黄雅丽 作品数:24 被引量:71 H指数:5 供职机构: 广州中医药大学基础医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省教育厅育苗工程项目 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 文化科学 更多>>
一种来自深海宏基因组的L-蛋氨酸裂解酶基因及其表达产物 本发明涉及一种来自深海环境的新基因,尤其是一种来自深海宏基因组的能产生L-蛋氨酸γ-裂解酶活性的新基因,获得了新基因的克隆,构建了工程大肠杆菌并获得表达产物。本发明所述的一种来自深海宏基因组的L-蛋氨酸裂解酶基因,该基因... 周世宁 李慧贤 黄雅丽 陆勇军文献传递 不同生长条件下铁皮石斛内生细菌多样性及活性菌株的筛选 被引量:1 2021年 【目的】比较和分析野生与人工栽培铁皮石斛Dendrobium officinale内生细菌分布特点,筛选有较强定殖能力的活性菌株,为促进野生铁皮石斛驯化、提高药材品质奠定基础。【方法】采用组织块分离法分离铁皮石斛根、茎、叶各部位的内生细菌,利用16S rDNA序列和系统发育树对分离菌株进行分析鉴定,体外筛选具有解磷、解钾、固氮、产铁载体、产IAA、拮抗病原菌的促生活性菌株,回接后再分离,观察内生细菌在组培苗中的定殖动态。【结果】从铁皮石斛中分离到285株内生细菌,其中,217株分离自野生铁皮石斛,归类于3门9属,以芽孢杆菌属Bacillus和不动杆菌属Acinetobacter为优势菌群存在于根、茎、叶中,其菌株数分别占总分离菌株数的79.26%和8.76%;68株内生细菌分离自人工栽培铁皮石斛,归类于1门3属,以伯克霍尔德菌属Burkholderia和埃希菌属Escherichia为优势菌群存在于根、茎中,其菌株数分别占总分离菌株数的54.41%和30.88%。泛菌属Pantoea在野生和人工栽培铁皮石斛中均有分布。野生铁皮石斛内生细菌的物种数(9)和多样性指数(0.85)明显高于人工栽培铁皮石斛(物种数为3,多样性指数为0.61)。活性筛选共获得38株菌株,占筛选菌株的45%,4株野生铁皮石斛的活性内生细菌中有3株在人工组培苗具有较好的定殖性。【结论】野生与人工栽培铁皮石斛内生细菌的类群结构和生物多样性具有明显差异,铁皮石斛内生细菌蕴含丰富的促生潜力。 李婷 邓顺升 刘艳明 黄雅丽关键词:铁皮石斛 内生细菌 多样性 定殖 结香与未结香白木香内生细菌群落结构及变化 被引量:8 2015年 研究采用不依赖培养方法 T-RFLP,比较结香和非结香的白木香内生细菌的群落结构及变化,研究发现结香后内生细菌的T-RFs、香农多样性指数有增加的趋势,各样品间差异的T-RFs片段数占总T-RFs片段数60%以上,说明结香前后白木香内生细菌的种类发生显著变化。在非结香样品中,内生细菌的优势菌群是Anoxybacillus,Clostridium,Candidatus endobugula,Lysinibacillus,结香样品中内生细菌的优势菌群为Clostridium,Lysinibacillus,Luteimonas,phytoplasma。另外,在结香和非结香样品中都出现一些特异的T-RFs片段,这些明显的变化使得样品聚类分析时,结香样品内生细菌群落结构相似性比较高聚在一起,非结香样品聚在一起,说明结香前后白木香内生细菌发生显著的、有规律的变化。研究旨在利用不依赖培养的方法首次探讨白木香内生细菌的群落结构及结香中的变化,为合理利用白木香内生细菌资源提供科学依据。 黄雅丽 邝枣园 宋梦微 张韧关键词:白木香 内生细菌 T-RFLP 一个深海甲硫氨酸γ-裂解酶基因及其产物特征 对南海深海沉积物宏基因组文库的克隆子fss6的外源片段进行全序列测序和研究,发现该插入片段与来自陆地的微生物基因组相似性较低,而与来自海洋的微生物基因组相似性较高,其中96.1%的插入片段序列与来自深海热液口的Idiom... 李慧贤 杜纪坤 黄雅丽 胡海艳 陆勇军 周世宁文献传递 檀香内生真菌多样性及其抗菌与促生特性的研究 被引量:16 2018年 为了揭示檀香内生真菌分布特点及其在抗菌物质开发和檀香快速栽培研究中的潜在应用,该研究对檀香内生真菌的生物多样性及其抗菌与促生特性进行了研究。檀香内生真菌分离及类群分析结果显示:分离到的325株檀香内生真菌(其中来自根86株,茎105株,叶134株)隶属于16个属;不同部位内生真菌的分离率与定殖率呈现相同的变化规律,从高到低依次为叶、茎、根;根部内生真菌的多样性指数明显高于茎和叶,不同部位优势内生真菌类群存在较大的差异:根部为镰刀菌属(Fusarium,占50.00%)和链格孢属(Alternaria,占10.47%),茎部为链格孢属(占58.11%)和枝顶孢霉属(Acremonium,占20.00%),而叶部是盘长孢属(Pantoea),占74.63%。40株代表性檀香内生真菌菌株发酵液的抗菌活性分析结果显示:90%内生真菌至少对其中1种测试菌表现出抑制活性,其对大肠杆菌、产气肠杆菌、伤寒沙门菌、痢疾杆菌、金黄色葡萄球菌、枯草芽胞杆菌具有抑制活性的菌株分别占总数的45.0%,30%,47.5%,55%,72.5%,62.5%。对它们的促生特性进行分析,筛选到5株具溶磷活性的内生真菌,8株可分泌IAA的内生真菌,以及4株可产铁载体的内生真菌,其中内生真菌Monilia sp.TXRF45既具溶磷活性、又能产生IAA和铁载体。以上研究结果表明檀香内生真菌具有丰富的物种多样性且其分布具有一定的组织特异性,部分菌株具有较好的抗菌和促生活性,它们在抗菌活性物质的开发和快速栽培研究中具有潜在的应用前景。 刘军 刘艳明 徐在超 王卓娅 黄雅丽 邓祖军关键词:檀香 内生真菌 多样性 抗菌活性 一种来自深海宏基因组的L-蛋氨酸裂解酶基因及其表达产物 本发明涉及一种来自深海环境的新基因,尤其是一种来自深海宏基因组的能产生L-蛋氨酸γ-裂解酶活性的新基因,获得了新基因的克隆,构建了工程大肠杆菌并获得表达产物。本发明所述的一种来自深海宏基因组的L-蛋氨酸裂解酶基因,该基因... 周世宁 李慧贤 黄雅丽 陆勇军两株高DNA拓扑异构酶Ⅰ抑制活性的药用植物内生真菌筛选 被引量:2 2010年 从7种中国南方药用植物中分离了278株内生真菌,分析了其发酵液甲醇提取物对人DNA拓扑异构酶Ⅰ(hTo-poI)松驰活性的抑制能力。对2株具有高hTopoI抑制力的内生真菌(LF4-7L和LF6-1)进行了深入研究。通过发酵物对hTo-poI抑制能力的时间变化曲线,表明2株内生真菌的hTopoI抑制物质在其生长停滞阶段才大量产生和积累。经分子鉴定,LF4-7L可能是阴炭团菌(Hypoxylon stygium),而与LF6-1L最相近的是毛竹基腐病菌(Arthrinium phaeospermum)。 杨国武 黄秀丽 赖心田 黄雅丽 周世宁关键词:药用植物 内生真菌 深海沉积物宏基因组文库构建及淀粉酶筛选 被引量:2 2013年 深海环境通常具有高盐,高压,高/低温,无光照等特点,使得海洋微生物存在一套独特的生理代谢机制和分子细胞结构,然而迄今绝大部分深海微生物不能在实验室条件下被分离培养,深海微生物资源开发遇到很大挑战。本研究通过不依赖培养的方法研究海洋微生物的基因资源,构建了南海深海沉积物fosmid宏基因组文库,共获得约39 600个克隆,插入片段范围在24~45kb之间,平均插入片段大小为33kb,克隆片段的总库容达到1 320Mb。通过功能筛选获得3个具有淀粉酶活性的克隆子,选取其中最适温度较低的amy7作为进一步研究对象。构建amy7插入片段的重组质粒文库,获得一个同样有淀粉酶活性的克隆子amy7—6。经测序,克隆子amy7—6含有3 291bp插入片段,序列比对分析后发现其中一个大小为1 920bp的ORF,其编码的蛋白质序列(AmyS)与各种来源的糖苷酶有着较高的相似性。 黄雅丽 张炯 曹理想 谭红铭 陆勇军 周世宁关键词:深海沉积物 海洋微生物 淀粉酶 DNA提取方法对桑树内生菌多样性研究的影响 被引量:2 2015年 【目的】基于聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)对桑树根、茎、叶组织内生菌多样性的分析,结合浓度、纯度、PCR扩增性等指标,比较4种DNA提取方法之优劣。【方法】采用常见的DNA提取方法十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、缓冲液振荡(SPBS)法、液氮研磨(LNG)法和试剂盒(KIT)法提取桑树各组织DNA,从PCR-DGGE多样性等多方面对4种方法进行比较。【结果】对于桑树根和茎,DNA提取浓度最高的方法是LNG法,最低的是SPBS法;桑树叶情况则完全相反。桑树各组织,KIT法获得的DNA纯度均最高。桑树各组织通过16S r DNA PCR-DGGE比较内生细菌多样性,适宜的DNA提取方法是LNG法或CTAB法,不宜采用KIT法提取DNA。内生真菌ITS PCR-DGGE分析结果完全不同,最佳提取方法是KIT法,最不适宜的DNA提取方法因组织不同而异。【结论】对于桑树内生菌研究,最佳的DNA提取方法因组织不同而异,还与研究的内生菌种类有关系。 黄雅丽 马嫚 张韧 万幸 邝枣园关键词:内生菌 DNA提取 PCR-DGGE 东沙群岛深海微生物宏基因组文库构建与功能筛选 本研究以中国南海东沙群岛附近海域深海沉积物为研究对象,采用玻璃珠裂解法、酶解法、化学裂解法和商品化环境基因组分离试剂盒等方法提取沉积物总DNA,用PCR-DGGE技术评价不同方法对沉积物DNA多样性的影响,在此基础上改进... 赖心田 方澍 黄雅丽 曹理想 陆勇军 林永成 周世宁关键词:深海沉积物 宏基因组文库 功能基因筛选 文献传递