王建秀
- 作品数：1 被引量：10H指数：1
- 供职机构：中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- rps4作为苔藓植物候选条形码的可行性:基于GenBank数据的分析被引量：10
- 2011年
- 对于苔藓植物DNA条形码研究来说,目前已提议的可用片段只有rbcL和trnH-psbA,并且均具有一定局限性。本文基于GenBank中3,365条rps4序列,利用遗传距离法和分子系统学方法评价它作为苔藓植物候选条形码的可行性。结果显示:(1)rps4序列覆盖了藓纲96%的科和苔纲88%的科,具有通用性;(2)rps4物种分辨能力为73.0%,并且它在6个序列最丰富的苔藓植物属(Plagiochila,Tortula,Plagiomnium,Pyrrhobryum,Pogonatum,Grimmia)内的物种识别能力均高于rbcL-a在同属中的分辨能力;(3)GenBank中已经积累了大量已知物种来源的rps4序列,可为DNA条形码物种鉴定提供一个参考数据库。因此,本文建议将rps4作为苔藓植物候选DNA条形码。尤其是当rbcL和trnH-psbA在某个具体类群中无法取得理想的物种识别效果时,rps4可作为补充。
- 刘艳王建秀葛学军曹同
- 关键词：隐花植物叶绿体DNA物种鉴定
