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汤宇舟
作品数:
1
被引量:10
H指数:1
供职机构:
中国科学技术大学物理学院天文学系
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发文基金:
北京市自然科学基金
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
陈慰祖
北京工业大学
王存新
北京工业大学
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作者
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王存新
1篇
汤宇舟
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陈慰祖
传媒
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生物物理学报
年份
1篇
2000
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短杆菌肽A-DMPC通道内离子输运的分子动力学模拟
被引量:10
2000年
用最近提出的构建膜体系初始构象的有效方法 ,构建了在DMPC脂膜环境下短杆菌肽A通道模型 (GA -DMPC)。通过对Na +、Ca2 +、Cl-三种不同离子在GA -DMPC通道内不同位置的分子动力学模拟 ,研究离子在通道内输运过程中与通道及通道内水分子的相互作用 ,从分子动力学的角度阐明离子在通道内的输运机制。主要计算结果表明 :(1)离子在通道内的输运使GA的构象发生变化 ,GA的柔性是离子在通道内通透的重要因素 ;(2)Cl- 离子可扩大通道半径 ,Na+ 离子和Ca2 +离子则减小通道半径。Cl-离子不能在GA通道内通透 ;(3)离子的出现使通道内水分子的偶极方向发生变化。上述结果均与实验相符。
陈慰祖
汤宇舟
王存新
关键词:
离子输运
分子动力学模拟
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