赵明明
- 作品数：18 被引量：78H指数：6
- 供职机构：中国中医科学院更多>>
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- 相关领域：医药卫生农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 铁皮石斛S-腺苷酸脱羧酶基因DoSAMDC1的克隆及特征分析被引量：14
- 2013年
- S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosyl-L-methionine decarboxylase,SAMDC)是多胺合成的关键酶,通过调节多胺的代谢途径参与植物的多项生理生化过程。本文利用cDNA末端快速克隆技术(RACE),首次从铁皮石斛共生萌发种子中分离得到一个新的SAMDC基因,命名为DoSAMDC1(GenBank注册号JX966243),并对其编码蛋白的理化性质、保守结构域等特征进行分析。生物信息学分析表明,DoSAMDC1基因的全长为1979bp,涵盖tiny-uORF、small-uORF和mainORF3个植物SAMDC基因特征ORF。mORF编码一条368个氨基酸的肽链,预测分子质量为40.7kD,等电点为5.2,编码蛋白不含信号肽,具有22个氨基酸的跨膜域(89～110位),具有植物SAMDC的典型结构特点,包括酶原剪切位点、PEST结构域及催化功能必须的氨基酸。序列比对及系统发育树分析结果表明DoSAMDC1与单子叶植物SAMDC具有很高的同源性,与双子叶植物的亲缘关系较远。应用实时荧光定量PCR对DoSAMDC1基因在石斛不同组织中的表达模式分析发现,该基因在未接菌的植物组织中表达变化差异不大,在接菌共生萌发的植物种子中显著上调表达,为未萌发种子的2.74倍,具有受真菌侵染诱导表达的特性,揭示其可能通过参与多胺调控途径在植物?真菌共生方面发挥作用。
- 赵明明张岗张大为郭顺星
- 关键词：铁皮石斛共生萌发
- 铁皮石斛DoMAPK5基因的克隆及表达特征分析被引量：5
- 2016年
- 目的克隆及分析铁皮石斛DoMAPK5基因的表达特征。方法利用cDNA末端快速克隆技术(RACE),首次从铁皮石斛接菌共生萌发种子中分离得到1个新的MAPK基因,对其编码蛋白的理化性质、保守结构域等特征及进行了分析。并应用荧光定量PCR对DoMAPK5基因在石斛不同组织中表达模式分析。结果 DoMAPK5基因(Gen Bank注册号KJ472788),全长为2184bp、编码一条597个氨基酸的肽链,预测分子量为67.39KDa,等电点为9.28,编码的蛋白均不含信号肽,在210-232位具有23个氨基酸的跨膜域,具有MAPK蛋白家族保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的结构域及MAPK位点。序列比对及系统发育树分析结果表明DoMAPK5基因与葡萄MAPK基因均具有很高的相似性(82%),与水稻MAPK10亲缘关系最近。应用荧光定量PCR对DoMAPK5基因在石斛不同组织中表达模式分析显示,该基因在未接菌的植物组织中属组成型表达,在接菌共生萌发的植物组织中显著上调,为未萌发种子的10.49倍。结论 DoMAPK5在植物组织中属于组成型表达,具有受菌根真菌诱导表达的特征。
- 赵明明张岗张大为李标郭顺星
- 关键词：铁皮石斛共生萌发
- 两条受菌根真菌诱导的铁皮石斛CDPK基因的克隆及特征分析
- 植物钙依赖蛋白激酶（CDPKs）是细胞内最常见的Ca2+受体蛋白,在植物的生长发育、种子萌发、生物及非生物胁迫应答、离子通道运输等信号转导过程中起着重要作用。本文利用cDNA末端快速克隆技术（RACE）,首次从铁皮石斛种...
- 赵明明郭顺星
- 关键词：铁皮石斛钙依赖蛋白激酶基因表达模式共生萌发
- 文献传递
- 两条受菌根真菌诱导的铁皮石斛CDPK基因的克隆及特征分析
- 赵明明郭顺星
- 关键词：铁皮石斛钙依赖蛋白激酶基因表达模式共生萌发
- 一个受菌根真菌诱导的铁皮石斛钙依赖蛋白激酶基因的克隆及表达分析被引量：15
- 2012年
- 钙依赖蛋白激酶(calcium-dependent protein kinases,CDPKs)在从枝菌根、根瘤菌-宿主植物共生体系中起重要调控作用。然而,CDPKs在兰科菌根共生体系中的作用机制尚不清楚。本研究利用RT-PCR、RACE方法,首次从小菇真菌(Mycena sp.)侵染的铁皮石斛根中克隆到1个钙依赖蛋白激酶基因,命名为DoCPK1(GenBank注册号JX193703)。DoCPK1全长2 137 bp,编码一条由534个氨基酸组成的肽链,分子量59.61 kD,等电点6.03。DoCPK1蛋白包含CDPKs蛋白家族保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化结构域和4个Ca2+结合的EF-hand基元。DoCPK1与人参PgCPK1(ACY78680)同源性最高(85%),小麦、水稻、拟南芥CDPKs基因(ABD98803,ADM14342,Q9ZSA2)等次之,与单子叶植物CDPKs基因亲缘关系最近。DoCPK1为组成型表达,其转录本在各器官中相对表达量依次为根>茎>种子>叶。在小菇真菌侵染30 d的石斛根中,DoCPK1显著上调,为对照根中的5.16倍,表明DoCPK1参与小菇真菌-铁皮石斛菌根早期互作,可能在该共生体系中起作用。本研究为进一步阐明DoCPK1在小菇真菌-铁皮石斛菌根共生中的潜在功能奠定基础。
- 张岗赵明明李标宋超张大为郭顺星
- 关键词：铁皮石斛蛋白激酶基因表达
- 基于ROS-自噬通路调控的加味黄芪赤风汤抗Ang Ⅱ诱导的肾小球足细胞损伤机制研究
- 目的： 慢性肾脏病(chronic kidney disease，CKD)是指各种原因导致的肾脏损伤和（或）肾小球滤过率(glomerular filtration rate，GFR)下降，包括各类肾小球疾病、肾小管间...
- 赵明明
- 关键词：肾小球疾病足细胞损伤黄芪赤风汤活性氧簇
- 铁皮石斛种子接菌共生萌发SSH文库的构建及荧光定量PCR对库中5个转录产物的验证
- 为研究铁皮石斛种子接菌共生萌发的分子机制,本实验采用抑制差减杂交(SSH)技术,分别以铁皮石斛接菌萌发5周(形态学观察进入种子萌发第3级阶段)和铁皮石斛未接菌培养5周(形态学观察仍处于种子萌发0级阶段,即未萌发)的种子互...
- 赵明明郭顺星
- 关键词：共生萌发荧光定量PCR
- 文献传递
- 基于PI3K/AKT/mTOR及/AMPK/mTOR通路调控自噬探讨加味黄芪赤风汤保护足细胞机制
- 慢性肾脏病主要表现为肾小球滤过率下降和/或尿蛋白排泄增加,呈不可逆性、进行性进展。蛋白尿是慢性肾脏病进展的重要标志以及危险因素,足细胞包裹在肾小球滤过屏障毛细血管周围,足细胞足突的融合或消失是出现蛋白尿的重要原因。足细胞...
- 赵明明
- 关键词：加味黄芪赤风汤足细胞自噬
- 西藏药用植物螃蟹甲可培养内生真菌的分离、鉴定及抗HIV-1整合酶链转移活性研究被引量：6
- 2013年
- 从西藏药用植物螃蟹甲(Phlomis younghusbandii Mukerjee)的叶和茎中分离得到52株内生真菌。经分子鉴定(基于ITS序列和28S序列),内生真菌分属于Phoma、Chaetosphaeronema、Fusarium、Leptosphaeria等12属,其中拟茎点霉属(Phoma)为其优势菌群。使用原核表达的可溶型一型人类免疫缺陷病毒(humanimmunodeficiency virus type 1,HIV-1)的整合酶(integrase,IN),对52株内生真菌的发酵产物进行体外抗HIV-1整合酶链转移反应活性试验,结果发现,来自Chaetosphaeronema属真菌的7个样品对整合酶链转移反应表现出强烈的抑制作用,其对应的IC50值分别为6.60、5.20、2.86、7.86、4.47、4.56和3.23μg·mL-1。该研究表明,螃蟹甲内生真菌在发现抗HIV-1整合酶活性物质方面有进一步的开发价值。
- 张大为赵明明陈娟李超郭顺星
- 关键词：螃蟹甲内生真菌HIV-1整合酶抑制剂筛选
- 铁皮石斛促分裂原活化蛋白激酶基因DoMPK2的分子特征被引量：6
- 2013年
- 目的克隆铁皮石斛(Dendrobium officinale)促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)基因DoMPK2并进行分子特征分析。方法采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、cDNA末端快速扩增(RACE)技术分离全长基因;生物信息学分析编码蛋白的理化特性、保守结构域等特征;用DNASTAR、MEGA软件分别进行氨基酸多序列比对和进化树构建分析;借助实时定量PCR技术检测基因组织表达模式。结果 DoMPK2基因cDNA全长1 585 bp(GenBank注册号JX297595),编码一条由369个氨基酸组成的肽链,相对分子质量42120,等电点6.56。DoMPK2蛋白包含MAPK家族保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化结构域(32^-319)和MAP激酶的保守位点(67~170)。DoMPK2与多种植物MAPK基因高度相似(56%~84%),与水稻、玉米等单子叶植物MAPK基因亲缘关系较近。DoMPK2为组成型表达,其转录本在石斛种子和根中的相对表达量较高,分别为叶中的9.696、2.327倍,茎和叶中的表达变化不显著。结论 DoMPK2基因的分子特征为进一步研究其在铁皮石斛生长发育、抗逆胁迫等生命活动过程中的生物学功能奠定基础。
- 张岗张大为赵明明郭顺星
- 关键词：铁皮石斛激酶克隆基因表达实时定量PCR
