汪恩涛
- 作品数:22 被引量:293H指数:7
- 供职机构:中国农业大学生物学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生历史地理更多>>
- 海南快生根瘤菌I66的部分16S rRNA序列测定被引量:3
- 1994年
- 与豆科植物共生固氮的根瘤菌目前有4个属、10个种.包括Rhizobium(6个种),Sinorhizobium(2个种),Azorhizobium(1个种)和Bradyrhizobium(1个种).其中多数是近年来采用现代分类技术分析后建立的,而且新的类群还在不断被发现.在以前的根瘤菌数值分类及DNA-DNA杂交研究中,我们确定了海南慢生型根瘤菌属于大豆慢生根瘤菌种(B.japonicum).而海南快生型根瘤菌的分类地位则较为分散.其中一些菌株属于已知各根瘤菌种,另有4株银合欢根瘤菌和13株来自不同寄主的菌株分别构成具有独立的分类地位的两个菌群(第2群和第4群)(待发表).为了进一步明确它们的分类地位,我们依据国际系统细菌学委员会根瘤菌分委员会的建议,利用Young等建立的聚合酶链反应(PCR)及测序技术,对第4群的代表菌株166的部分16SrRNA基因片段进行了扩增和测序.
- 汪恩涛李英波阎大来冯继东陈文新
- 关键词:根瘤菌
- 不同根瘤菌表观群间rRNA同源性分析
- 汪恩涛
- 关键词:根瘤菌
- 根瘤菌与豆科植物共生混杂性机制探究
- 刘元辉王丹焦银山田长富汪恩涛陈文新郭宝林陈文峰
- 河北地区花生根瘤菌的系统发育多样性研究被引量:12
- 2006年
- 【目的】了解中国北方地区花生根瘤菌的多样性状况。【方法】采用16SrDNAPCR-RFLP、16S~23SIGSPCR-RFLP和16SrRNA基因的序列分析方法对分离自河北地区的58株花生根瘤菌以及Rhizobium、Agrobacterium、Sinorhizobium、Mesorhizobium和Bradyrhizobium的参比菌株进行系统发育多样性比较分析。【结果】16SrDNAPCR-RFLP方法在细菌属水平上聚群良好;而16S~23SIGSPCR-RFLP则适于属和种水平上的聚群。3种方法在系统发育上得到基本一致的结果。其中有38株花生根瘤菌是与Bradyrhizobium关系密切的慢生菌株,并且与B.japonicum和B.liaoningense的关系最为接近,与有关中国西南地区和华中地区花生根瘤菌的报道结果相似。然而供试菌株中还存在6株快生和10株中慢生花生根瘤菌,其中快生菌在系统发育关系上接近R.yanglingense、R.mongolense和R.gallicum。【结论】河北地区的花生根瘤菌具有更大的多样性。
- 刘杰汪玲玲汪恩涛李颖陈文新
- 关键词:花生根瘤菌系统发育多样性
- SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳用于根瘤菌分类
- 汪恩涛
- 中国温带地区根瘤菌与山黎豆和棘豆的新共生组合被引量:1
- 2008年
- 采用16SrDNAPCR-RFLP,16S-23SIGSRCP-RFLP,TP-RAPD,MLEE,16SrDNA和持家基因序列分析(atpD,recA和glnⅡ)等多种方法研究了50株分离自中国北方地区的山黎豆属(Lathyrus)和棘豆属(Oxytropus)植物根瘤菌的遗传多样性和系统发育关系.结果表明,山黎豆属植物主要与根瘤菌属(Rhizobium)结瘤,而棘豆属植物主要与中华根瘤菌属(Sinorhizobium)结瘤.一个与蚕豆根瘤菌(R.fabae)相近的根瘤菌种群和苜蓿中华根瘤菌(S.meliloti)分别被鉴定为山黎豆和棘豆在本地区的主要共生细菌,而这两个根瘤菌-豆科植物的组合还没有在其他地区被发现.这些结果扩展了与该两属植物共生的细菌谱,并为根瘤菌的生物地理学研究提供了新证据.
- 隋新华韩丽丽汪恩涛江枫刘艺海陈文新
- 关键词:棘豆属根瘤菌
- 我国部分地区土壤杆菌的数值分类及DNA同源性分析被引量:1
- 1998年
- 本研究对我国42株土壤杆菌待测菌株和28株参比菌进行了数值分类和DNA同源性分析,结果将41株土壤杆菌与2株根瘤菌分在3个土壤杆菌种内,其中23株来自内蒙等地葡萄的菌株分在葡萄土壤杆菌种内,10株来自山东等地樱桃、桃树的菌株为发根土壤杆菌,8株来自4个地区4种植物的菌株及分自宁夏刺果甘草的2株根瘤菌菌株参比菌分在根癌土壤杆菌种内。1株土壤杆菌和1株根瘤菌的分类地位有待进一步研究。
- 隋新华汪恩涛陈文新王慧敏
- 关键词:土壤杆菌根瘤菌DNA同源性分析
- 16SrRNA基因测序确定根瘤菌的系统发育被引量:7
- 1995年
- 采用聚合酶链反应和DNA测序技术分析了两个新根瘤菌群的代表菌株的部分16SrRNA基因序列,并对所得序列进行了聚类分析。在系统发育树状图中,菌株sh22623所代表的根瘤菌群与菜豆根瘤菌、豌豆根瘤菌及发根土壤杆菌等构成一个亚群,另一个菌群的代表菌株sh19312与土壤杆菌的3个种构成一亚群。这些结果初步确定了两菌群的系统发育地位,并揭示了根瘤菌与土壤杆菌两属间进化上的密切关系。
- 汪恩涛曲春枫冯继东牛天贵陈文新
- 关键词:根瘤菌系统发育基因测序
- 椰毒假单胞菌部分16s rRNA序列测定法
- 1994年
- 详细介绍了椰毒假单胞菌部分16srRNA序列测定法。常规提取细菌DNA,采用聚合酶链反应(PCR)扩增目的基因,琼脂糖凝胶电泳后回收目的基因。纯化后克隆到M13mp19噬菌体上,转染大肠杆菌JM109菌株。挑选无色噬斑扩增并提取其双链DNA,酶切分析为阳性克隆,提取其单链DNA在ABI公司370A型自动测序仪上测序。
- 曲春枫李在连赵乃昕汪恩涛陈文新
- 关键词:聚合酶链反应测序法椰毒假单胞菌
- 海南快生根瘤菌蛋白、多位点酶及质粒电泳被引量:1
- 1994年
- 在本室以前的研究中,海南快生根瘤菌具有分类上的多型性。其一部分归于已知各根瘤菌种,另有一部分菌株构成独立的表观群及相应的DNA同源群(亚群Ⅱ和Ⅳ)。本文采用不同的电泳方法,分析了海南快生根瘤菌和已知根瘤菌种的代表共55个菌株的全细胞蛋白、酯酶、过氧化物酶及质粒组成。结果表明:同一亚群的菌株间有相似的蛋白图谱,种群之间有较明显的差异,根瘤菌中普遍存在酯酶,酶带的数量和迁移率具有菌株专一性,更适合于苗株的鉴别。过氧化物酶只在部分菌株中观察到,亚群Ⅱ与亚群Ⅳ的菌株均显示一条酶带,但二者之间的相对迁移率有明显差别。质粒电泳中,大多数海南快生菌中存在着大质粒,分子量范围是20-4000Kb,同一亚群中的不同菌株间具有一定相似性,这些结果为海南快生型根瘤菌的分类提供了一些辅助证据。
- 汪恩涛王小波劳华军陈文新
- 关键词:根瘤菌电泳质粒蛋白