病毒S191疫苗株H基因序列遗传变异分析
- 2008年
- 目的研究麻疹病毒(MeV)疫苗株Shanghai191(S191)毒种和传代病毒血凝素蛋白(H)基因稳定性及其遗传与变异特点;对该序列一些重要位点的氨基酸进行比较,推测其功能结构及生物学活性变化;探讨S191疫苗株的保护效果。方法利用逆转录—聚合酶链反应方法扩增S191减毒株MeV23、MeV26、MeV27、MeV29、MeV32和MeV37代H基因,测序后与GenBank上U03663的序列进行比对分析。结果S191传代病毒与U03663序列之间核苷酸同源性达99.9%以上,氨基酸同源性为100%;S191与中国流行株的氨基酸序列同源性为96.6%～96.8%;S191与其他流行株之间氨基酸同源性达96.4%～98.9%。结论S191及生产的疫苗具有弱毒稳定性和安全性,并具有好的保护作用。
- 冯德杰高雪军刘晨鸣赵雅静魏至栋朱莉萍
- 关键词：麻疹病毒H基因逆转录-聚合酶链反应分子流行病学
- 风疹病毒松叶株E1基因遗传变异研究被引量：1
- 2008年
- 目的研究风疹病毒（rubella virus，RV）疫苗松叶株（Matsuba）E1基因遗传与变异特点，在基因水平评估Matsuba株生产的疫苗对流行株的保护效果。方法将风疹病毒松叶株毒种RV14在原代兔肾细胞连续传至第23代，取RV14、RV16、RV17、RV18、RV23代进行研究分析。利用RT-PCR方法扩增松叶株不同代次的E1蛋白基因，将E1基因与pGEM-T载体连接，获得风疹病毒E1基因的克隆并测序，对各代次病毒的E1基因与风疹病毒疫苗Matsuba株（GenBank登录号：1）50673）及其他参考株的E1基因序列进行比对分析。结果风疹病毒Matsuba株传至23代时仍有很高的同源性，RV14、RV16、RV18代次病毒与1）50673的核苷酸和氨基酸同源性为100．0％，RV17、RV23代次病毒与D50673的核苷酸序列同源性分别为99．9％、99．7％，氨基酸序列同源性分别为99．8％、99．2％。各代次病毒与糖基化、抗原性相关的氨基酸位点未发生变异，高度保守；风疹病毒Matsuba株与其他参考株E1基因序列比较结果表明：Matsuba株为la基因型，中国风疹病毒流行基因型为1E、IF、2A和2B，以lE基因型为主；Matsuba株与各基因型参考株同源性很高，核苷酸和氨基酸同源性分别为92．1％一99．6％和98．1％～99．8％。结论风疹病毒Matsuba疫苗株的遗传学特性稳定，从分子水平证明Matsuba疫苗株及其生产的疫苗具有安全性。尽管中国流行不同基因型风疹病毒，由于Matsuba株与各基因型参考株同源性很高，且风疹病毒毒株问抗原表位高度保守，因此Matsuba疫苗株所生产的疫苗可以有效保护不同基因型别的风疹病毒的感染。
- 高雪军可美毓刘晨鸣赵雅静魏至栋朱莉萍
- 关键词：风疹病毒E1基因
