刘春洁
- 作品数：6 被引量：7H指数：2
- 供职机构：新疆农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金国家绒毛用羊产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 新吉细毛羊角蛋白的EST筛选及表达研究被引量：4
- 2015年
- 试验旨在从新吉细毛羊皮肤组织表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)中筛选与毛囊发育相关基因并探讨其表达模式与羊毛细度的相关性。利用组装、比对软件Trinity与Blat对新吉细毛羊皮肤组织ESTs组装、注释进而筛选与毛囊发育相关基因,并通过实时荧光定量PCR相对定量方法以2-△△Ct值检测相关基因在不同绵羊个体中的表达规律。结果显示,从474条ESTs中筛选注释获得了4个与毛囊发育相关的角蛋白基因KRT27、KAP3.2、KAP11.1和KAP8.1;4个角蛋白基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量极显著高于细型细毛羊的表达量(P<0.01);4个角蛋白基因表达量:KRT27>KAP3.2>KAP11.1>KAP8.1。该研究为角蛋白基因在细毛羊转录水平上的研究提供了一定数据。
- 刘春洁付雪峰田可川黄锡霞徐新明詹振宏于丽娟
- 关键词：EST序列RT-PCR
- 中国美利奴羊(新疆型)KRT27基因的多态性及其与毛细度性状关联分析
- 2015年
- 实验通过PCR-SSCP技术,对中国美利奴羊(新疆型)KRT27基因的多态性进行了检测,并对不同基因型与中国美利奴羊(新疆型)羊毛细度性状间的关联性进行了分析。结果表明:外显子5的一段长度为122 bp的扩增产物经SSCP分析后出现了两种基因型AA和AB,存在两种等位基因A和B;AA基因型和AB基因型在中国美利奴羊(新疆型)中的频率分布分别为0.86和0.14,等位基因A、B的基因频率分别为0.93和0.07,表明A等位基因为优势等位基因;所研究群体在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。不同基因型的个体间羊毛细度性状没有显著差异(P>0.05)。
- 石晓雷马依拉.吐尔逊刘春洁米亚沙热.迪里木热提田月珍詹振宏艾买提.买买提黄锡霞田可川
- 关键词：多态性羊毛细度
- 不同羊毛纤维直径细毛羊MYL6基因克隆及差异表达研究被引量：1
- 2016年
- 试验以苏博美利奴羊为研究对象,探讨肌球蛋白轻链6(MYL6)基因在不同羊毛纤维直径的苏博美利奴羊中的表达模式。通过克隆肌球蛋白轻链6(MYL6)基因,结合生物信息学方法对其进行遗传进化和理化性质分析,且预测其二级蛋白结构,又通过RT-PCR相对定量方法以2^(-△△ct)值检测MYL6基因在苏博美利奴羊上的表达规律。结果表明:苏博美利奴羊MYL6基因大小为152036915 bp,MYL6基因的CDS全长序列为696 bp,共编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、老鼠、兔子、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源分别为96%、95%、40%、40%、40%、40%、0%、60%、0%。分别在1、220~336、415~864 bp位点上有3个开放式阅读框(ORF)。遗传理化性质研究显示MYL6蛋白含有1个信号肽,在苏氨酸上有5个磷酸化位点、6个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点,可能是一种非分泌性蛋白;MYL6蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,β-折叠区域占-2.00%;扭曲度占-0.16%;等电荷在-1.60~0.05。研究结果表明,苏博美利奴羊MYL6基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量显著高于细型细毛羊的表达量(P<0.01,差异倍数为2.048)。本研究将为开展肌球蛋白轻链基因在细毛羊皮肤转录水平上的研究提供数据理论基础。
- 付雪峰黄锡霞刘春洁徐新明张艳花吴伟伟于丽娟石刚田可川
- 关键词：生物信息学RT-PCR转录水平
- IGFBP-3基因多态性与中国美利奴羊(新疆型)部分毛性状的关联性分析被引量：1
- 2015年
- 【目的】寻找IGFBP-3基因在中国美利奴羊(新疆型)中的SNP位点,分析基因的多态性,并分析不同基因型个体在体重、油汗、光泽、毛长度评分、毛弯曲评分、毛弯曲数、毛细度评分、体格大小、剪毛量、平均直径、变异系数等经济性状上的差异显著性,为羊毛性状的候选基因提供理论基础。【方法】通过PCR-SSCP的方法,检测分析基因的多态性,用Excel软件进行数据的初步整理,用SAS8.1软件进行方差分析。【结果】得到两种基因型:AA和AB两种基因型,基因型频率分别为0.78和0.22,等位基因A和B的基因频率分别为0.89和0.11,A等位基因为优势等位基因,序列分析表明突变发生在序列片段的81碱基处且为G→C突变(g.81 G>C)。所研究绵羊群体在该位点为Hardy-Weinberg不平衡状态(0.010.05)。IGFBP-3基因可以作为毛长度选择的一个候选基因。
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- 关键词：IGFBP-3基因经济性状
- 新吉细毛羊皮肤组织均一化全长cDNA文库的质量评价被引量：2
- 2013年
- 通过对已构建新吉细毛羊皮肤组织的均一化全长cDNA文库进行活化，在此基础上进行EST生物信息学分析研究，期望能发现影响细毛羊羊毛性状的主效基因或相关基因。运用菌落PCR、菌液PCR、质粒快速鉴定3种方法对cDNA文库进行评价，通过测序，在NCBI上BLASTn搜索、比对及运用DNAstar等软件进行分析。初步鉴定的结果：cDNA文库的库容量（滴度）为1．57×10。pfu／mL，菌落PCR、菌液PCR阳性克隆的小片段率在80％～90％，克隆的片段大小在0．6～2．0kb，cDNA在300～500bp，而质粒快速鉴定的在90％，克隆的片段载体带大小3．5～5．0kb。质粒快速鉴定的效果好于其他两种方法，耗时相对短，同时小片段率高；cDNA文库保存完好，符合基因文库的质量要求，有足够大的库容量来保证筛选目的基因。通过对筛选的阳性克隆5’端随机测序，随后获得可读序列169条，经过相关生物信息查询之后，发现其中可能含有完整基因。
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- 关键词：新吉细毛羊CDNA文库
- 苏博美利奴羊S100A11基因序列分析及表达研究
- 2016年
- 为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,且通过RT-PCR相对定量方法检测S100A11基因在不同绵羊个体中的表达规律。结果表明：绵羊S100A11基因的CDS全长序列为866bp,编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、鼠、兔、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源性分别为96%、96%、96%、87%、24%、44%、70%、70%、60%;分别在1bp、220~336bp、415~864bp有3个开放式阅读框（ORF）;S100A11基因全长为4798bp。S100A11蛋白含有1个信号肽、19个磷酸化位点;同时S100A11基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量极显著高于细型细毛羊的表达量（P〈0.01）,差异倍数为2.048。
- 付雪峰刘春洁黄锡霞石刚徐新明石晓雷田可川
- 关键词：绵羊RT-PCR
