杨恩 作品数:15 被引量:75 H指数:6 供职机构: 昆明理工大学生命科学与技术学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 云南省应用基础研究基金 更多>> 相关领域: 轻工技术与工程 生物学 农业科学 医药卫生 更多>>
一株拟南芥晚花突变体的分子分析 2013年 植物的开花时间直接控制植物营养生长期和生育期的长短,在相当程度上决定着繁育的成功与否,也与植物的产量和质量性状密切相关.拟南芥花期改变突变体是植物开花调控机制研究重要的植物材料.研究利用前期研究中获得的一株稳定遗传的、晚花表型的T-DNA插入拟南芥突变体pex2为材料,对其进行开花相关表型分析、T-DNA插入位点鉴定及插入位点基因转录分析等研究,结果表明:pex2突变体中存在单一的T-DNA插入,该插入位点位于PEX2基因下游约1 800 bp处,且该位点的插入引起了PEX2全长转录产物的缺失.该研究为进一步探索pex2突变体晚花机制及拟南芥PEX2基因与晚花表型之间的相关性研究,提供了研究材料. 牛杰振 严金平 杨恩 伊日布斯关键词:花期调控 拟南芥 LC-MS分析三七根腐病的皂苷类成分变化 被引量:3 2015年 以高分辨的液质联用(LC-MS)技术分析正常三七和根腐病三七中皂苷类成分差异,检测新鲜药材中过氧化氢(H2O2)和丙二醛(MDA)的浓度,探讨其变化可能的原因.正常三七中确定13个色谱峰,而根腐病三七中新产生7种成分,多为三七皂苷的氧化产物.此外,发现根腐病三七较正常的氧化水平显著提高(P<0.01).推测根腐病三七的皂苷类成分变化可能是由于病害后引起氧化水平升高而形成的氧化产物. 泰瑞清 谈文状 杨恩 冯阳 李海舟关键词:根腐病 皂苷 LC-MS 不同植物乳杆菌发酵液抑菌活性及其主要有机酸组成比较(英文) 被引量:11 2019年 对分离自云南传统发酵食品的18株植物乳杆菌代谢产物的主要有机酸成分及对病原菌抑菌活性进行分析。采用Spot-on-lawn及琼脂扩散法研究不同植物乳杆菌代谢产物抑菌活性;通过高效液相色谱法分析主要有机酸的种类和产量;选取其中3株植物乳杆菌对其进行包括生长曲线、pH值、抑菌活性在内的动态监测。结果表明,抑菌活性取决于不同的植物乳杆菌菌株、病原菌及发酵碳源。当大肠杆菌O157:H7作为病原菌、葡萄糖作为碳源时,植物乳杆菌YmL-4-5具有最高的抑菌活性;当沙门氏菌ATCC 6538作为病原菌、果糖作为碳源时,植物乳杆菌S5抑菌作用最强。数据证明植物乳杆菌发酵液的抑菌活性受上清液低pH值的影响,且主要抑菌物质为有机酸。有机酸的主要成分是乳酸(930.9~3 008.7μg/mL),其次为苹果酸和乙酸。其中乳酸和乙酸的产量与其对大肠杆菌O157:H7的抑菌活性呈正相关(r分别为0.474、0.488,P<0.05)。本研究为研发新的生物防腐剂提供了理论依据。 李书鸿 柳陈坚 任贝贝 李强坤 罗义勇 杨恩 李晓然关键词:植物乳杆菌 有机酸 抑菌活性 副干酪乳杆菌胞外多糖抗氧化活性分析 被引量:7 2019年 为评价干酪乳杆菌生物合成胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)抗氧化活性,本文分离纯化高产胞外多糖的三株副干酪乳杆菌(3号、5号和7号)的胞外多糖,并对其DPPH·、·OH和O-2清除率分别进行测定,评价其体外抗氧化活性。通过分析EPS对H2O2诱导氧化损伤293T细胞的保护作用,评价其胞内抗氧化活性。结果表明,当EPS浓度为400μg/mL时,其DPPH·、·OH和O-2的清除率最高,分别为8.87%(5号)、88.94%(7号)和34.55%(7号),其中对·OH清除能力高于抗坏血酸(65.87%),且三株菌株之间没有明显差异。3号副干酪乳杆菌所产EPS显著提高超氧化物歧化酶(SOD)活性、总抗氧化能力(T-AOC)活性并抑制了丙二醛(MDA)的生成(P<0.05),且与多糖浓度呈正相关。因此,3株副干酪乳杆菌胞外多糖具有良好的抗氧化活性,作为天然抗氧化剂具有良好的应用潜力。 李卫娜 赵波 柳陈坚 杨恩关键词:副干酪乳杆菌 胞外多糖 抗氧化活性 基因工程慕课建设探讨——以昆明理工大学为例 被引量:2 2019年 基因工程是生命科学相关专业重要的专业课程,具有内容多、理论性强、概念抽象、技术性强等特点。传统的教学对于学生掌握相关理论知识和实验操作具有一定的难度,采用基于"互联网+"的慕课平台辅助日常教学极为必要。昆明理工大学在基因工程慕课建设中组建起优秀的教学团队,重新编写教学大纲,对教学内容进行梳理和模块划分,用幻灯片突出重点和核心内容,并且拍摄和制作出高质量的慕课教学视频。这些宝贵的经验可以为其他相关课程的慕课制作提供参考。 李晓然 柳陈坚 杨恩 罗义勇 冯阳 潘卉关键词:基因工程 教学改革 发酵条件对植物乳杆菌叶酸合成的影响 被引量:1 2020年 选择1株高产叶酸的植物乳杆菌4-3,探讨在脱脂奶和豆浆两种发酵基质中,不调节pH值和使pH值稳定在6.0对其生长状况和叶酸合成的影响。结果显示,以豆浆为发酵基质时叶酸含量更高;控制培养基pH 6.0,植物乳杆菌4-3在其生长对数期后仍然可以保持较高的活细胞密度,且促进叶酸的积累。实时荧光定量聚合酶链式反应结果显示,控制pH 6.0能促进叶酸合成相关基因的表达。 李强坤 柳陈坚 罗义勇 杨恩 李晓然关键词:植物乳杆菌 叶酸 PH值 香蕉MADS-Box基因家族的生物信息学分析 被引量:10 2013年 MADS-box基因家族是具有多种生物功能的转录因子,广泛参与植物的生长发育过程以及逆境应答。为了探索MADS-box基因家族在香蕉果实发育到后熟衰老过程中的功能,本文对71个香蕉MADS-box基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:13个香蕉MADS-box基因没有内含子,5个有较长的上游序列;71个香蕉MADS-box蛋白中有52个偏碱性或者强碱性,8个显中性,11个偏酸性;除5个以无规则卷曲为主要构成元件外,香蕉MADS-box蛋白主要以α-螺旋为主要构成元件;大多数MADS-box蛋白定位于细胞核和线粒体基质,少许分布在其他细胞器;基序1(MADS domain)是该家族的保守基序;此外,进化分析发现,香蕉MADS-box基因家族基因主要是II型,I型仅有6个。另外,现有香蕉MADS-box基因家族中,只有37个可查EST序列。 张远森 秦晓萌 严金平 张昆林 杨恩关键词:香蕉 生物信息学 耐热毛栓孔菌S0301同核体菌株的快速鉴定及产漆酶能力比较 2019年 栓孔菌属(Trametes)真菌菌株漆酶同工酶种类多,产漆酶优势独特,是重要的工业漆酶来源之一.为建立方便快捷的获得同核体菌株的方法,以高产漆酶耐热毛栓孔菌Trametes trogii S0301为研究对象,在利用原生质体再生技术得到再生单菌、通过PCR克隆获得该菌株交配型基因b1、b2位点序列的基础上,设计b1、b2交配型基因特异引物并对各再生菌落中不同交配型基因类型进行识别,结合经典的锁状联合显微镜观察,共从45个性状稳定的再生菌株中获得了19个b1b2型异核体菌株,26个b1型同核体菌株,同核体菌株检出率为57.8%,且PCR鉴定结果和锁状联合观察结果一致.此外,还发现b1型同核体菌株菌丝细、菌落稀疏,有更快的蔓延速度,在不添加漆酶诱导剂Cu2+的固体培养基中表现出更强的产漆酶能力.本研究表明PCR克隆交配型基因的方法适用于同核体菌株的快速鉴定,同时b1型同核体菌株具有产漆酶的优势. 高升 张宇 伍圆圆 杨恩 徐慧妮 伊日布斯 陈玉惠 严金平关键词:漆酶 原生质体制备 用于GWAS结果后续研究的PBA方法简介 2016年 自提出全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)设想以来,在人类复杂疾病和水稻农艺性状关联研究方面,GWAS已得到广泛运用。但作为一种典型的单标记研究方法,GWAS不能检测小效应的遗传变异,而稀有变异间的联合效应往往与表型密切相关,因此,需对GWAS结果进行深入的数据挖掘。基于通路的分析方法(pathway-based analysis,PBA)就是利用基因功能、生物代谢通路等相关信息建立的对GWAS结果进行二次挖掘的方法。该方法能从GWAS结果挖掘出与性状、疾病相关联的通路及具有相同功能的基因集等数据,从而获得更多的遗传信息。现对PBA的出现、计算方法和相关软件进行简要综述,以期为人们进行通路分析提供参考。 张远森 司天昭 杨恩关键词:单核苷酸多态性 生物信息学 农艺性状 植物乳杆菌近亲种中叶酸生物合成途径的基因多态性分析 2018年 研究从传统发酵食品中分离植物乳杆菌并进行近亲种鉴定,通过直接测序法对8株植物乳杆菌近亲种的叶酸生物合成途径中5个关键基因fol B,fol E,fol K,fol P和fol Q进行扩增,并采用系统进化分析、核苷酸和氨基酸序列比对对基因多态性进行分析.结果发现,fol B,fol E和fol K基因具有较高的同源性,同时存在1处同义替换的SNP位点,fol P基因存在的14处SNP位点中,仅1处发生非同义替换,说明这些基因在氨基酸水平上相对保守.8株植物乳杆菌近亲种存在fol Q基因,但编码蛋白与Fol Q蛋白不具有同源性,故推测其拥有与Fol Q蛋白功能相似的生物酶,这些拟似酶有待进一步克隆鉴定与功能研究.本实验为植物乳杆菌近亲种中叶酸生物合成途径的分子调控机理提供前期基础. 任贝贝 李晓然 罗义勇 杨恩 柳陈坚关键词:植物乳杆菌 叶酸 基因多态性 发酵食品