黄小芳
- 作品数：12 被引量：32H指数：3
- 供职机构：中国科学院南海海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学化学工程天文地球轻工技术与工程更多>>
- 基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析被引量：1
- 2014年
- 对三亚湾鹿回头与西沙石岛的常见鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)的固氮酶nif H基因多样性进行了分析,并对其共附生固氮微生物多样性进行了比较。利用Taq I和HaeⅢ两种限制性内切酶分别对三亚湾珊瑚的粘液(SYN)、组织(SYZ)和西沙珊瑚组织(XSZ)的阳性克隆子进行聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,得到了23,25和13个OTUs,文库的覆盖率分别为90.3%,87.5%和94.1%,多样性指数Shannon-Wiener指数(H)分别为2.28,3.02和2.08,Evenness指数(E)分别为0.5,0.65和0.56。研究结果表明:1)3个文库重要组成部分都是绿菌门(Chlorobia)和变形菌门(Proteobacteria)α-亚门、γ-亚门、δ-亚门细菌;2)3个文库绝大部分OTUs的最相似序列来自珊瑚礁、海绵、水体、沉积物等环境中的不可培养细菌,反映鹿角杯形珊瑚组织和粘液可能蕴含着丰富的尚未被培养的固氮菌资源;3)发现了两大重要的类群——分别与绿菌门和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)细菌序列最相似的类群,它们通过为珊瑚共生体提供有机氮源参与到珊瑚白化的调节或恢复过程中,在珊瑚共生体营养物质的循环中充当重要角色;4)从多样性指数分析可以看出,SYZ的固氮微生物多样性高于SYN,SYZ的固氮微生物多样性高于XSZ,反映了鹿角杯形珊瑚生活的地理位置不同,固氮菌共附生的生态位不同(如珊瑚粘液、组织等不同部位),都将导致珊瑚共附生固氮菌多样性的差异。
- 黄小芳陈蕾张燕英凌娟龙丽娟张偲董俊德
- 关键词：固氮菌
- 热带海草泰来草沉积物真菌的群落结构、功能与分子生态网络研究
- 2023年
- 真菌是海草床生态系统的重要组成部分,它们在维持海草健康和生态系统碳氮等营养元素循环方面发挥着重要作用。为了阐明海草床生态系统真菌的群落结构及功能,文章以热带海草泰来草(Thalassia hemprichii)沉积物为主要研究对象,通过Illumina Miseq高通量测序技术分析海南岛和西沙群岛两个研究区域泰来草沉积物真菌的群落结构与物种多样性,并利用FUNGuild数据库对真菌营养类型进行预测和功能注释。研究结果表明,子囊菌门(Ascomycota)(相对丰度24.30%~76.20%)和担子菌门(Basidiomycota)(相对丰度4.98%~52.24%)为两个研究区域的共同优势种群,但是子囊菌门真菌的相对丰度在两个研究区域间存在显著性差异(p<0.05),两个区域内共有的海草沉积物真菌分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs)数量占比为5.15%,其相对丰度为31.19%。两个研究区域泰来草沉积物真菌群落的α多样性指数中的香农指数(Shannon)和系统发育多样性(phylogenetic diversity)以及β多样性之间都存在显著性差异(p<0.05)。FUNGuild功能预测分析表明,大部分真菌的营养类型尚未确定(72.11%~91.92%),其中能够确定的主要营养类型为共生营养型(symbiotroph)、腐生营养型(saprotroph)和病理营养型(pathotroph),3种营养型可以进一步分为41个生态功能群。基于随机矩阵理论(random matrix theory,RMT)构建的两个研究区域海草泰来草沉积物真菌分子生态网络结果显示,海南岛泰来草沉积物真菌网络结构更加复杂,其平均聚类系数更高、平均连通度更高、密度更高,该真菌群落可能对外界环境变化更为敏感,而西沙群岛海草沉积物真菌群落的模块化程度更高,其中粪壳菌纲(Sordariomycetes)为分子生态网络中的关键类群。
- 凌娟梁童茵岳维忠岳维忠黄小芳张健孙翠慈周卫国董俊德
- 关键词：真菌群落营养类型
- 中国南海沉积环境可培养细菌多样性研究被引量：18
- 2014年
- 【目的】探索海洋沉积环境中可培养细菌的多样性。【方法】采用纯培养分离及16S rRNA基因序列鉴定的方法,对我国南海海域20个沉积物样品进行细菌多样性分析。【结果】共获得200株细菌,分属于47个属,99个种。经系统进化分析,可培养菌株主要分布于4个类群:厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),优势类群为Firmicutes,其中芽孢杆菌属(Bacillus)所占比例为55.6%;而Actinobacteria和Bacteroidetes两个类群获得菌株较少;在Firmicutes和Actinobacteria两个类群中发现8个潜在新种和3个潜在新属级类群。【结论】初步研究结果表明,南海海洋沉积环境可培养微生物资源丰富,新物种资源多样;其中,芽孢杆菌为海洋沉积环境中的优势类群,随着样品深度的增加,细菌多样性呈现递减的趋势,深度可能是影响细菌多样性的一个重要因素;其次,分离培养基和分离方法直接关系到样品中可培养微生物多样性的发现,有待深入研究。
- 刘玉娟田新朋黄小芳龙丽娟张偲
- 关键词：沉积环境细菌
- 红树林固氮微生物及其生态功能研究进展
- 2023年
- 微生物固氮是红树林生态系统中氮素循环的一个关键环节,其产生的新氮源对红树林生态系统的氮素营养供给和初级生产力的提高有着重要意义。本文聚焦红树林固氮微生物的研究历史和现状,综述了红树林固氮微生物的群落结构、固氮速率及其测定方法,探讨了固氮微生物在红树林生态修复中的应用及其对红树林生境的指示作用,阐述了固氮微生物在耦合红树林碳、氮、硫元素循环的重要角色,并展望了红树林固氮微生物的研究前景和新视角。
- 董俊德黄小芳黄小芳王友绍龙爱民杨清松
- 关键词：红树林生态修复
- 一株红树根际固氮新鞘氨醇杆菌SCSIO 43803及其应用
- 本发明公开了一株红树根际固氮新鞘氨醇杆菌SCSIO 43803及其应用。该菌于2022年7月4日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，地址：中国湖北省武汉市珞珈山武汉大学，保藏编号为CCTCC NO：M 20221...
- 黄小芳凌娟董俊德杨清松岳维忠张煜航梁童茵杨冰
- 一株海洋固氮类芽孢杆菌及其应用
- 本发明公开了一株海洋固氮类芽孢杆菌及其应用。该菌于2018年03月11日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，地址：中国湖北省武汉市珞珈山武汉大学，保藏编号为CCTCC NO：M 2018119。该菌具有较高的固氮...
- 凌娟董俊德黄小芳张燕英王聪林显程周卫国
- 文献传递
- 一株海洋固氮类芽孢杆菌及其应用
- 本发明公开了一株海洋固氮类芽孢杆菌及其应用。该菌于2018年03月11日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，地址：中国湖北省武汉市珞珈山武汉大学，保藏编号为CCTCC NO：M 2018119。该菌具有较高的固氮...
- 凌娟董俊德黄小芳张燕英王聪林显程周卫国
- 文献传递
- 一株海洋聚乙烯塑料降解菌及其应用
- 本发明公开了一株海洋聚乙烯塑料降解菌及其应用。芽孢杆菌(Evansella clarkii)SCSIO43802，该菌株于2022年7月4日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，地址：中国.武汉.武汉大学，邮编：4...
- 殷建平凌娟张煜航董俊德岳维忠杨清松黄小芳梁童茵
- 三亚湾珊瑚礁海域蓝藻群落组成的空间分布特征及其与环境因子的关系被引量：3
- 2013年
- 对三亚湾春季表层和底层蓝藻群落的空间分布差异和蓝藻群落组成与环境因子的相关关系进行了研究.利用流式细胞仪对蓝藻丰度进行了计数,其结果显示,表层蓝藻丰度范围为0.70×104-2.37×104cells/mL;底层蓝藻的丰度范围为范围是0.99×104-1.81×104cells/mL.采用的主要研究方法是变性梯度凝胶电泳（denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE）和多元统计学分析.DGGE图谱结果显示三亚湾表层和底层的蓝藻群落结构的组成存在显著的差异性,有些条带在同一站位的表层和底层都有出现而有些条带只存在于该站位的表层或者底层.表层和底层群落中的普遍存在蓝藻种都是Synechococcus或Synechococcus-like species（56.2%）;此外,还有Chroococcidiopsis （6.3%）,Cyanobium （6.3%）和Unclassified cyanbacterium （31.2%）.冗余分析结果显示与表层和底层蓝藻群落结构组成显著相关的环境因子是不同的,其中与表层蓝藻群落结构组成显著相关的是叶绿素Chla,生化需氧量,硝酸盐和磷酸盐（P〈0.05）,而与底层蓝藻群落结构组成显著相关的是硝酸盐,亚硝酸盐和磷酸盐（P〈0.05）;环境因子对三亚湾表层和底层蓝藻群落结构的空间分布差异的解释程度可分别达99.3%和58.3%.
- 凌娟张燕英董俊德王友绍黄晖陈蕾黄小芳龙丽娟张偲
- 关键词：变性梯度凝胶电泳聚球藻
- 海草床生态系统固氮微生物研究现状与展望被引量：3
- 2012年
- 海草床生态系统是三大典型海洋生态系统之一,具有较高的生产力水平和十分重要的生态意义,其海草附着物中包括许多固氮微生物,通过生物固氮提供该生态系统"新"氮源,在一定程度上缓解了氮对初级生产力的限制。通过对近些年来固氮活性的测定方法、固氮群落组成以及影响因素等的研究进展进行了综合分析,较全面地分析了海草床生态系统的固氮微生物研究现状,并在次基础上对海草床固氮微生物的系统研究进行了展望。
- 凌娟董俊德张燕英王友绍龙丽娟陈蕾黄小芳潘虎张偲
- 关键词：固氮生物研究方法环境因子
