刘冬佳
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
- 供职机构：辽宁师范大学化学化工学院更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金国家自然科学基金辽宁省高等学校优秀人才支持计划更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 碱基腺嘌呤与多肽酰胺间氢键作用的最佳位点被引量：4
- 2013年
- 正确理解核酸碱基和蛋白质多肽间的作用机制有助于人们利用这些生物分子有效地进行分子设计,进而制备具有特殊纳米结构和功能的生物分子材料.本文优化得到了碱基腺嘌呤与N-甲基乙酰胺、甘氨酸二肽、丙氨酸二肽形成的20个氢键复合物的结构并计算了结合能,探讨了腺嘌呤与多肽酰胺间氢键作用的最佳位点.研究发现:腺嘌呤可以使用两个不同位点(A1位点和A2位点)与N-甲基乙酰胺形成N―H…N型或者N―H…O=C型氢键复合物,腺嘌呤使用A1位点与N-甲基乙酰胺形成的N―H…N型氢键复合物更稳定;二肽分子可以使用主链上两个不同位点(丙氨酸的Ala7位点和Ala5位点或者甘氨酸的Gly7位点和Gly5位点)与腺嘌呤形成含有N―H…N和N―H…O=C两条氢键的复合物,二肽分子使用Ala7或Gly7位点与腺嘌呤形成的氢键复合物更稳定;腺嘌呤与多肽间的氢键作用强于其与N-甲基乙酰胺的作用.基于分子中的原子理论与自然键轨道计算结果分析了氢键作用的本质.
- 刘帅李书实刘冬佳王长生
- 关键词：氢键结合能
- 取代基对1-甲基尿嘧啶与N-甲基乙酰胺氢键复合物中氢键强度的影响被引量：5
- 2012年
- 使用密度泛函理论B3LYP方法和二阶微扰理论MP2方法对由1-甲基尿嘧啶与N-甲基乙酰胺所形成的氢键复合物中的氢键强度进行了理论研究,探讨了不同取代基取代氢键受体分子1-甲基尿嘧啶中的氢原子对氢键强度的影响和氢键的协同性.研究表明:供电子取代基使N-H…O=C氢键键长r(H…O)缩短,氢键强度增强;吸电子取代基使N-H…O=C氢键键长r(H…O)伸长,氢键强度减弱.自然键轨道(NBO)分析表明:供电子基团使参与形成氢键的氢原子的正电荷增加,使氧原子的负电荷增加,使质子供体和受体分子间的电荷转移量增多;吸电子基团则相反.供电子基团使N-H…O=C氢键中氧原子的孤对电子轨道n(O)对N-H的反键轨道σ*(N-H)的二阶相互作用稳定化能增强,吸电子基团使这种二阶相互作用稳定化能减弱.取代基对与其相近的N-H…O=C氢键影响更大.
- 刘冬佳王长生
- 关键词：氢键复合物取代基氢键强度自然键轨道分析
- 碱基与N-甲基乙酰胺氢键复合物中氢键强度的理论研究
- 本文使用密度泛函理论B3LYP方法和二阶微扰理论MP2方法，选取一系列碱基与N-甲基乙酰胺形成的氢键复合物体系为研究对象，对复合物中的氢键强度进行了研究，主要研究工作可归纳为如下两个方面: 1.研究了取代基对由1-甲基...
- 刘冬佳
- 关键词：氢键复合物氢键强度自然键轨道分析密度泛函理论
- 文献传递
