李晓欢
- 作品数：8 被引量：3H指数：1
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- 台湾稻螟乙酰胆碱酯酶基因克隆与分析
- 乙酰胆碱酯酶(AChE)是有机磷(organophosphate,OP)和氨基甲酸酯(carbamate,CB)类杀虫剂的作用靶标.乙酰胆碱酯酶基因(ace)表达量的上升或基因突变导致其对杀虫剂的敏感性下降是昆虫产生抗药...
- 罗光华李晓欢张志春刘宝生方继朝
- 关键词：台湾稻螟乙酰胆碱酯酶基因克隆分析
- 二化螟Ty3/gypsy反转座子的克隆与序列分析被引量：1
- 2014年
- 转座子是宿主基因组的重要组成部分。Ty3/gypsy反转座子是广泛存在于生物体内的一类反转座子。通过反向PCR(inverse PCR)和基因组步移方法成功地从二化螟体内获得一个具有完整结构的Ty3/gypsy反转座子拷贝,命名为Csu-Ty3(GenBank登录号:KJ191261)。该反转座子拷贝全长4 934bp,在基因组上插入的靶位点(target sit duplications,TSDs)是"AACGT",两端的长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)不完全相同,5′端LTR长161bp,3′端LTR长168bp,两者的一致度为93.5%;在靠近3′端LTR处有一段长15bp的嘌呤尾(polypurine tract,PPT)序列。经ORF Finder分析,Csu-Ty3中包含三个独立的ORF,从左至右第一个ORF编码类似病毒的结构蛋白,称为GAG蛋白;第二个ORF编码天冬氨酰蛋白酶(aspartic protease,AP)蛋白;第三个ORF编码一个多聚蛋白,包含反转录酶(reverse transcriptase,RT)、RNA酶H(RNase H,RH)以及整合酶(integrase,IN)。Southern杂交显示二化螟不同地理种群中均有较多的Csu-Ty3拷贝。在特定基因座位上,对Csu-Ty3拷贝插入与否的检测结果显示,二化螟不同地理种群中在该位点上均含有Csu-Ty3拷贝的插入,但在德阳和江津种群中有些个体在该位点上没有检测到Csu-Ty3拷贝的插入。
- 李晓欢罗光华张志春刘宝生方继朝
- 关键词：二化螟反转座子克隆
- 二化螟体内两种类型转座子的单碱基变异特点分析
- 由于转座子的转座会对宿主产生重要影响,因此转座子在体内受到宿主的严格调控.调控途径之一是使转座子序列变异而丧失天然转座活性.转座子序列的变异特点与规律目前并不是很清楚.本文利用多重序列比对分析软件,分别对二化螟体内发现的...
- 罗光华李晓欢张志春刘宝生方继朝
- 二化螟体内两种类型转座子的单碱基变异特点分析
- 由于转座子的转座会对宿主产生重要影响，因此转座子在体内受到宿主的严格调控。调控途径之一是使转座子序列变异而丧失天然转座活性。转座子序列的变异特点与规律目前并不是很清楚。
- 罗光华李晓欢张志春刘宝生方继朝
- 二化螟piggyBac类转座子的克隆与分析被引量：2
- 2012年
- piggyBac转座子是DNA型转座子,广泛分布于生物体内。基于piggyBac转座子超家族成员IFP2开发的转基因工具载体是目前转基因研究中使用最广泛的载体之一,因此piggyBac转座子的研究受到广泛的关注和重视。本文是对二化螟Chilo suppressalis内源性piggyBac类转座子(piggyBac-like element,CsuPLE)的首次报道。克隆的CsuPLE(GenBank登录号:JX392388)全长2537bp,包含一个长1914bp的完整开放阅读框(open reading frame,ORF),编码含637个氨基酸残基的转座酶,转座酶中含有piggyBac家族保守的"DDD-domain"。CsuPLE全长序列具有完全对称的13bp反向末端重复序列(inverted terminal repeats,ITRs)以及非完全对称的21bp内部重复序列(internal repeats,IRs),在二化螟基因组上插入在特征性的"TTAA"靶位点重复(target site duplication,TSD)处。在我国地理跨度很大的不同二化螟种群中均存在结构完整的CsuPLE序列。本研究结果为深入研究piggyBac转座子的结构与功能的关系提供了新的素材,也为评价利用转座子载体系统在二化螟体内进行转基因操作的可行性和安全性提供了重要的理论基础。
- 罗光华吴敏韩召军李晓欢钱路方继朝
- 关键词：二化螟PIGGYBAC转座子克隆
- 不同地理种群二化螟Ty3/gypsy反转座子天冬氨酰蛋白酶(AP)基因序列的克隆与分析
- 2014年
- 【目的】Ty3/gypsy反转座子是广泛存在于生物体内的一类反转座子。反转座子上的天冬氨酰蛋白酶(aspartic protease,AP)基因是反转座子发生转座所需的一个重要基因。但由于该基因家族成员间变异较大,较难利用简并引物克隆得到该基因,所以对该基因家族成员的研究很少。【方法】本研究采用PCR方法克隆了二化螟Ty3/gypsy反转座子的AP基因序列,并对其序列特征和地理种群变异进行了分析。【结果】克隆获得的二化螟Chilo suppressalis(Walker)Ty3/gypsy反转座子中的AP基因具有独立的开放阅读框(open reading frame,ORF),长528 bp,编码的蛋白含175个氨基酸残基(GenBank登录号:KF886014)。Conserved Domain Search在线工具分析显示,该蛋白中含有一个特异的Asp_protease_2保守功能域。从7个二化螟不同地理种群中共克隆获得70份AP基因拷贝。对同一基因座位上的AP序列多重比对分析,发现共存在46处碱基替换,其中碱基转换(transition)有31处,碱基颠换(transversion)有15处,70份拷贝中有69份拷贝是完整的ORF,能编码完整的蛋白。从碱基替换形式看,A→G的变异形式出现最多,有15处;其次是T→C的变异形式,有11处;其余的变异形式都很少。对比这7个不同地理种群,没有发现碱基的替换存在明显的地理区划差异。【结论】碱基的替换形式与二化螟所处的地理区域无明显相关性。本研究对于认识反转座子序列的变异特点有所帮助。
- 李晓欢罗光华韩召军方继朝
- 关键词：二化螟反转座子GYPSY
- 二化螟内源性piggyBac转座子在不同地理种群中的差异分析
- 二化螟是一种适应性极强的非迁飞性害虫,广泛分布于亚洲温带和亚热带稻区,食性多样,遗传多样性丰富,能较快地适应不同的杀虫剂和耕作栽培环境,因而在生产上形成周期性的大暴发,严重威胁我国的粮食生产安全。转座子是宿主基因组的重要...
- 罗光华李晓欢张志春刘宝生方继朝
- 关键词：植物害虫二化螟PIGGYBAC转座子种群差异
- 台湾稻螟对有机磷农药靶标抗性突变检测方法
- 本发明涉及台湾稻螟对有机磷农药靶标抗性突变的分子生物学检测方法，属于生物技术领域。以个体基因组DNA为模板，用特异性引物F：5’-AGGTGGCTTTTACTCTGGGA-3’和R：5’-AATGAATGCGGACAGT...
- 罗光华李晓欢方继朝张志春刘宝生张谷丰郭慧芳
- 文献传递
