纪丰民
- 作品数:14 被引量:10H指数:2
- 供职机构:内蒙古大学物理科学与技术学院物理学系更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学文化科学社会学更多>>
- 核苷酸序列的有序片段和分子进化
- 1997年
- 定义了核苷酸序列的有序片段(X1,X2…Xk)n,Xi表示碱基的嘌呤嘧啶分类或强弱健分类,n为重复次数,通过统计分析6.8Mbp资料找出全部k=2,3的有序片段,发现若干有序片段的含量具有较好的进化相关性。
- 纪丰民罗辽复
- 关键词:核苷酸序列分子进化DNA
- 以核苷酸短程关联为基础的进化树重建(英文)被引量:2
- 2001年
- 据 DNA序列中核苷酸短程关联为主及其进化依赖性 ,本文提出了一个以少核苷酸频数为基础的进化距离的定义 ,据此用 35个物种的 1 6S( 1 8S) RNA序列构建进化树 ,得到了和生物学公认的进化树一致的结果 .最佳的树为用 7~ 8核苷频数作为距离定义构建而成 ,这意味着存在着一些 7~ 8核苷酸组成的字串 ,它们与进化强相关 .论文的最后部分把这些进化相关字串全部找出 .
- 罗辽复纪丰民谢立青李弘谦
- 关键词:进化树进化距离核苷酸
- 分子序列的突变危险性与遗传密码的编码规则被引量:1
- 2000年
- 定义了分子序列(碱基序列和对应的氨基酸序列)的突变危险性函数;通过危险性函数的极小化可以导出遗传密码的简并规则,终止密码子在密码表上的位置及亲-疏水畴排布,氨基酸在密码表上的定位接近标准密码表.各个生物类别的突变危险性函数值差别不超过5% ,可看作守恒量.Ras 家族癌基因产物具有较大的突变危险性函数值,这提示分子序列的突变危险性函数可能有重要的应用价值和理论意义.
- 纪丰民罗辽复
- 关键词:密码子遗传密码分子序列
- 遗传语言中的偏好模与读码框架被引量:2
- 1997年
- 评述了DNA核苷酸关联的几种研究途径.重点研究了偏好模分析方法,讨论了它与信息参数的联系.发现了编码区偏好用S-W(强弱键)语言,而非编码区偏好用R-Y(嘌呤嘧啶)语言,解释了这种区分的意义.找到了编码区常用模(*WS)的规律性,指出这种偏好性可能与t-RNA丰度有关.研究了如何寻找读码框架及非编码区中是否存在隐蔽框架的问题.
- 罗辽复纪丰民
- 关键词:DNA
- 基因及基因组中的若干物理问题
- 全文分三部分:1.采用有序片段方法统计研究了遗传2主息在分子序列上的存储特点;2.通过定义分子序列的突变危险性函数阐明了遗传信息从基因序列流向蛋白质分子的编码原理;3.建立了植物病毒基因组增殖过程的动力学理论从而解释了烟...
- 纪丰民
- 关键词:遗传信息基因序列蛋白质分子烟草花叶病毒转基因植物
- 核酸序列的模糊聚类与分子进化被引量:1
- 1992年
- 将核酸序列(编码区)分成几类,求出每类的平均信息参数(D_L),用模糊聚类的方法研究它们的相似性和同源性,求出各级相似分岔值并导出动态聚类图.证明了短程相似分岔与序列进化有明显的相性,即L=2-5的一级相似分岔值与物种出现地质年代的对数保持较好的线性关系.
- 纪丰民罗辽复
- 关键词:核酸序列模糊聚类分子进化
- 模糊集论在理论生物学中的若干应用
- 纪丰民
- 模糊极值与遗传密码的亲水-疏水性和突变危险性
- 1993年
- 提出了两遗传密码子之间距离的一个定义:以该定义为基础构造了密码字典的突变危险度函数;应用模糊极值方法求出了使突变危险度极小的标准密码表的疏水-亲水畸分布;证实由局域极小化的简并多重态构成的标准密码字典和大部分线粒体密码字典的突变危险度是近似极小的。若以密码字典系综平均突变危险度和最大突变危险度为标度,现有的各种密码表与极小值的接近程度在90%左右;计算结果还支持这样的假设:密码表的进化是遵循整体突变危险性极小的,标准密码表可能是由类似于线粒体密码的古典密码表进化来的,而碱基的化学修饰有助于降低突变危险性。
- 纪丰民罗辽复
- 关键词:遗传密码
- 几种序列复杂性的比较研究
- 1992年
- 进一步讨论了如何定义一维序列复杂性的问题,计算了平方映象,Fibonacci序列和核酸序列的复杂性.结果表明,准周期的Fibonacci序列有相对最高的复杂性;平方映象中混沌轨道阈值及杂有周期性窗口的区域具有较高的复杂性;核酸序列由于强的随机噪声背景,一般复杂性较低,其中具有长程关联的序列复杂性较高.
- 纪丰民李宏罗辽复
- 关键词:核酸序列
- 分形自然观和分形方法被引量:2
- 1991年
- 本文试图把分形作为一种自然观,概括了在自然科学及其与社会科学交接而成的诸边缘学科中的分形现象。探讨了分形的方法论意义并应用分形方法讨论了科学革命、分形神经元计算机和全息生物学的辨护等一些学科的前沿问题。
- 纪丰民
- 关键词:分形自然观方法论