秦洋
- 作品数:8 被引量:5H指数:1
- 供职机构:烟台大学计算机学院更多>>
- 发文基金:山东省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于潜在语义分析的真核启动子识别
- 基因识别是指采用生物学实验或计算机等手段来识别DNA序列上的具有生物学特征的片段,是生物信息学的一个重要分支。启动子是DNA序列上的一段重要的基因调控序列,标志着转录起始点的位置,可以用来定位基因。本文研究的启动子识别算...
- 秦洋
- 关键词:语义分析DNA序列
- 文献传递
- 基于潜在语义分析的启动子识别
- 本文提出一种基于潜在语义索引的启动子预测方法,给出了算法的详细描述。利用该算法对6个基因序列上的启动子进行查找,实验结果比现有文献结果略好一些。
- 秦洋王立宏武栓虎宋宜斌
- 关键词:潜在语义索引启动子
- 文献传递
- 基于潜在语义差异的医学网页聚类被引量:2
- 2008年
- 采用潜在语义索引的全局模型和局部模型表示医学网页时,模糊聚类结果的类间包含度很大。该文提出一种新的潜在语义差异模型,将医学网页中的文本抽取出来并分别采用全局模型、局部模型和差异模型进行表示,利用FCM算法进行聚类并计算类间包含度。实验发现,对给定的5类医学网页进行聚类时,采用差异模型时的类间包含度平均约为全局模型的85%、局部模型的80%。
- 米晓芳秦洋王立宏宋宜斌
- 关键词:潜在语义索引文本挖掘FCM聚类包含度
- 基于潜在语义差异的医学网页分类
- 通过分析潜在语义索引的各种模型提出一种新的潜在语义差异模型。将医学网页中的文本抽取出来并分别采用全局模型、局部模型和差异模型进行表示,利用SVM算法进行分类并计算分类正确率和F<,1>指标。实验发现:在差异模型表示下,分...
- 米晓芳秦洋王立宏宋宜斌
- 关键词:潜在语义索引文本分类SVM算法
- 文献传递
- 启动子的潜在语义索引差异识别算法被引量:1
- 2010年
- 启动子是基因前面的一个短序列,定位启动子即能找到基因,因此启动子的识别具有重要意义.潜在语义索引差异模型(DLSI)能够扩大类间的差异,降低噪声的干扰,从而提高识别的精度.本文提出基于DLSI的启动子识别算法,利用潜在语义索引差异模型进行特征词选择,通过将样本变换到潜在语义空间中实现降维,建立了启动子-外显子、启动子-内含子分类器,把两分类器的串联结果作为最终的分类结果.实验验证了算法的有效性.
- 秦洋王立宏武栓虎宋宜斌
- 关键词:潜在语义索引启动子识别
- 基于拉普拉斯矩阵的DNA序列集相似性分析被引量:1
- 2009年
- 研究两个序列集合之间相似性度量,提出基于拉普拉斯矩阵特征值的分离度概念和公式表示.基于人工序列和真实DNA序列上的实验结果,证实了分离度能够度量序列间的相似程度.
- 秦洋王立宏武栓虎宋宜斌
- 关键词:拉普拉斯矩阵启动子DNA序列
- 基于拉普拉斯矩阵的DNA序列集相似性分析
- 研究两个序列集合之间相似性度量,提出基于拉普拉斯矩阵特征值的分离度概念和公式表示。在人工序列和真实DNA序列上的实验结果,证实了分离度能够度量序列间的相似程度。
- 秦洋王立宏武栓虎宋宜斌
- 关键词:拉普拉斯矩阵启动子DNA序列
- 基于潜在语义差异的医学网页分类
- 通过分析潜在语义索引的各种模型提出一种新的潜在语义差异模型。将医学网页中的文本抽取出来并分别采用全局模型、局部模型和差异模型进行表示,利用 SVM 算法进行分类并计算分类正确率和 F指标。实验发现:在差异模型表示下,分类...
- 米晓芳秦洋王立宏宋宜斌
- 关键词:潜在语义索引文本分类
- 文献传递