刘江
- 作品数：13 被引量：20H指数：2
- 供职机构：淮南市疾病预防控制中心更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 淮南市新型冠状病毒核酸检测结果分析被引量：2
- 2020年
- 目的建立新型冠状病毒SARS-CoV-2核酸检测方法,比较新型冠状病毒感染肺炎患者上下呼吸道标本核酸检测结果的差异,为临床诊断SARS-CoV-2感染,如何选择标本类型以及提高核酸阳性检出率提供参考。方法采集31例疑似新冠肺炎患者呼吸道标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法对新型冠状病毒感染者的咽拭子和痰液标本进行双靶标(ORF1ab基因和N基因)核酸检测,应用卡方检验分析不同类型标本新型冠状病毒核酸阳性率的差异。结果31份新型冠状病毒病例的咽拭子标本中,26份阳性,5份阴性,阳性率为83.8%;31份痰液标本中,29份阳性,2份阴性,阳性率为93.5%;两种标本检测结果差异无统计学意义(χ^2=1.449,P>0.05)。不同发病时间患者咽拭子阳性率和痰液阳性检出率差异均无统计学意义(P=0.669)。比较咽拭子和痰液ORF1ab基因平均CT值(荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数),咽拭子较痰液高3.04;N基因CT值咽拭子较痰液高3.33。1例患者呼吸道标本阴性,肛拭子新冠病毒核酸阳性。结论咽拭子和痰液标本,均可用于SARS-CoV-2核酸检测。痰液ORF1ab基因和N基因CT均值低于咽拭子,更易检出,用于检测SARS-CoV-2更具优势。此外,呼吸道标本核酸检测阴性的患者,进一步检测消化道标本,对患者临床判断和疾病防控具有重要意义。
- 王小波余寿杰曾凡荣刘江杨光何玢张洁朱利杰孙梦阳
- 关键词：新型冠状病毒实时荧光定量RT-PCRCT值新发传染病
- 安徽省淮南市2012-2013年流感病毒细胞分离及其流行特征分析被引量：2
- 2014年
- 目的：观察安徽省淮南市2012-2013年流感病毒细胞培养分离结果，研究淮南市流感流行特征，为该市流感防控提供科学依据。方法实时荧光定量PCR法对哨点医院送检咽拭子标本进行核酸快速分型后采用狗肾（ MDCK）传代细胞培养法分离病毒，红细胞凝集试验（ HA）鉴定病毒滴度，红细胞凝集抑制试验（ HI）进行型和亚型的鉴定。结果从148份流感网络实验室实时定量PCR阳性标本中，分离出流感毒株68株，总分离率45．9％，其中 A1（H1N1）型26株，分离成功率56．5％，A3（H3N2）型25株，分离成功率33.3％；BY型4株，BV型13株，B型毒株分离成功率为63．0％；各型毒株的分离成功率差异有统计学意义（P＜0．05）。2012年淮南市流行株为BV型流感病毒，于3月份达到流行高峰；2013年流行株为A（H1N1）型流感病毒，流行高峰期则是12月份。结论淮南市2012-2013年甲型流感病毒抗原的变异性强；细胞培养分离病毒对流感流行的病原鉴定起决定性作用；流感病毒B型毒株和新A（H1N1）型毒株分离成功率较高。
- 余寿杰王小波刘江刘笑梅
- 关键词：细胞培养技术血凝集试验
- 淮南市2019—2020年食源性疾病病原体检测结果分析被引量：2
- 2021年
- 目的通过分析2019—2020年淮南市食源性疾病病原体的检测结果,了解其病原学特征,为有效控制食源性疾病提供科学依据。方法参考《国家食源性疾病监测手册》,采集淮南市哨点医院食源性疾病病例的相关标本,进行致泻大肠埃希氏菌、沙门氏菌、副溶血弧菌和志贺氏菌的分离培养,对诺如病毒进行核酸检测,同时对沙门氏菌和部分致泻大肠埃希氏菌阳性菌株进行耐药性分析。结果 2019—2020年共采集检测粪便标本240份,检出病原体111份,检出率46.25%,2019年与2020年分别检出阳性标本64份与47份,检出率差异有统计学意义(χ^(2)=4.844,P=0.028)。其中混合感染9份,检出率3.75%。检出致泻大肠埃希氏菌44株、诺如病毒核酸阳性36份、沙门氏菌26株、副溶血弧菌11株,未检出志贺氏菌。30株致泻大肠埃希氏菌和26株沙门氏菌中有54株存在不同程度耐药,部分菌株出现多重耐药。结论 2019—2020年淮南市食源性疾病病原体以致泻大肠埃希氏菌和诺如病毒为主,存在混合感染和多重耐药菌株。
- 何玢刘江朱利杰张洁王小波曾凡荣
- 关键词：食源性疾病病原学特征耐药性分析
- 2016年淮南市外环境H7N9禽流感病毒基因组特征分析
- 2021年
- 目的:分析淮南市2016年度外环境标本中H7N9禽流感病毒基因组特征。方法:采集活禽市场禽类粪便、笼具、台面或砧板、脱毛机、禽类饮水、污水等标本,选取H7N9、H9亚型PCR检测阳性标本(Ct值≤30),鸡胚分离培养后提取RNA,扩增8个基因节段进行基因序列测定、分子特征与进化分析。结果:2016年150份淮南市外环境标本检出H7N9亚型46份、H9亚型71份、H5亚型38份;2份H7N9亚型分离成功。基因进化分析显示,淮南市2株H7N9禽流感毒株血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因均处于长三角分支内,其余6个内部基因无明显地域分布聚类;HA氨基酸受体位点出现G186V、Q226L位点变异,NA茎区缺失了"QISNT"序列,R294K、E119V耐药位点没有发生突变;聚合酶发生PA基因I550L,PB1基因I368V,PB2基因I504V突变;NS1基因出现增强致病力的位点N205S、P42S改变;耐药相关位点出现M1基因N30D、T215A,M2基因S31N突变。结论:2016年淮南市活禽市场禽流感病毒高度流行,H7N9亚型感染人类的能力有所增强,M2离子通道抑制剂耐药,NA抑制剂仍为敏感有效药物。
- 刘江何军曾凡荣余寿杰何玢杨光
- 关键词：禽流感血凝素神经氨酸酶基因组
- 淮南市2009年甲型H1N1流行性感冒病毒检测分析
- 2011年
- 淮南市疾病预防控制中心2009年6月18日发现安徽省首例输入性甲型H1N1病例,自8月26日开始对流感样病例进行甲型H1N1流感病毒核酸检测和季节性流感病毒核酸检测。现将本实验室检测结果分析如下。1材料与方法1．1标本来源2009年8月26日～12月31日，淮南市第一人民医院（国家流感样哨点医院）采集流感样病例咽拭子标本，所有标本均由经过培训的合格上岗护理人员采集。
- 余寿杰刘江王晨坤刘笑梅
- 关键词：反转录聚合酶链反应甲型H1N1流感流感样病例
- 淮南市2010年手足口病病原检测结果分析被引量：2
- 2011年
- 目的了解淮南市手足口病的流行趋势及病原型别鉴定分析。方法对2010年4～12月123例临床诊断手足口病例进行三间分布分析,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定肠道病毒病原体型别。结果来自哨点医院123例患者中,中心城区(57例)与其他县区之和(66例)发病人数比例约为1:1.16;手足口病以5月为发病高峰,高发年龄集中在1～5岁年龄组,男性患者(85)与女性患者(38)比例约为1:0.45;123份咽拭子标本病原鉴定阳性数95例,阳性率77.2%(EV71:CA16约为2:1)。结论淮南市手足口病的流行在地域分布无明显的地域差别,有明显的流行季节及年龄分布,患者以EV71感染为主,同时伴有CA16及其他型别肠道病毒感染。
- 余寿杰刘江王晨琨刘笑梅
- 关键词：手足口病肠道病毒病原鉴定
- 2016年淮南市禽流感外环境H9N2病毒基因组特征分析被引量：2
- 2020年
- 目的分析淮南市2016年2—4月外环境标本中H9N2亚型禽流感病毒基因组特征。方法选取H9N2亚型荧光PCR检测核酸阳性标本(Ct值≤30),经鸡胚分离培养提取RNA,扩增8个基因节段进行全基因序列测定,分析淮南株各基因节段分子特征,构建进化树进化分析。结果淮南市外环境2株H9N2禽流感毒株血凝素(hemagglutinin,HA)基因和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因与A/Anhui-Lujiang/39/2018/H9N2人源株核苷酸同源性分别为98.2%~98.3%/97.2%~94.9%,氨基酸序列同源性为98.9%~98.8%/99.2%~98.6%,其余6个内源基因与A/Anhui/1/2013/H7N9、A/Anhui/33163/2016/H5N6高度同源;基因进化分析显示,2016年淮南市2株H9N2亚型禽流感毒株为G57基因型,淮南市2株H7N9分离株、安徽人感染A/Anhui/1/2013/H7N9和A/Anhui/33163/2016/H5N6内源基因均为G57-like基因型;HA蛋白受体结合域氨基酸S132D、K138T、T189D、V/A190T、Q226L变异,NA茎区缺失了"TEI"序列,H274Y、R292K、N294S耐药位点未发生变异,PA基因I550L,PB1基因I368V,PB2基因I504V,NS1基因P42S,M1基因N30D、T215A,M2基因耐药S31N位点均发生突变。结论淮南市活禽市场H9N2病毒与人感染H9N2安徽株A/Anhui-Lujiang/39/2018/H9N2高度同源,处于同一进化分支,均为G57基因型,可提供内源基因与人感染H7N9、H5N6亚型禽流感病毒重组;HA受体结合域氨基酸位点、NA茎区缺失序列、聚合酶活性增加,均加强病毒感染人类的能力,M2离子通道抑制剂(金刚烷烃类)耐药,NA抑制剂(磷酸奥司他韦)仍为敏感药物。
- 刘江何军曾凡荣何玢杨光余寿杰
- 关键词：H9N2禽流感PCRHANA
- 2014年-2015年淮南市手足口病EV71型病毒分离株VP1基因特征分析被引量：1
- 2018年
- 目的了解淮南市手足口病EV71型病毒分离株VP1基因遗传特征及进化关系。方法使用RD细胞对EV71型荧光PCR阳性标本进行病毒分离,盲传2代接种出现CPE后,收集培养物上清,提取病毒RNA,RT-PCR扩增VP1基因,对扩增产物进行基因序列测定,采用DNAStar 7.1和Mega 5.0软件对测序结果与国内外参考毒株进行基因亲缘性进化分析。结果 7株毒株基因测序显示VP1区核苷酸长度均为891 nt,其核苷酸同源性为93.5%~100%,氨基酸同源性为98.3%~100%;基因进化分析显示,与安徽阜阳、山东、河南EV71型毒株亲缘性较近,处于同一进化C4a分支。结论淮南市分离到的7株EV71型病毒VP1区基因核苷酸和氨基酸序列变异较小,与阜阳、山东、河南流行的C4a亚型存在共循环流行。
- 曾凡荣史永林刘江余寿杰魏志军
- 关键词：手足口病EV71VP1PCR
- 一起宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发病原学检测及分子溯源被引量：5
- 2022年
- 目的对淮南市发生的一起宋内志贺菌暴发疫情进行病原学溯源分析,并对菌株毒力基因和耐药谱进行检测。方法采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便,进行多重病原体核酸检测和分离培养,对分离的宋内志贺菌进行毒力基因PCR检测、微量肉汤法药敏检测、脉冲场电泳和全基因组测序溯源分析。结果56份黏稀样粪便分离出38株宋内志贺菌(阳性率67.86%),血清型均为宋内志贺菌Ⅰ相;3份末梢水和井水革兰阴性菌(GN)增菌液荧光PCR检测志贺菌阳性;菌株毒力基因携带情况为侵袭性质粒抗原H(ipaH)阳性(38份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)阳性(31份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)/肠毒素2基因(sen)阳性(1份);耐药谱显示14种抗生素中9种100.00%耐药,仅亚胺培南、氯霉素、头孢他啶、环丙沙星为有效药物;36株菌XbaⅠ限制性酶切图谱带型完全一致,其中3株菌株基因组ST型分析均为ST152型;全基因组测序和分析验证了此次暴发由单一克隆群菌株引起,且揭示此次暴发分离株与数据库中3株中国菌株、1株韩国菌株聚集成一个大簇,而与其他国家的菌株距离较远。结论本起由水源污染单一宋内志贺菌克隆引起,分离株为低毒力株,呈多重耐药表型。
- 刘江孙永张洁曾凡荣王小波朱利杰孙梦阳余寿杰
- 关键词：宋内志贺菌全基因组测序药敏试验
- 淮南市新型冠状病毒感染病例实验室核酸检测结果分析
- 2020年
- 目的分析淮南市336例新型冠状病毒疑似病例核酸检测结果,为控制淮南市新型冠状病毒肺炎提供实验室诊断依据。方法根据国家卫生健康委办公厅《新型冠状病毒防控方案(第四版)》及《新型冠状病毒防控方案(第五版)》要求,通过对淮南市336例新型冠状病毒疑似病例同时采集咽拭子和痰液标本进行实验室核酸检测,并对核酸检测结果按年龄、性别分布、发病时间与检测阳性率关系及标本类型检测进行分析。结果淮南市从发现到零确诊(2020年1月24日~2020年2月19日)共检测新型冠状病毒疑似病例336人,核酸检测阳性病例总数为27例,阳性率8.04%(咽拭子或痰液标本中有任何一个核酸检测结果阳性即判定该病例为阳性);27例阳性病例中有19例为家庭聚集性病例;阳性病例中最小年龄15岁,最大年龄78岁,年龄中位数为40岁;阳性病例中男性15例(55.56%)、女性12例(44.44%),男女比例为1.25∶1;核酸检测阳性病例数主要集中在发病1~14天,核酸检测阳性平均发病时间为5天;痰液标本核酸检测阳性率大于咽拭子标本核酸检测阳性率;痰液标本核酸检测Ct值普遍低于咽拭子标本核酸检测的Ct值;27例阳性病例中病情发展为普通型26例,重型1例;截至3月2日,27例病例中已出院病例23例,剩余4例病情基本稳定。结论通过对淮南市336例新型冠状病毒核酸检测结果分析,有利于对新型冠状病毒肺炎病例进行早期诊断;在新型冠状病毒肺炎实验室诊断病例及出院病人实验室诊断时不能仅以咽拭子标本核酸检测阴性作为排除感染及治愈标准,而需同时检测病人咽拭子和痰液标本进行综合判断;加强个人卫生管理及人员密集的密闭公共场所的环境消毒工作,更有利于新型冠状病毒肺炎疫情防控。
- 曾凡荣刘江杨光王小波张洁何玢朱利杰孙梦阳余寿杰
- 关键词：新型冠状病毒核酸检测阳性率实时荧光定量PCR
