何丰 作品数:20 被引量:36 H指数:4 供职机构: 重庆医科大学附属第一医院 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 全球变化研究国家重大科学研究计划 重庆市科委基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
动物外周血单个核细胞分离方法探讨 被引量:4 2010年 目的 探索用人淋巴细胞分离液分离多种属动物外用血单个核细胞(PBMCs)的可行性及评价其分离效果,建立一种适于野外大规模多种属动物PBMCs的分离方法.方法 采用人淋巴细胞分离液分离来源于新疆的伊犁马、新疆驴、不同品种犬、新疆双峰驼、天山马鹿和来源于重庆的荣昌猪、中国荷斯坦奶牛、简阳大耳黑山羊外周血PBMCs.随机抽样检测分离的动物PBMCs细胞总数、细胞纯度和细胞活率.结果 用人淋巴细胞分离液成功分离上述8种动物PBMCs,每毫升动物外周血分离的PBMCs细胞总数为0.52×106~2.03×106个,纯度为67%~93%,细胞活率为92.5%-98.0%.结论 用人淋巴细胞分离液分离多种动物PB-MCs的方法宜在动物的病毒分子流行学调查中进一步推广. 胡永波 展群岭 刘海朋 霍康 杨德雨 徐鸣明 张英英 何丰 胡子成 谢鹏关键词:动物 细胞分离 新疆伊犁地区动物脑内博尔纳病病毒和西尼罗病毒感染的分子流行病学研究 博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)是一种非分段单股负链RNA病毒,在感染细胞的细胞核内复制和转染。Borna病毒基因组相对分子量为8.9×103,具有6个开放阅读框架,能编码核蛋白(p40)、... 何丰关键词:博尔纳病病毒 西尼罗病毒 分子流行病学 神经症状 文献传递 牧羊犬外周血和脑组织博尔纳病病毒检测结果的比较 被引量:6 2010年 目的检测同一牧羊犬外周血和脑组织博尔纳病病毒(BDV)p24片段,比较两者阳性率的差异。方法采用改进的荧光定量套式RT-PCR,对新疆伊犁地区圈养的100只牧羊犬外周血单核细胞(PBMC)和脑组织(BT)同时进行BDV p24基因片段的检测,并对阳性标本采用GFP-p24、pMD-19扩增后电泳验证,排除质粒污染,并克隆测序,用Fisher精确检验和χ2检验分析两者阳性率的差异。结果牧羊犬外周血单核细胞和脑组织BDV p24检测的阳性率分别为5%和9%;PBMC组和BT组BDV p24检测阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。结论BDV在脑内持续感染,但以RT-PCR对外周血单核细胞BDV p24片段的检测有可能替代脑组织BDV检测,作为大规模流行病学调查的手段。 何丰 冯裕星 孙后超 展群岭 谢鹏关键词:博尔纳病病毒 外周血 脑组织 新疆伊犁地区动物脑组织博尔纳病病毒p24基因片段的检测 被引量:2 2010年 目的了解新疆伊犁地区动物脑博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)感染现状,分析该病毒的种系来源,预防我国BDV大规模暴发流行。方法采用巢式逆转录实时荧光定量聚合酶链反应(FQ—RT-PCR)的方法,对新疆地区200匹马、75头驴和100只牧羊犬脑组织标本进行BDVp24基因片段的检测。并对阳性标本进行BDV p40基因片段扩增电泳,同时排除GFP—p24和pMD-19质粒污染,最后克隆测序,进行基因同源性和氨基酸序列分析并分析BDV种系发生。结果3例伊犁马、4例伊犁驴和9例牧羊犬的脑组织标本BDV p24检测阳性,阳性率分别为1.5%、5.3%、9.0%;BDV p40基因片段检测和质粒标准品GFP—p24、pMD-19检测均为阴性;BDV pPA扩增产物序列与He/80株的同源性为100%。结论新疆伊犁地区马、驴和狗可能存在BDV脑内的自然感染,该地区BDV流行株与He/80株存在同源性。 何丰 冯裕星 孙后超 胡子成 徐红波 徐鸣明 展群岭 胡永波 金戈 张英英 李雷雷 谢鹏关键词:博尔纳病病毒 脑组织 博尔纳病病毒实时荧光定量PCR诊断试剂盒的评价与应用 被引量:1 2009年 目的评价博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)实时荧光定量PCR(FQ RT-PCR)试剂盒的各项指标,并了解其实际应用效果。方法使用BDVOL持续感染细胞株、非BDV病毒序列转染的OL细胞、正常的OL细胞,对BDV RT-PCR试剂盒的敏感性、特异性、重复性和稳定性进行评估,同时检测部分临床病人和动物外周血液RNA。结果试剂盒可以检测出的病毒RNA最低浓度为102,相当于1.5个病毒拷贝数。特异性好,无非特异检出。不同批次的试剂盒的检测结果变异系数接近1。加速破坏的试剂盒和正常试剂盒检测结果之间变异系数在2以内。对临床病人检测阳性率为3.6%,对动物检测阳性率为4.4%。结论试剂盒敏感性、特异性、重复性和稳定性均佳,是BDV基础研究、流行病学调查、临床检测的良好工具。 徐鸣明 展群岭 张英英 何丰 冯裕星 张亮 金戈 李雷雷 谢鹏关键词:博尔纳病病毒 实时荧光定量PCR 检测试剂盒 博尔纳病病毒的生物学特点以及检测方法 被引量:7 2010年 1博尔纳病病毒概况
远在18世纪末博尔纳病病毒(Borna Disease Virus,BDV)就在德国南部出现散发感染,但是没有正式命名。1895年在萨克森州博尔纳镇突然出现了大量马匹死亡的事件,其中包括了一个骑兵团的军马。 徐鸣明 张英英 展群岭 孙后超 冯裕星 何丰 李雷雷 谢鹏关键词:博尔纳病病毒 生物学特点 新疆伊犁地区动物脑组织西尼罗病毒E基因片段的检测 2010年 目的了解新疆伊犁地区动物中西尼罗病毒(West Nile virus,WNV)感染现状,为我国WNV的防治提供资料。方法采用一步法实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR),对采自新疆伊犁地区的70头驴和100只牧羊犬的脑组织进行WNV包膜蛋白(E)基因片段检测。结果 70头驴和100只牧羊犬脑组织标本的西尼罗病毒包膜蛋白基因片段检测有2例可疑阳性,但经3%凝胶电泳法再次验证后排除。故所有待检样本WNV包膜蛋白基因检测均为阴性。结论我国新疆伊犁地区的驴和牧羊犬脑组织中未检测到WNV的感染。 何丰 徐红波 展群岭 冯裕星 孙后超 胡子成 谢鹏关键词:西尼罗病毒 实时荧光定量RT-PCR 巢式荧光定量RT-PCR检测中枢神经系统HCV方法的构建 被引量:1 2009年 目的建立丙型肝炎病毒5′NCR基因的巢式荧光定量RT-PCR检测方法,用于中枢神经系统感染超低浓度HCV的准确和快速定量检测。方法选择高度保守区5′NCR基因片段,设计并合成相应的特异性引物和探针,建立巢式荧光定量RT-PCR检测中枢神经系统感染样本中的超低浓度HCV正负链RNA的方法。并对32例血清HCV抗体检查阴性的病毒性脑炎患者脑脊液有核细胞和外周血单个核细胞(PBMC)进行检测。结果可特异性地检出脑脊液有核细胞及PBMC中HCV正负链RNA,最低检出浓度均可达7.85 cop ies/μl,与其他单股正链RNA病毒如登革热病毒(DEV)无交叉反应。32例血清HCV抗体检查阴性样本脑脊液有核细胞和PBMC中HCV5′NCR正链片段阳性的分别为1例(1/32)和2例(2/32),负链片段阳性的分别为1例(1/32)和0例(0/32)。结论本方法的构建适用于中枢神经系统感染超低浓度HCV正负链RNA检测,且快速有效、敏感性和特异性较高,不易出现假阳性,可有效提高检出率,进一步完善目前临床常规检测HCV的方法。 冯裕星 何丰 孙后超 徐红波 胡子成 展群岭 徐鸣明 张亮 胡永波 李雷雷 谢鹏关键词:丙型肝炎病毒 荧光定量RT-PCR 外周血单个核细胞 新疆伊犁河谷博尔纳病病毒种系发生学分析 被引量:1 2009年 目的分析新疆伊犁河谷博尔纳病病毒(BDV)种系形成及其可能的原因。方法采用改进的巢式逆转录PCR(nRT-PCR)方法,在5个种属8个品种873例动物外周血单核细胞(PBMCs)中,检出伊犁马、新疆驴和哈萨克牧羊犬BDV磷蛋白(p24)RNA阳性片段19例,比对BDV标准株He/80、Strain V和H1766,分析核苷酸和氨基酸同源相似度,重构基因系统发生树。结果19例BDV p24核苷酸序列一部分形成伊犁独立支系,另一部分汇聚至伊犁-德国-瑞士混合支系。独立支系与标准株无聚合,核苷酸序列同源相似度为98%,氨基酸序列为100%;德国马He/80汇聚混合支系,核苷酸与氨基酸序列与He/80同源相似度均为100%。结论新疆伊犁河谷动物宿主中可能存在地源性BDV独立伊犁株,同一BDV感染不同种属动物可能源于外来疫病病原经草原丝绸之路的传播。 展群岭 徐鸣明 张英英 翟红 徐红波 何丰 霍康 彭丹 刘妍汐 曾志磊 谢鹏关键词:博尔纳病病毒 伊犁河谷 动物宿主 新疆伊犁地区马匹亨德拉病毒脑内感染情况调查 被引量:2 2011年 目的检测新疆伊犁地区天然牧场放养马群脑组织中亨德拉病毒(Hendra Virus,HeV)的核酸片段,调查该地区马群中枢神经系统HeV感染流行状况。方法针对HeV高度保守区核蛋白(N)基因设计特异性引物和探针,采用一步法实时荧光定量RT-PCR检测中枢神经系统感染样本中低浓度HeV RNA的方法,检测新疆伊犁草原地区天然放养且未接种HeV疫苗的183例马匹脑组织。结果最低特异性检出浓度可低至2.6×102copies/μL,与其他单股负链RNA病毒如同属的尼帕病毒(NiV)无交叉反应,对183例马脑组织进行一步法实时荧光定量RT-PCR检测,未检出阳性样本。结论初步流行病学研究尚未发现我国新疆伊犁地区天然牧场放养马匹中存在HeV感染的证据,提示该地区短时间内爆发亨德拉病毒感染的可能性小。 冯裕星 何丰 孙后超 张亮 徐红波 胡子成 牟君 展群岭 徐鸣明 胡永波 李雷雷 谢鹏关键词:N基因