陈光照
- 作品数：3 被引量：13H指数：3
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- 发文基金：贵州省国际科技合作计划贵州省教育厅自然科学研究项目贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 尾斑瘰螈种群的D-loop区遗传多样性分析被引量：6
- 2011年
- 以线粒体DNA D-loop序列为分子标记,研究了采自雷公山和武陵山的尾斑瘰螈(Paramesotriton caudopunclatus)5个种群的遗传多样性。获得42个个体mtDNA D-loop区序列,长度为690 bp,其中有30个变异位点,由此定义了13个单倍型。5个种群中未出现共享单倍型的现象。尾斑瘰螈种群有相对较多的单倍型数(Hd)和较低的核苷酸多样性(Pi)。遗传分化指数(FST)、核苷酸歧异度(Dxy)和基因流(Nm)分析表明,雷公山的3个种群与武陵山的2个种群间有了一定程度分化。从系统进化树来看,各单倍型按照地理分布聚合,雷公山的3个种群构成一支,武陵山的2个种群构成另一支。建议将雷公山种群、武陵山种群分别作为2个不同单元进行保护。
- 陈光照肖羽陈学平谷晓明
- 关键词：尾斑瘰螈地理种群D-LOOP区
- 基于部分线粒体DNA序列的疣螈属亚属(有尾目,蝾螈科,疣螈属)系统发育关系被引量：6
- 2012年
- 对疣螈属Yaotriton亚属5个已知物种23个个体的mtDNA序列数据(ND2、tRNATrp、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys和tRNA Tyr,1421bp),使用贝叶斯(BI)和最大似然(M P)方法重建了疣螈属Yaotriton的系统发育关系。结果表明:1)Yaotriton亚属的所有物种形成1个单元群;2)海南疣螈T.hainanensis是Yaotriton亚属的1有效物种,不是细痣疣螈T.asperrimus的同物异名;3)文县疣螈T.wenxianensis雷山种群应是细痣疣螈的地理种群,细痣疣螈绥阳种群应是文县疣螈的地理种群;4)6个文县疣螈地理种群和3个细痣疣螈地理种群分别形成单系群,文县疣螈是Yaotriton亚属的1有效物种。
- 谷晓明陈蓉蓉王会田应洲陈光照田东
- 关键词：系统发育关系MTDNA序列
- 贵州疣螈D-loop区和tRNA^(Phe)序列变异及群体遗传多样性被引量：3
- 2010年
- 贵州疣螈(Tylototriton kweichowensis)是我国特有的国家Ⅱ级保护动物,分布面积极为狭窄。为了解其遗传多样性现状,作者采获了几乎覆盖其分布范围的12群体的58个体的材料,测定了线粒体D-loop区(mtDNA控制区)及tRNAPhe基因全序列共808bp,发现16个变异位点,定义了26个单元型。遗传多样性检测显示,贵州疣螈种群具有高的单元型多样性和低的核苷酸多样性。Tajima’s D和Fuand Li’s D值检测结果均表明,贵州疣螈种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离。系统发育及网络进化分析没有显示出单元型和地理位置的对应关系,各群体的单元型都相互散布在不同的分布群中,呈现一种混杂的分布格局。水城群体与其他任一群体间基因流Nm<1,有分化的迹象。总的来说,贵州疣螈各群体之间没有发生极显著的遗传分化,因此建议将贵州疣螈所有群体作为一个整体管理单元加以保护。
- 肖羽陈光照谷晓明
- 关键词：贵州疣螈D-LOOP区基因流
