岳亮亮
- 作品数:4 被引量:23H指数:3
- 供职机构:云南出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金:国家质检总局科技计划项目“十一五”国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析被引量:8
- 2014年
- 以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防止ITS假基因的扩增;(2)与功能拷贝相比,ITS假基因序列的ITS1和ITS2区存在多处碱基缺失,GC含量明显偏低,5.8S区二级结构稳定性降低;(3)应用ITS假基因进行种水平的系统发育分析会对其真实的系统关系造成影响,提示进行系统进化研究时应警惕假基因的干扰。
- 尤欢周阿涛岳亮亮寸东义丁元明
- 关键词:DMSOITS山茶属假基因
- 植物nrDNAITS假基因研究进展被引量:2
- 2013年
- 核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)被广泛应用于植物系统发育研究中。近年来,发现在很多植物类群中存在ITS假基因(pseudogenes),然而这些假基因在系统发育分析中的潜在价值往往被低估,甚至在部分研究中被忽略。主要介绍假基因的生成、特性以及ITS假基因在植物系统学中的应用,并对ITS假基因的研究前景进行展望。
- 尤欢周阿涛岳亮亮寸东义李旻丁元明
- 关键词:ITS假基因进化
- 云南出口新鲜松茸产地属性DNA指纹图谱构建被引量:4
- 2014年
- 收集19个出口松茸主产地的97个样本,使用逆转录因子的DNA分子标签对样本基因组进行PCR扩增;为尽可能区分原产地,对某些产地的样本增加先使用限制性内切酶处理基因组DNA,再次使用逆转录分子标签的步骤。采用全自动DNA分析系统获得一系列DNA指纹图谱。通过比较分析找到同一地理居群共有的DNA指纹图谱特征以及酶切前后的图谱差异。这些指纹图谱特征与松茸原产地间存在显著相关性。
- 陈丽萍杨玲春陈芸陈旭岳亮亮刘忠民傅士华郭永红
- 关键词:限制性内切酶
- 云南山茶(Camellia reticulata)nrDNA ITS序列多态性分析被引量:13
- 2013年
- 对云南山茶(Camellia reticulata)8个品种的核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)进行克隆测序,将获得的ITS序列进行GC含量、5.8S区二级结构的稳定性、替代模式、核苷酸多样性及系统发育关系的相关分析。实验结果显示,云南山茶8个品种的ITS序列存在丰富的基因组内多态性,同时包含中性进化的假基因,表明其ITS序列逃离了一致性进化。云南山茶ITS序列多态性的原因可能来自广泛的种间杂交,以及rDNA位点在基因组中有不确定的物理位置。ITS假基因为品种的物种形成研究提供了更全面的遗传证据,同时也提示了利用ITS假基因进行系统发育分析可能会对其真实的系统关系造成影响。
- 周阿涛岳亮亮李旻刘迪秋丁元明
- 关键词:云南山茶NRDNAITS多态性假基因