黎志凤
- 作品数：12 被引量：20H指数：2
- 供职机构：山东大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生化学工程文化科学更多>>
- 应用生物信息学的系统化综合性教学改革实践被引量：7
- 2016年
- 信息时代由于信息量巨大,传统的生物学讲学模式易导致知识片段化和浅表化等问题,从而显得乏味。应用生物信息学由于具有在实践中串并联相关知识点的特征,可成为转变这些问题的重要利器。为利用好这把利器,本文探讨了应用生物信息学课程的系统化综合性教学改革。论文从教学内容系统性布局(课程定位、内容结构和教学手段)和综合解析优秀科普视频中趣味性生物学问题两方面,图文并茂地展示了改革实践。实践中学生们受益匪浅。学生综合素质的提升体现在很多方面,比如认知的系统性与深度提高、思维模式由被动转变为主动、团队合作意识增强、学习兴趣热情提升、克服困难的勇气与自信心增强、自主设计与创新能力提升等。信息时代的生命科学已由传统的实验性科学转变为由思维分析主导的实验设计兼由设计主导的实验论证性科学,而应用生物信息学课程正是训练信息时代相关科研能力的重要环节。论文实施的系统化综合性教学改革取得了一定成效,值得借鉴与交流。
- 黎志凤刘杨朱敬SINGH Raghvendra Pratap李越中
- 关键词：系统性教学综合性教学研究性教学教学改革
- 纤维堆囊菌So0157-2中埃博霉素A糖基转移酶的预测与分离
- 埃博霉素(epothilones)被认为是紫杉醇类抗肿瘤化合物的更新换代产品,2007年epothilone类似物已经被FDA批准作为一线药物。实验室分离到多株埃博霉素产生菌,其中菌株So0157-2中首次鉴定到epot...
- 李曙光李鹏飞黎志凤刘红李越中
- 文献传递
- 纤维堆囊菌So0157-2单酰基甘油酰基转移酶的基因克隆、序列分析及异源表达
- 纤维堆囊菌So0157-2能产生丰富的次级代谢产物,包括大量的细胞内含物。经TLC,GC-MS结合ESI/MS/MS鉴定,这些内含物主要是由碳原子数目为13～18的9种脂肪酸所形成的三酰基甘油酯。推测单酰基甘油酰基转移酶...
- 程媛媛钱云开黎志凤刘红吴志红李越中
- 关键词：纤维堆囊菌内含物
- 文献传递
- So0157-2埃博霉素生物合成基因簇启动子预测及功能分析
- 埃博霉素(epothilones)类化合物已经被FDA批准作为一线抗肿瘤药物,其生物发酵产量低是当前工业化应用的主要瓶颈。为研究epothilones转录调控区,在克隆获得So0157-2菌株来源的epothilones...
- 朱丽萍黎志凤
- 文献传递
- 黏细菌合成抗肿瘤化合物埃博霉素的应用基础研究
- 李越中1岳新晶1黎志凤
- 黏细菌以复杂的多细胞群体行为而著称，能够产生丰富多样的天然活性次级代谢产物，是一类重要的药源微生物类群。纤维堆囊菌产生的埃博霉素是已知唯一来自微生物且具有促微管聚合活性的化合物，与著名抗癌药物紫杉醇具有类似的作用机制。由...
- 关键词：
- 关键词：埃博霉素抗癌药物发酵工艺
- 埃博霉素(Epothilones)的PKS/NRPS杂合基因簇被引量：10
- 2003年
- 埃博霉素是由粘细菌纤维堆囊菌产生的一类具有促微管聚合活性的大环内酯类化合物。埃博霉素生物合成的多酶复合体是一个由多个功能模块组成 ,同时含有多聚酮合酶 (PKS)和非核糖体肽合成酶 (NRPS)的大操纵子。根据同位素标记试验结果和合成酶全基因簇功能的推测 ,埃博霉素的生物合成包括聚酮链的引发、链合成的起始和噻唑环的形成、链的延伸和转移、链合成的终止释放和环化、及产物的后修饰 5个阶段。埃博霉素的PKS NRPS杂合基因簇是开展组合生物合成研究的良好材料。
- 黎志凤Etienne Nguimbi李越中刘巍峰
- 关键词：埃博霉素组合生物合成
- 酶法合成粘细菌大环内酯类化合物新型糖苷衍生物
- 16元环的埃博霉素B(Epothilone B)和28元环的粘球菌素(Myxovirescin)是粘细菌来源的2例具临床应用价值的大环内酯类化合物。前者与紫杉醇作用机制类似，但在分子量小、水溶性好、对多重耐药肿瘤细胞抑制...
- 张鹏王川东胡玮黎志凤李越中
- 关键词：粘细菌埃博霉素糖基转移酶
- 纤维堆囊菌埃博霉素生物合成基因簇与酮基合酶基因的克隆与分析
- 粘细菌能够合成多种具有抗癌、抗细菌、抗真菌、免疫调节等生物学活性的天然产物。至今已经从粘细菌次级代谢物中鉴定了100种以上的基本化学结构和600多种结构衍生物，约占微生物来源总数的3.5％。而粘细菌中分离的天然产物中一半...
- 黎志凤
- 关键词：纤维堆囊菌埃博霉素基因合成粘细菌
- 文献传递
- 黄色粘球菌DK1622基因组岛分析及其功能研究
- 黄色粘球菌DK1622的基因组大小约为9.14Mb,比其他δ分支的原核细菌基因组(3.66-5.01Mb)有4-5Mb的基因组扩张。2007年Goldman分析发现已研究的粘球菌发育
- 李霞黎志凤刘红李越中
- 文献传递
- 基于遗传片段分析系统的转录起始位点分析技术:从预测到结果评估被引量：2
- 2017年
- 【目的】以遗传片段分析仪内标法替代传统放射性标记引物延伸技术进行样本转录起始位点(TSS)分析,并弥补引物延伸技术应用于未知样本缺乏前期预测和后期评估环节,形成一套基于遗传片段分析仪内标法分析未知样品TSS的完整技术方案。【方法】以粘球菌Myxococcus DK1622来源的双拷贝Gro ELs基因为素材;首先从预测出发,利用数据库进行启动子和转录起始位点预测;其次,根据预测结果设计合成荧光标记引物进行靶标m RNA的反转录;再次,应用遗传片段分析技术内标法鉴定分析粘球菌来源的双拷贝Gro ELs基因转录起始位点(TSS)及其丰度;最后,应用正态分布理论进行鉴定结果评估。【结果】明确了转录起始位点的数量、转录丰度及最可能的TSS位点:粘球菌DK1622基因组中Gro EL1拷贝存在1个启动子,TSS位点为TSS_(286);Gro EL2拷贝存在2个启动子,TSS位点分别为TSS_(548)和TSS_(502),其中TSS_(548)转录丰度是TSS_(502)的13.8倍,Gro EL1的TSS_(286)丰度是gro EL2的TSS_(548)丰度的14.3倍。【结论】预测结果指明了实验设计的范围,遗传片段分析仪内标检测法替代传统放射性标记法使实验更加简便、安全、自动、准确,正态分布理论进一步评估了实验结果的可信度,三者接合形成了完善的转录起始位点鉴定技术方案。
- 黎志凤张文燕刘杨曲绍峰王岩朱丽萍李越中
- 关键词：GROEL
