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端木慧子: 作品数：12 被引量：46H指数：5; 供职机构：东北农业大学更多>>; 发文基金：黑龙江省高校科技创新团队建设计划项目国家自然科学基金转基因生物新品种培育专项更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>

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野生大豆碳酸盐胁迫应答基因GsMIPS2的克隆及功能分析被引量：3: 2015年; 为挖掘野生大豆(Glycine soja L.G07256)耐碳酸盐关键功能基因,利用前期高通量转录组测序数据,从构建的碳酸盐胁迫基因表达谱中,选取了一个碳酸盐胁迫下显著上调表达的肌醇-1-磷酸合酶类基因。采用同源克隆的方法,获得该基因的全长cDNA,命名为GsMIPS2。实时荧光定量PCR结果显示该基因受碳酸盐胁迫诱导表达,并且其表达量具有组织特异性。将GsMIPS2基因转化拟南芥,并结合拟南芥中T-DNA插入突变体atmips2来验证其耐碳酸盐功能。结果表明,碳酸盐胁迫条件下,GsMIPS2超量表达拟南芥种子萌发率显著高于野生型,而拟南芥突变体atmips2种子萌发率显著低于野生型。上述结果表明,GsMIPS2基因在植物应答碳酸盐胁迫过程中起重要作用。; 陈晨孙晓丽刘艾林端木慧子于洋肖佳雷朱延明; 关键词：野生大豆

大豆基因组GmSRK及其同源基因的生物信息学分析: 2014年; 以野生大豆GsSRK氨基酸序列为检索序列,在Phytozome数据库中查找大豆基因组中其同源基因GmSRK。利用Phytozome数据库以及MEGA5.0,ClustalX等软件挖掘大豆基因组GmSRK同源基因,最终确定同源性较高的2个基因Glyma12g21640和Glyma08g06550。对GmSRK、Glyma12g21640和Glyma08g06550这3个基因进行基因结构,染色体定位,蛋白理化性质、一级、二级结构分析,结果表明三者均含有6个内含子,7个外显子;定位于3条不同染色体上;都具有B-lectin,S_locus_glycop,PAN_AP以及S_TKc四个结构域,属于G-type外源凝集素类受体蛋白激酶。进化树分析发现GmSRK与Glyma12g21640亲缘关系最近且与四季豆、苜蓿中同源蛋白聚为一支,Glyma08g06550与拟南芥RLKs亲缘关系较近。; 钱雪孙晓丽端木慧子成舒飞才华纪巍赵超越朱延明; 关键词：大豆类受体蛋白激酶生物信息学

一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用: 本发明公开了一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用。本发明保护一种miRNA，如序列表的序列2所示。编码所述miRNA的基因也属于本发明的保护范围。本发明还保护一种RNA(miRNA的前体)，如序列表...; 孙晓丽朱延明端木慧子王孙婷孙中文

一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用: 本发明公开了一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用。该蛋白质，是如下a)或b)的蛋白质：a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取...; 朱延明孙晓丽端木慧子肖佳雷孙明哲; 文献传递

一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用: 本发明公开了一种miRNA、miRNA的前体、以及它们的编码基因和应用。本发明保护一种miRNA，如序列表的序列2所示。编码所述miRNA的基因也属于本发明的保护范围。本发明还保护一种RNA(miRNA的前体)，如序列表...; 孙晓丽朱延明端木慧子王孙婷孙中文; 文献传递

野生大豆叶片蛋白质组双向电泳技术体系的优化研究被引量：5: 2015年; 为给野生大豆蛋白质组学分析提供技术支撑,以耐盐碱野生大豆叶片为材料,对Tris-饱和酚法、Tris-HCl法和TCA-丙酮法3种蛋白质提取方法进行了比较,并对蛋白上样量、等电聚焦参数及凝胶浓度进行了优化。结果表明:使用Tris-饱和酚法提取蛋白质,上样量为2 000μg,等电聚焦90 000 V·h,凝胶浓度为10%时,可获得背景清晰、蛋白点数较多、重复性较好的蛋白双向电泳图谱。; 张宁孙晓丽端木慧子于洋纪巍朱延明; 关键词：野生大豆叶片蛋白质提取双向电泳蛋白组学

大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达被引量：11: 2013年; 利用生物信息学手段,结合公共大豆基因组数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并进一步对基因的组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族;定位分析表明,94个GST基因分布于大豆的16条染色体上。表达分析结果表明,14个不同发育阶段,大多成员至少在一个组织中表达,11差异表达的基因中有7在根中表达,另外4在其它部位优势表达,基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族的功能及其抗逆利用提供基础。; 江董丽才华端木慧子朱延明; 关键词：差异表达基因

一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用: 本发明公开了一种与植物抗逆性相关蛋白及其编码基因GsMSRB2与应用。该蛋白质，是如下a)或b)的蛋白质：a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取...; 朱延明孙晓丽端木慧子肖佳雷孙明哲; 文献传递

大豆MYB转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析被引量：15: 2016年; MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,近年的研究表明其广泛参与多种生物学过程。MYB转录因子在其N端含有其特有的DNA结合基序(MYB-binding domain),能够与DNA分子大沟结合而调控基因表达。本研究通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选鉴定出了304个大豆MYB类转录因子,并对其进行了分类和保守结构域分析;通过与拟南芥的MYB基因进行系统发生分析,将304个大豆MYB转录因子分为了22个亚类;染色体定位分析表明大豆MYB转录因子在所有染色体上都有分布,部分染色体间的MYB蛋白序列高度相似,表明此类基因在进化上具有相同的来源;利用野生大豆盐、碱胁迫下转录组数据,分析MYB基因的表达模式,发现部分MYB转录因子能够响应盐、碱胁迫的诱导,且在盐、碱胁迫下具有不同的表达模式。; 成舒飞端木慧子陈超刘艾林肖佳雷朱延明; 关键词：大豆 MYB 转录因子生物信息学

大豆GmUGD基因家族生物信息学分析被引量：5: 2015年; 尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGD)是多糖合成中的一个关键酶,广泛参与植物生长发育与非生物胁迫响应过程。采用生物信息学方法,在全基因组水平预测出10个大豆Gm UGD基因;序列分析结果显示,Gm UGD基因均具有UDP-葡萄糖/GDP-甘露糖脱氢酶家族的3个典型结构域;基因复制分析表明,80%Gm UGD基因存在复制事件;系统发生分析结果显示,Gm UGD基因分为三类,分类结果与基因复制分析结果基本吻合;基于Uni Gene数据库与GEO数据库的表达模式分析显示,根中Gm UGD基因的ESTs最多,上胚轴中最少;另外,Gm UGD基因能够响应盐碱胁迫诱导,在大豆根和叶中表达模式不同。结果可为进一步研究大豆Gm UGD基因功能提供理论依据。; 朱延明朱毅端木慧子肖佳雷于洋刘艾林; 关键词：大豆生物信息学