杨强
- 作品数：3 被引量：0H指数：0
- 供职机构：哈尔滨医科大学生物信息学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于BLASTn序列比对筛选芯片重复探针
- 在基因芯片数据中,对缺失值和重复检测值的不同预处理会对后续分析产生很大影响。针对重复检测值,本文提出基于BLASTn局部序列比对方法,对注释到同一条Unigene的多条克隆进行优化筛选,从而获取更准确的基因表达谱数据。同...
- 杨强
- 关键词：基因表达谱
- cDNA芯片中重复检测值的处理方法对差异表达基因选择的影响
- 2008年
- 采用六套cDNA数据,两种常用的方法处理表达谱中对应同一条Unigene的多条克隆的表达值,分析对利用SAM和T-test筛选差异基因的影响。结果显示:表达谱中对应同一条Unigene的多个克隆之间的相关性不高,并存在许多负相关;两种处理重复检测值的方法对差异表达基因的选择有很大的影响。
- 吕莹丽于梁梁郭政王栋杨强
- 关键词：差异表达基因基因表达谱
- cDNA芯片重复探针检测值的一致性分析
- 2009年
- 通过SOURCE数据库对4套cDNA数据的探针进行了注释,分析了对应同一条Unigene的多个探针的检测值(即重复检测值)之间的相关性。采用两种常规方法处理了重复检测值,比较了这两种处理方法对筛选差异表达基因的影响。结果显示:Unigene的重复检测值之间存在一定比例的负相关;更新探针注释数据后的重复检测值之间的低相关比例减少,高相关比例显著提高;重复点样探针之间的相关性高于其它重复检测值,但是仍有很多低相关;两种处理重复检测值方法对于用基因表达差异显著性分析方法(SAM)与T检验方法筛选差异表达基因影响不大。
- 于梁梁王栋吕莹丽肖会杨强王晨光郭政李霞
- 关键词：差异表达基因相关系数探针
