王延群
- 作品数：10 被引量：98H指数：6
- 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家科技重大专项中国疾病预防控制中心青年科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 浙南地区重症肺炎住院儿童中常见呼吸道病毒感染的检测分析被引量：9
- 2015年
- 目的了解重症社区获得性肺炎（CAP）儿童中常见呼吸道病毒感染情况及人腺病毒（HAdV）感染的分子型别与临床特征。方法收集浙南地区293份住院重症CAP儿童的痰吸液,使用PCR方法,进行16种呼吸道病毒检测,并对其中人腺病毒阳性样本进行分型分析与临床特征分析。结果常见呼吸道病毒检出率为92.8%（272/293）,其中以呼吸道合胞病毒（RSV）（37.2%,109/293）、人博卡病毒（HBoV）（22.5%,66/293）、人鼻病毒（HRV）（17.1%,50/293）等检出率较高。人腺病毒共检出24份（8.2%,95%CI4.9%～11.5%）阳性,以2岁以下儿童易感。人腺病毒阳性样本中,C组占83.3%（20/24;HAdV-2：8例,HAdV-5：6例,HAdV-1：5例,HAdV-6：1例）,B组占12.5%（3/24;HAdV-3：2例,HAdV-7：1例）,E组（HAdV-4）1份。临床症状除咳嗽外其余在HAdV感染者与非感染者中差异均无统计学意义。结论浙南地区重症社区获得性肺炎住院儿童痰吸液样本中常见呼吸道病毒感染检出率较高,人腺病毒也是较常见的病原体,且以C组中的1、2、5型最为常见。
- 李亚敏周为民赵彦杰林峰王延群陆柔剑楼永良谭文杰
- 关键词：社区获得性肺炎人腺病毒基因分型分子检测
- 重症急性呼吸道感染患儿中人鼻病毒分型检测及流行病学分析被引量：9
- 2015年
- 目的:调查重症急性呼吸道感染患儿中人鼻病毒(HRV)的感染情况,初步了解不同型别HRV流行病学和临床特点。方法:收集2008年5月至2010年3月北京儿童医院重症急性呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物样本259份,采用巢式PCR法,先用鼻病毒5′UTR引物筛查样本中该病毒总的感染情况,再用针对VP4-VP2区域的引物对阳性样本进行分型检测;同时对阳性样本进行其他常见呼吸道病毒共感染检测与流行病学及临床特点分析。结果:259例样本中,5′UTR初筛HRV阳性89例(34.4%),与其他常见呼吸道病毒存在共感染54例(60.7%);可通过VP4-VP2分型测序确定39例HRV-A(48.1%)、4例HRV-B(4.9%)、38例HRV-C(46.9%);HRV-A感染率最高的季节分布是秋季;HRV-A和HRV-C型感染者在临床特点上无明显差别。结论:HRV是儿童重症急性呼吸道感染的重要病原之一,新发现的HRV-C基因型感染率与HRV-A相似,但HRV在儿童重症急性呼吸道感染中的病原学意义还须进一步确认。
- 赵彦杰陆柔剑李亚敏王延群谢正德楼永良谭文杰
- 北京、上海严重急性呼吸道感染儿童中肠道病毒D68的检出与基因特征分析被引量：13
- 2016年
- 为了解肠病毒D68（EV-D68）在北京、上海地区严重急性呼吸道感染（SARI）儿童中的流行情况和分子特征。本研究采集2008～2010年北京儿童医院SARI儿童呼吸道样品259份,2013～2014年上海复旦大学附属儿科医院SARI儿童呼吸道样品441份,采用套式RT-PCR结合测序方法检测筛选EV-D68阳性样品,设计EV-D68全基因组通用引物,对EV-D68阳性样品进行全基因组扩增,收集NCBI核酸数据库中目前所有的EV-D68全基因组序列进行序列分析,比较EV-D68中国和美国流行株的差异。结果发现：北京地区检测EV-D68阳性样品1例,阳性率为0.4%,上海地区检测EV-D68阳性样品4例,阳性率为0.9%。结合目前中国已上传的所有EV-D68相关序列,分析表明：目前中国地区流行的EV-D68主要属于Clade A2或Clade B2亚型,不同于美国的Clade A1、Clade B1、Clade B4和Clade B5亚型,另外EV-D68部分基因进化分析时出现树形结构冲突现象;上述结果表明目前EVD68在北京、上海地区的SARI儿童群体中的感染率较低（5/700;〈1%）;中国与美国流行的EV-D68毒株属于不同的分支,差异较大,部分序列分析表明EV-D68病毒可能存在组内重组现象。
- 王延群赵彦杰沈军谢正德李亚敏刘高山楼永良陆柔剑谭文杰
- 环介导逆转录等温扩增技术检测中东呼吸综合征冠状病毒基因被引量：6
- 2015年
- 建立了基于浊度仪和羟基萘酚蓝(Hydroxy naphthol blue,HNB)颜色变化的简单、快速和灵敏的环介导逆转录等温扩增技术(RT-LAMP)检测方法,应用于中东呼吸综合征冠状病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)的检测。针对MERS-CoV的核衣壳蛋白基因(Nucleocapsid,N)设计6条特异引物,在等温条件下(63℃)进行60min扩增反应。通过实时浊度仪记录扩增曲线和扩增前在反应体系中加入HNB观察颜色变化两种方式进行检测结果判定。本文对不同人类冠状病毒及常见呼吸道病毒进行了特异性验证,对梯度稀释的体外转录MERS-CoV全N基因RNA进行了定量和检测限分析,同时与已发表的实时荧光定量PCR(rRT-PCR)进行比较。结果显示,本研究建立的RT-LAMP方法特异性高,对于每反应管103至106的拷贝数RNA,出峰时间与每反应管N基因RNA拷贝数对数值有稳定的线性关系。基于浊度仪和颜色判定的RT-LAMP检测方法检测限分别为500拷贝和1 000拷贝。因此,该方法有望应用于MERS-CoV感染的快速筛选,具有在基层医疗卫生机构和现场推广和应用的潜力。
- 关丽聂凯张丹李鑫娜王延群谭文杰马学军
- 急性呼吸道感染相关病毒组学研究进展被引量：3
- 2014年
- 随着人类社会的发展,人与大自然、野生动物的接触日益频繁,人员沟通旅行逐年增多,新发传染病频发。其中呼吸道传染病最为突出,2003年SARS疫情暴发,使人们重新认识了冠状病毒,并开始意识到越来越多的动物源病毒可能跨种传播[1]。2009年墨西哥、美国暴发甲型H1N1流感,夺走了数万人的生命,表明流感病毒的变异、重组速度加快,新发病毒的检测和疫苗的研发需要不断的更新[2-3]。
- 王延群谭文杰
- 关键词：急性呼吸道感染
- 重症急性呼吸道感染儿童中人博卡病毒的分型检测与基因进化分析被引量：6
- 2014年
- 目的 了解重症急性呼吸道感染住院儿童中人博卡病毒（HBoV）的感染状况,流行病学特征及其进化特征.方法 采用巢式PCR的方法,对来自北京儿童医院重症急性呼吸道感染住院儿童的259份鼻咽抽吸物,进行人博卡病毒（HBoV）分型检测与测序,同时进行了合并感染检测、流行病学、临床特点及基因多态性分析.结果 共检出56份人博卡病毒感染阳性标本,阳性率为21.6％,[95％ CI（16.0％～27.3％）,P＜0.0001],其中2岁以下儿童感染率较高.与其他呼吸道常见病毒的合并感染率为94.6％.HBoV阳性产物测序分析发现,人博卡病毒1型占96.4％ （54/56）,2、3型各1份.HBoV阳性株分型区（VP1/VP2）序列变异不明显.结论 人博卡病毒是儿童急性呼吸道感染常见的病原体,以I型最为常见,分型区（VP1/VP2）序列较保守.HBoV在重症急性呼吸道感染儿童中是否起到真正的致病作用还需进一步的研究.
- 李亚敏周为民王延群赵彦杰陆柔剑谢正德谭文杰
- 关键词：博卡病毒呼吸道感染种系发生
- 中国首例输入性中东呼吸综合征冠状病毒结构基因与附属基因的序列分析被引量：9
- 2015年
- 针对中国首例实验室确诊输入性MERS-CoV感染病例,采用鼻咽拭子样品进行核酸提取、基因扩增与测序,获得MERS-CoV_ChinaGD01结构蛋白与附属蛋白编码基因,包括S基因、E基因、M基因、N基因、ORF3、ORF4a、ORF4b、ORF5和ORF8b基因序列。根据S基因进化分析发现中国输入性病例中MERS-CoV虽有少数位点变异,但仍与近年沙特流行株相近,属于MERS-CoV亚型5,N、E、M等结构基因核苷酸变异较少。附属蛋白进化分析表明:ORF3、ORF4a、ORF4b、ORF5均有一定的核苷酸替换,而ORF8b相对保守。总之,中国首例输入性MERSCoV与已发表序列相比总体表现为保守,但在部分基因序列上有一定的变异。这是中国首例输入性MERS-CoV的第一次基因分析结果报道,可为该MERS-CoV感染特点的进一步研究及相关疾病的防控提供参考。
- 陆柔剑邹丽容王延群赵彦杰周为民武婕王文玲武桂珍柯昌文谭文杰
- 关键词：冠状病毒进化分析
- 人原代呼吸道上皮细胞体系分离人冠状病毒HKU1的方法及其复制特点被引量：8
- 2015年
- 目的 建立分化良好的人原代呼吸道上皮细胞（HAE）培养方法,从北京地区重症肺炎患儿呼吸道样本中分离人冠状病毒HKU1（HCoV-HKU1）并对其复制特点进行初步分析.方法 采用气-液两相的方法诱导原代HAE细胞体外分化成假复层纤毛柱状上皮结构,接种经PCR方法鉴定HCoV-HKU1单阳性的北京儿童医院住院患儿鼻咽拭子样本,进行病毒的分离培养.通过荧光定量PCR与序列分析检测病毒复制动力与遗传稳定性.结果 HCoV-HKU1可在HAE中复制,产生有活性的子代病毒,细胞上清中的子代病毒在接种后96 h达到高峰.子代病毒在HAE传代过程中基因相对保守.结论 在国内首次采用人原代呼吸道上皮细胞从重症肺炎患儿呼吸道样本中分离到人冠状病毒HKU1毒株并确定其复制特性.
- 朱娜牛培华赵彦杰王文宋敬东王延群陆柔剑苏崇玉王翀昊刘志东谭文杰
- 关键词：冠状病毒属
- 重症急性呼吸道感染儿童中人腺病毒感染的型别分布及其流行病学特征被引量：38
- 2015年
- 腺病毒是Rowe等于1953年在人的腺样组织中被发现，并因此而得名。人腺病毒感染在全球范围广泛流行，可引起多种疾病。其分型检测主要方法是PCR结合测序。国内外关于婴幼儿急性呼吸道感染中腺病毒的检测及临床特征的分析已有不少报道，但多数研究不进行具体分型分析，且对于近年来我国严重急性呼吸道感染（severe acute respiratory infection, SARI）住院儿童中人腺病毒的分型分布及相关流行病学特点的研究较少。为此，本研究对来自北京某儿童医院内SARI住院儿童鼻咽抽吸物进行人腺病毒的分型检测与分析。
- 李亚敏周为民赵彦杰张晨王延群谢正德谭文杰
- 关键词：呼吸道感染分型检测
- HCoV-NL63中国株全长cDNA感染性克隆及相关RNA病毒载体
- 本发明通过病毒RNA提取、RT-PCR、克隆测序的方法首次获得了HCoV-NL63国内株全长基因组序列信息，并且该国内株处于一个新的基因型。在此基础上，通过体外连接、体外转录、电转染宿主细胞的方法获得了HCoV-NL63...
- 谭文杰耿合员杨扬王延群
- 文献传递
