王飞飞
- 作品数:3 被引量:1H指数:1
- 供职机构:上海大学理学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:生物学理学自动化与计算机技术更多>>
- 微丝相关蛋白HSPC300/hHBRK1与肌球蛋白VI相互作用位点的计算机预测
- 本文首先从结构角度出发,由于微丝相关蛋白HSPC300/hHBRK1的结构信息缺失,我们在SWISS-MODEL工作平台上,构建了该蛋白质的同源结构作为配体信息。同时利用SYBYL7.0软件,对配体和受体肌球蛋白VI的结...
- 王飞飞
- 关键词:结构信息
- 文献传递
- 应用支持向量机预测蛋白质相互作用位点被引量:1
- 2008年
- 蛋白质相互作用位点的识别对于突变设计和预测蛋白质相互作用的网络是非常重要的.基于支持向量机学习方法,该文提出一种用于预测蛋白质相互作用位点的有效数据属性抽取方法,该方法利用蛋白质的序列信息、蛋白质残基的可及表面积和进化率来构造向量,通过十倍交叉验证来对数据进行训练和预测.实际计算的结果显示,该方法的准确率为72.19%,比只利用序列信息和进化率信息的方法提高了5.71%.
- 孟炜王飞飞彭新俊沈称意王翼飞
- 关键词:支持向量机
- 微丝相关蛋白HSPC300/hHBRK1与肌球蛋白Ⅵ相互作用位点的计算机预测
- 2010年
- HSPC300/hHBRK1蛋白作为BRK1的人类同源蛋白,参与细胞运动和物质运输.肌球蛋白Ⅵ是肌球蛋白家族的成员.HSPC300/hHBRK1和肌球蛋白Ⅵ共同定位于细胞的胞浆,hHBRK1可能通过与肌球蛋白Ⅵ相互作用,参与细胞内的物质运输.从结构角度出发,通过计算机模拟蛋白质间相互作用,预测二者作用区域,找出相关残基PHE43,LYS105,THR676和LEU40,即可能成为相互作用位点的重要残基,为进一步实验研究提供了重要信息.
- 王飞飞薛晓怡王翼飞