- 日本扁柏核基因组微卫星的分离与鉴定被引量:2
- 2004年
- 以日本扁柏 4个种源的DNA样品为材料 ,经NdeⅡ酶切并电泳后回收 30 0~ 10 0 0bpDNA片段 ,与含有生物素标记的 (CT) 15探针杂交 ,再用磁珠 (Dynabeads M2 80streptavitinbeads)固定杂交产物 ,成功地实现了日本扁柏核基因组微卫星的高效分离。以pUC118BamHⅠ /BAP为载体 ,E .coli为寄主 ,构建了日本扁柏 2个富含微卫星的基因组文库 ,共获得 2 2 0 0多个阳性克隆。从构建的基因组文库中 ,随机挑选 4 80个阳性克隆进行测序 ,发现含有微卫星的克隆比例高达 6 5 6 % ,其中 2 15个非同源性克隆共含有 380个微卫星位点 ,平均每个克隆含 1 7个。微卫星种类以与探针 (CT) 15互补的 (GA/CT) n 为主 ,占 86 1% ,同时还存在 (TG/AC) n和 3~ 4个碱基为单元构成的微卫星 ,如 (ATAG) n、(CAGA) n、(TGA) n、(ACG) n、(TCA) n、(TCT) n 等。利用Oligo 5 1软件为 114个含有微卫星的克隆共 12 8个微卫星位点设计出了PCR扩增引物。
- 李新国田金菊谷尚树津村义彦
- 关键词:日本扁柏微卫星基因组测序
- 毛白杨悬浮细胞系细胞壁形成基因的差异表达被引量:4
- 2004年
- 以单细胞和小细胞团二种悬浮培养体系为材料,利用反转录PCR技术(RT PCR),研究了毛白杨初生和次生细胞壁形成中若干相关基因的差异表达,包括与细胞伸展、纤维素合成、木质素合成等有关的12个基因。结果表明:3个伸展酶基因(α Exp)在单细胞悬浮细胞系中均有大量表达,其中α Exp2最高,其次为α Exp3,表明处于旺盛的细胞伸展期,而小细胞团悬浮细胞系只有α Exp3的表达相对较强,表明处于细胞伸展后期或次生壁形成初期;在6个纤维素合成相关基因中,2种悬浮细胞系均有较高的CesA4和CaSy1表达,并且CesA1、CesA3 1和CesA3 2也有一定表达,表明它们均有不同程度的初生壁形成,但CesA3 1和CesA3 2的表达在小细胞团中相对较高,推测它有相对较多的纤维素合成和初生壁形成;2种悬浮细胞系中均未检测出Lac1和Unk1基因的表达,推测均没有木质素的大量合成和次生壁的完整发育。
- 李新国田金菊
- 关键词:细胞悬浮培养毛白杨基因差异表达