李红燕
- 作品数：9 被引量：11H指数：2
- 供职机构：中南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金创新研究群体科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 基于BLAST算法的序列分析软件开发
- 生物信息学/(Bioinformatics/)发展至今,工作重心已经从数据的积累转移到数据的分析上,特别是应用于序列分析的软件开发已经成为一大热点。随着大量生物信息学软件的开发与应用,生物学研究的效率得到了很大的提高。
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- 李红燕
- 关键词：生物信息学BLAST软件开发JAVAECLIPSE
- 文献传递
- 献血人群HbA1c调查及其与红细胞储存损伤相关性研究
- 目的:本研究目的是调查湖南地区合格献血者HbA1c的影响因素和分布特征。探究献血者HbA1c对红细胞储存的影响,并进一步探索HbA1c影响红细胞储存的初步机制。方法:本研究于2021年4月至2022年3月在岳阳中心血站、...
- 李红燕
- 关键词：献血者糖化血红蛋白红细胞氧化应激
- MATLAB 7．X生物信息工具箱的应用——基因序列分析(一)被引量：1
- 2008年
- MATLAB 7.X生物信息工具箱为广大用户提供了一个用于基因组和蛋白质组分析的综合环境,它利用数据库资源,使科学研究事半功倍,在工具箱提供的开放环境里,用户甚至可以按照自己的目的来设计和利用分析工具。本文主要介绍了MATLAB7.X生物信息工具箱在基因序列分析中的应用,包括确定核苷酸组成,密码子组成,氨基酸转化和组成等,所有操作简便高效,结果可视化程度高。
- 刘新星李红燕杨英杰
- 关键词：生物信息工具箱开放阅读框密码子
- MATLAB 7．X生物信息工具箱的应用——基因芯片分析(三)被引量：1
- 2008年
- 本文主要介绍生物信息工具箱在基因芯片图像和数据处理方面的应用,通过基因芯片数据的基因表达图谱研究基因表达水平,比较健康组织和病变组织的区别,并且观察药物应用所造成的变化。以健康小鼠和帕金森疾病小鼠脑基因的表达情况和差别的分析为例,介绍生物信息工具箱用于标准化处理基因芯片数据,分析和可视化基因表达谱方面的应用。
- 杨英杰李红燕谢建平刘新星
- 关键词：基因芯片可视化散点图
- MATLAB 7．X生物信息工具箱的应用——序列比对(二)被引量：3
- 2008年
- 序列比对是基因序列分析中的一项重要工作。本文以人和鼠的基因为对象,介绍MATLAB 7.X生物信息工具箱中的序列比对方法,内容包括从数据库获取序列信息,查找序列的开放阅读框,将核苷酸序列转换为氨基酸序列,绘制比较两氨基酸序列的散点图,用Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对,以及计算两序列的同一性。
- 李红燕刘新星谢建平杨英杰
- 关键词：开放阅读框同一性
- MATLAB7.X生物信息工具箱的应用——聚类分析(七)被引量：1
- 2012年
- 本文主要介绍MATLAB生物信息工具箱的数据聚类分析功能,该功能主要用于基因芯片数据的分析。将要分析的数据先转化成XLS格式的文件,通过函数xlsread读入MATLAB Workspace,存储为两个变量。对缺失数据进行估算,从而减小结果误差。函数clustergram对数据分级聚类,并产生数据的热红外分布图和树状图。通过更改相关参数可以改变其颜色配置,距离算法,并可做双向聚类。
- 刘新星梁万洁李红燕杨英杰
- 关键词：聚类分析电子数据表基因芯片
- MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用——基因表达图谱分析(4)
- 2012年
- 基因表达图谱原则上可了解整体细胞基因表达的信息,是基因组功能分析的重要研究手段。MATLAB 7.X生物信息工具箱为基因表达谱数据的分析和处理提供了一个综合环境,通过众多统计函数和绘图函数的结合使用,过滤不合格的基因数据和噪声数据,从而对基因表达数据进行聚类分析和主成分分析,绘制相关的基因表达图谱,完成基因芯片数据表达图谱的分析,分析结果可视化程度高,图表清晰、直观。本文主要以酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae为例,详细描述了利用MATLAB 7.X生物信息工具箱对其基因表达图谱进行分析的过程。
- 杨英杰李红燕云慧刘新星
- 关键词：基因芯片生物信息工具箱聚类分析主成分分析
- MATLAB7.X生物信息工具箱的应用——专用分析工具(六)被引量：1
- 2012年
- 序列分析可以获取蕴藏在简单序列中的生物信息,是生物信息分析的基础。通过生物大分子序列差异分析构建的系统树则可为我们提供可视化的物种间的进化关系。MATLAB7.X生物信息工具箱包含了几个图形用户界面设计的专用分析工具,这些专用分析工具交互性好,易于使用。借助于这些分析工具,用户不仅可以对基因序列进行分析查看并能进行相对应的氨基酸序列分析,还可以方便快捷地构建系统发育树。即使用户不会编程也可以进行序列分析和系统发育分析的研究,大大地提高了分析的效率。本文详细介绍了序列分析工具Seqtool和系统发育分析工具Phytreetool在序列分析及系统发育树构建方面的应用,所有操作方便快捷,分析结果可视化程度高。
- 刘新星谢成李红燕杨英杰
- 关键词：生物信息工具箱
- 粘质沙雷氏菌XJ-01几丁质酶合成条件的优化被引量：2
- 2009年
- 目的:对粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens) XJ-01几丁质酶合成条件优化。方法:研究了碳源、氮源、温度、pH等单个因素对该菌几丁质酶合成的影响,并通过正交实验确定了该菌的最适酶合成条件。结果:该菌几丁质酶最优合成条件为:胶体几丁质5g/L、硫酸铵5g/L、培养温度32℃、最适pH8。结论:优化了S.marcescens XJ-01几丁质酶的合成条件。
- 夏金兰熊晶刘可可张瑞永李红燕谭建锡彭安安聂珍媛
- 关键词：粘质沙雷氏菌几丁质酶
