储志远
- 作品数：5 被引量：39H指数：5
- 供职机构：大连海洋大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划黑龙江水产研究所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 镜鲤体长性状的QTL定位分析被引量：9
- 2011年
- 以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体为材料,利用553个分子标记（217个SSR和336个SNP标记）对其进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包对遗传连锁图谱进行构建。利用MapQTL5.0区间作图法（Interval mapping）进行QTL检测,通过置换实验（1 000次重复）确定连锁群显著性水平阈值。在对体长的区间定位中共检测到12个与体长性状相关的QTLs区间,分布在BL-1-1（SNP0137-SNP1481）、BL-4-1（SNP0092-HLJ797）、BL-5-1（SNP1268-HLJ423）、BL-7-1（HLJ870-SNP0702）、BL-12-1（SNP0922-HLJ639）、BL-16-1（HLJE351-SNP0674）、BL-25-1（SNP0394-SNP0862）、BL-35-1（HLJ668-SNP0832）、BL-43-1（SNP0389-SNP1425）、BL-47-1（HLJ057-HLJ1113）、BL-47-2（HLJ1439-HLJ1418）等11个连锁群上,解释表型变异范围是13.8%~64.9%,其中贡献率大于20%的主效QTLs有8个,是体长性状的主效QTLs区间。
- 张天奇张晓峰谭照君曹柱王宣朋李文升储志远孙效文
- 关键词：镜鲤体长分子辅助育种
- 鲤回交群体4种生长性状的相关性分析被引量：9
- 2011年
- 利用132对SSRs(simple sequence repeat)标记和63对在EST(expressed sequence tag)上的微卫星标记对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系回交子代的84个个体基因组DNA进行检测,共得到565个等位基因,各等位基因数2～4个,片段长度72～484 bp,平均等位基因数为2.897 4,平均多态信息含量为0.584 9,平均杂合度为0.592 8。利用统计软件SPSS的GLM程序对195个微卫星标记与鲤体重、体长、头长和尾柄长的相关性进行分析,其中HLJ133、HLJ346、HLJ360与体重具有极显著相关;HLJ133,HLJ368,HLJ390,HLJ673,HLJE96与体长具有显著相关;HLJ133,HLJ346,HLJ360与头长极显著相关;HLJ529,HLJE538,HLJE586与头长具有显著相关;HLJ673,HLJE282与尾柄长具有极显著相关;HLJ348,HLJ368,HLJ382,HLJ437,HLJ483,HLJ752,HLJE169,HLJE586与尾柄长具有显著相关,并对同一标记不同基因型间进行了多重比较。根据实验求出的体重与体长、头长、尾柄长之间的相关系数和通径系数,可得知体重与尾柄长的直接相关性非常小。
- 储志远张晓峰曹柱孙效文
- 关键词：微卫星标记相关系数通径系数
- 鲤的微卫星标记与体质量、体长、体高和吻长的相关分析被引量：16
- 2010年
- 利用24个鲤(Cyprinus carpio L.)EST-SSRs标记和41个SSRs标记对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系回交子代的84个个体基因组DNA进行检测,共得到182个等位基因,各座位等位基因数2～4个,片段长度142～329bp,有效等位基因数1.3913～3.9353,观察杂合度0.3214～1.0000,期望杂合度0.2829～0.7535,平均位点多态信息含量0.5120。利用统计软件SPSS的GLM程序对65个微卫星标记与鲤鱼体质量、体长、体高和吻长的相关性进行了分析,其中与体质量、体长显著相关的标记是HLJE365;与体质量、体高显著相关的标记是HLJ816;与体质量显著相关的标记是HLJ726,与体长显著相关的标记是HLJ107、HLJ1098;与体高显著相关的标记是HLJ111、HLJ817;与吻长显著相关的标记是HLJE331、HLJ906、HLJ1330。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与4种性状相关的基因型,并运用数学建模的思想定位等位基因对性状的影响。
- 杨晶张晓峰储志远孙效文
- 关键词：微卫星标记体质量体长体高
- 磁珠富集法筛选方正银鲫的三、四核苷酸重复微卫星DNA被引量：7
- 2011年
- 通过生物素磁珠富集法开发方正银鲫(Carassius auratus gibelio(Bloch))三、四核苷酸重复的微卫星,并与传统的放射性同位素杂交法相结合,进行二次筛选微卫星分子标记。结果显示:对652个阳性克隆进行测序分析,获得微卫星序列800个,其中完美型542个(67.75%),非完美型140个(17.50%),混合型118个(14.75%)。用引物设计软件primer3plus在线设计引物163对,选择合成76对,引物多态性通过二倍体野生鲫群体进行检测。检测结果显示,30对引物表现出不同程度多态性,等位基因数在3～8之间,多态信息含量(PIC)在0.4066～0.8023之间,其中80%为高度的多态性位点(PIC>0.5),表明方正银鲫微卫星文库是个高质量的文库。
- 曹柱鲁翠云郑先虎储志远张天奇赵元凤孙效文
- 关键词：微卫星磁珠富集法
- 镜鲤体重的QTL定位被引量：6
- 2011年
- 本研究利用217个微卫星标记和336个SNPs标记对德国镜鲤F2代68个个体基因组DNA进行基因型检测。其中507个标记共组成62个连锁群,覆盖基因组总长度为2805.85cM,标记间平均距离为6.31cM;利用软件MapQTL4.0采用区间作图法对体重性状进行QTL定位分析。研究结果共检测到14个与体重性状有关的QTLs,分布于9个连锁群。其中BW-5-1有最大的LOD值,为4.46;BW-1-1的LOD值最小,为2.25。单个QTL平均解释表型变异介于14.10%～45.50%之间,其中贡献率大于20%的主效QTLs有9个。通过BLASTX与斑马鱼蛋白质序列数据库进行序列比对,找到了与斑马鱼酰基辅酶A脱氢酶蛋白、胰淀粉酶α2蛋白、Apoeb protein和甘油醛-3-磷酸脱氢酶蛋白同源的分子标记。本研究结果对分子标记辅助育种具有重要应用价值。
- 李文升刘翠张晓峰张天奇王宣朋储志远孙效文
- 关键词：镜鲤体重数量性状基因座分子标记辅助
