车志群
- 作品数：8 被引量：23H指数：3
- 供职机构：广西科学院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区科技攻关计划国家林业公益性行业科研专项教育部重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程农业科学天文地球更多>>
- 广西北海市的鸟类资源被引量：3
- 2018年
- 【目的】对北海市鸟类资源进行全面调查分析。【方法】于2005—2016年对广西壮族自治区北海地区的鸟类进行调查,结合查阅历史资料文件记载,归纳总结全市的鸟类资源。【结果】在北海地区共记录鸟类455种,留鸟种类均较少,多数鸟类在北海为候鸟,其中国家一级重点保护鸟类3种,数量均极为稀少,国家重点保护动物69种,包括数量众多的隼形目猛禽。【结论】北海是西伯利亚、东亚、东北亚候鸟迁往西太平洋群岛、东南亚、南亚以及非洲大陆的重要通道和停歇地。北海地区候鸟数量众多,但由于内陆和滨海湿地退化,以及盗猎野生鸟类行为导致大型水鸟在该地区缺失。因此需在春秋两季迁徙季节加强候鸟保护工作。
- 孙仁杰刘文爱余桂东车志群
- 关键词：鸟类候鸟
- 沼气池未培养微生物宏基因组文库的构建及β—葡萄糖苷酶基因的克隆、鉴定和表达
- 本研究采用间接提取法从沼气池中提取了未培养微生物的宏基因组DNA，经Sephadex G200（2％PVPP）凝胶柱和电沈脱两步纯化后回收30-50kb的DNA片段并补平，以柯斯质粒pWEB：TNC为载体构建了一个约含三...
- 车志群
- 关键词：沼气池未培养微生物宏基因组文库活性筛选Β-葡萄糖苷酶
- 文献传递
- 荧光定量PCR方法及分子标志物在海洋污染监测中的应用进展被引量：3
- 2015年
- 荧光定量PCR作为一种核酸定量技术,可在PCR扩增时在体系中加入荧光染料或荧光基团,实时监测荧光信号从而对PCR扩增产物进行实时准确定量,技术灵敏度高,特异性强。通过对荧光定量PCR的原理、分类、优缺点及几种定量分析方法对比进行简述,并对其在国内外海洋环境污染监测中的广泛应用和研究进行了全面综述,从而对荧光定量PCR和分子标志物在海洋监测中的应用前景做进一步的展望。
- 车志群莫祖英孙仁杰阎冰
- 关键词：实时荧光定量PCR海洋污染监测
- 沼气池宏基因组文库中未培养微生物β-葡萄糖苷酶基因的克隆与鉴定被引量：5
- 2008年
- 以间接提取法提取了沼气池样品的微生物宏基因组DNA,用柯斯质粒载体pWEB:TNC构建了一个含三万个克隆的沼气池宏基因组文库,对文库中的克隆随机分析表明,该文库的外源片段平均长度为40 kb,文库的总容量为1 .2×106kb。对其中的一个在七叶苷平板上显色的阳性克隆pGXN100进行进一步亚克隆、测序和序列分析。结果表明,pGXN100上有一个全长为1 863bp的ORF,编码621个氨基酸组成的蛋白质。将该基因命名为Unglu100。与产气克雷伯菌属的一个β-葡萄糖苷酶基因AN292在核苷酸和氨基酸水平上分别有76%和85%的同源性,利用SMART软件进行预测表明,Unglu100可能是PTS中β-葡萄糖苷酶特异性的转运蛋白组件。
- 唐咸来车志群李双喜蒋建林罗奉奉武波
- 关键词：沼气池宏基因组文库Β-葡萄糖苷酶
- 六溴环十二烷胁迫下红树蚬鳃及肝胰腺线粒体基因表达定量研究被引量：1
- 2019年
- 红树蚬(Polymesoda erosa)作为一种主要栖息于潮间带的沼泽地或红树林的双壳贝类,近年来很多研究都证明其具有做为海洋污染监测指示物种的潜力。红树蚬受六溴环十二烷(HBCD)不同浓度(0、0. 086、0. 860、8. 600μg/dm^3)及不同天数(1、3、11、15、22 d)胁迫后,从转录组上调文库中挑取6个线粒体编码基因:细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ、Ⅲ(COXⅠ、COX Ⅲ),NADH脱氢酶亚基Ⅰ、Ⅲ(ND Ⅰ、ND Ⅲ),细胞色素b(Cyt b),无机焦磷酸酶(PPase),并用实时荧光定量PCR研究各基因在红树蚬各组织内的表达情况,因为基因不稳定性,利用β-actin作为内参对各目的基因所得数据进行均一化处理。结果发现:6个基因在HBCD胁迫后都有转录且差异表达。经生物统计学分析,胁迫后鳃及肝胰腺组织中各基因的表达量较对照组中有显著变化,总体上随着胁迫天数及浓度的增加呈增加趋势,但当胁迫浓度过高时,因线粒体产生的应激能力有限,表达量反而降低。最后从酶复合物在呼吸链、ROS生成、ATP合成中的作用等各方面分析了HBCD胁迫导致线粒体基因表达变化的原因,为进一步开展分子毒理研究和开发分子生物标志物在海洋监测中的应用奠定了基础。
- 车志群孙仁杰刘文爱廖思明阎冰
- 关键词：海洋生物学六溴环十二烷线粒体基因
- PCR-RFLP技术分析沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性被引量：9
- 2008年
- 应用PCR-RFLP和rRNA分析法研究了户用沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性。采用直接提取法提取了户用沼气池微生物宏基因组DNA，构建了细菌的16S rDNA克隆文库。随机挑取了144个准确含有16S rDNA的阳性克隆进行PCR-RFLP分析，聚类得到46个OTUs（operational taxonomic units），其中3个OTUs是优势类群，分别占14％，10％和9％，21个OTUs只含有单个克隆。随机挑取了26个克隆进行测序，并构建了系统发育进化树。结果表明：农村户用沼气池中细菌种类较为丰富，占优势的类群分别为Firmicutes（28％）、Delta-proteobacteria（18％）和Bacteroidetes（17％），大多数16S rDNA序列与GenBank数据库中未培养细菌相似性最高（91％～99％），为进一步研究、利用沼气池能源提供了基础资料。
- 蒋建林周权能车志群邓珍琴武波
- 关键词：沼气池RDNAPCR-RFLP细菌多样性
- 六溴环十二烷胁迫下红树蚬荧光定量PCR内参基因稳定性分析被引量：2
- 2018年
- 【目的】筛选出不同浓度六溴环十二烷(HBCD)胁迫下红树蚬(Polymesoda erosa)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的最适内参基因,用以准确校准目的基因的表达,为进一步开展分子毒理研究和开发分子生物标志物奠定基础。【方法】通过荧光定量PCR技术监测候选内参18S核糖体RNA(18S rRNA)、β-肌动蛋白(β-actin)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、α-微管蛋白(α-tubulin)等管家基因,在红树蚬各组织受不同浓度(0μg/L、0.86μg/L、8.6μg/L)六溴环十二烷(HBCD)胁迫后的表达量,利用qRT-PCR及geNorm、NormFinder、BestKeeper等分析软件对不同条件下的表达数据进行处理,从而筛选出适合荧光定量PCR的最佳内参基因。【结果】受不同浓度HBCD胁迫后,鳃及肝胰中各管家基因的表达稳定性排序整体为β-actin=α-tubulin>GAPDH>18S rRNA。【结论】可单独或共同使用两个内参基因(β-actin、α-tubulin)校准荧光定量结果。
- 车志群孙仁杰刘文爱廖思明阎冰
- 关键词：六溴环十二烷内参基因稳定性分析
- 多氯联苯胁迫下红树蚬荧光定量PCR内参基因的筛选被引量：1
- 2015年
- 【目的】筛选出多氯联苯(PCBs)胁迫下红树蚬(Polymesoda erosa)的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)最适内参基因,为进一步开展分子毒理学研究奠定基础。【方法】以β?actin、18S rRNA、GAPDH和#?tubulin为候选内参基因,qRT-PCR测定PCBs胁迫下4个候选内参基因在红树蚬外套膜、鳃、闭壳肌和肝胰腺组织中的表达水平,应用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件分析其表达稳定性。【结果】geNorm软件分析表明β?actin表达最稳定;NormFinder软件分析发现,外套膜、鳃和肝胰腺组织中β?actin的稳定性最好,闭壳肌组织中β?actin(0.454)表达稳定性略微低于#?tubulin(0.425),排第2位;BestKeeper软件分析表明,外套膜和鳃组织中β?actin最稳定,肝胰腺和闭壳肌组织中GAPDH最稳定,β?actin排位第2位。【结论】筛选β?actin为红树蚬在PCBs胁迫下的qRT-PCR最适内参基因。
- 莫祖英车志群廖思明杨明柳阎冰
- 关键词：实时荧光定量PCR内参基因
