池炳杰 作品数:11 被引量:104 H指数:5 供职机构: 上海海洋大学水产与生命学院 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
瓦氏雅罗鱼遗传多样性分析和耐盐碱cDNA消减文库的构建 瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii(Dybowski))隶属硬骨纲(Osteichthyes)、鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、雅罗鱼属(Leuciscus)。广泛分布于... 池炳杰文献传递 应用荧光标记通用引物检测鲤鱼(Cyprinus Carpio)微卫星基因型 被引量:4 2010年 应用荧光标记通用引物检测微卫星是一种省成本、省时间、高效精确的基因型检测方法。本文介绍了该方法的基本原理和操作流程,并首次应用此方法检测鲤微卫星标记的基因型。结果显示,除位点HLJ179未检测到有效数据外,其它14个位点都采集到相应的基因型。该方法在鲤微卫星基因分型上的成功应用,为今后鲤大规模连锁分析提供了一种更经济有效的检测方法。 常玉梅 高国强 韩启霞 池炳杰 梁利群关键词:荧光标记 通用引物 鲤鱼 基因分型 瓦氏雅罗鱼达里湖群体和乌苏里江群体的遗传多样性和遗传结构分析 被引量:27 2010年 选用5个瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii Dybowski)微卫星标记和13个草鱼微卫星标记,对分别采自内蒙古境内的达里湖和乌苏里江抚远江段的各15尾野生瓦氏雅罗鱼个体进行STR-PCR分析。结果显示,18个微卫星标记共检测到111个等位基因,平均每个基因座扩增得到6.1667个等位基因,观测杂合度(H o)0.1000~0.9333,平均为0.5315;期望杂合度(H e)0.0966~0.9328,平均为0.6298;多态信息含量(PIC)0.0905~0.9113,平均为0.5774;乌苏里江群体的平均等位基因数和平均观测杂合度分别为5.5556和0.5778,达里湖群体的平均等位基因数和平均观测杂合度均低于乌苏里江群体的平均等位基因数和平均观测杂合度,分别为4.3889和0.4852。2个群体间的遗传距离(D c)为0.2550。个体聚类结果显示,达里湖雅罗鱼所有个体聚为一簇,乌苏里江雅罗鱼所有个体聚为一簇。群体间的遗传分化指数(F st)为0.0855,数值介于0.05~0.15,N m值为2.6749,表明这2个群体处于中等分化,存在一定程度的基因交流。对2个群体的基因型进行了Hardy-Weinberg平衡的卡方检验,结果表明两群体均在一定程度上偏离了平衡。 池炳杰 常玉梅 闫学春 曹顶臣 高玉奎 柳玉海 李勇 梁利群关键词:瓦氏雅罗鱼 微卫星标记 滩头雅罗鱼幼鱼对NaCl浓度和碱度的适应性分析 被引量:22 2011年 为了解滩头雅罗鱼[Tribolodon brandti(Dybowski)]对NaCl浓度、碱突变的适应能力,在水温为22~25℃,采用单因子静态急性毒性实验法对滩头雅罗鱼3月龄幼鱼进行NaCl、碱适应性研究。结果表明,在pH7.3~0.2、碱度1.11mmol/L时,NaCl浓度对实验鱼12h、24h、48h和96h的半致死浓度(LC50)值分别为28.81g/L、28.57g/L、28.51g/L和28.40g/L,安全值(sc)为8.52g/L。在pH8.5士0.5时、NaCl浓度为3.1~7.4g/L时,碱度对实验鱼12h、24h、48h、72h和96h的LC50分别为98.79mmol/L、89.31mmol/L、79.34mmol/L、78.45mmol/L和68.44m~ol/L,安全值为18.79mmol/L。本研究旨在为滩头雅罗鱼盐碱池塘养殖推广和野生种群种质资源的保护提供基础数据。 池炳杰 梁利群 刘春雷 常玉梅 王山 韩启霞 高国强关键词:碱度 适应性 营养条件对转生长激素基因鲤生长和性腺发育的影响 2011年 运用形态学和组织学方法对转生长激素基因鲤在不同营养条件下的生长、饲料占有情况和性腺发育进程进行了研究。结果表明:正常投饲营养充分的池塘中转基因鲤与对照鲤的体重增长率分别是99.6%和68.2%;而在半饥饿饲料短缺池塘中的转基因鲤和对照鲤体重增长率分别为51.3%和49.8%。说明正常投喂饲料条件下转基因鲤的生长速度明显快于对照鲤;半饥饿饲料短缺条件下转基因鲤的体重增长速度与对照鲤无显著性差异。在7、8、9月份,对不同时期性腺发育状况检验结果表明,饲养在不同营养条件下的两种鱼的雌、雄性腺发育速度不同,但差异均不显著(p>0.05)。 刘春雷 徐丽华 常玉梅 梁利群 刘金亮 池炳杰 吴学工关键词:营养条件 性腺发育 大黄鱼耐低温性状相关微卫星标记的筛选 被引量:15 2010年 鱼类的耐低温性状是一种重要的经济性状。为了初步分析大黄鱼的耐低温性状,文章采用15对荧光微卫星标记,以SSR-PCR方法对大黄鱼低温耐受组和正常对照组F1代共40个个体进行了耐低温性状遗传差异分析。结果显示,标记LYC0002在两组样品中共扩增出5个等位基因(片段大小分别为112bp、110bp、108bp、106bp和104bp),其中LYC0002112bp等位基因在低温耐受组的出现频率达60%,而在正常对照组中的频率为零,表明该等位基因对大黄鱼的温度敏感特性有较明显的偏好性,可能与某种耐低温基因存在一定的连锁关系。此外,对LYC0002106bp、LYC0002108bp、LYC0002110bp和LYC0002112bp4个等位基因分别进行了回收、克隆及测序。序列比对结果显示,LYC0002112bp等位基因含有10个(CA)重复单元,而其他3个等位基因依次缺失1个(CA)重复单元,说明LYC0002在本研究样本中的突变方式为微卫星逐步突变模型(Stepwise mutation model,SMM)。 高国强 常玉梅 韩启霞 池炳杰 李明云 薛良义 梁利群关键词:大黄鱼 耐低温 微卫星 荧光染料 AFLP技术的优化及在三倍体银鲫DNA指纹图谱中的应用 被引量:3 2010年 扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)技术具有多态性丰富,所需DNA量少,灵敏度高等优点,但流程繁琐,花费时间长。本文根据AFLP技术的特点,在酶切-连接和聚丙烯酰胺凝胶的制备,这两方面做了很大改进。采用优化的AFLP技术分析三倍体银鲫的DNA指纹图谱,不仅缩短了实验所需时间,而且获得了稳定清晰的扩增带型。 韩启霞 高国强 刘春雷 徐丽华 池炳杰 梁利群关键词:AFLP标记 聚丙烯酰胺凝胶电泳 银鲫 养殖大黄鱼一个繁育群体亲本亲缘关系剖析 被引量:2 2009年 该文利用23个微卫星标记对103尾大黄鱼繁育亲本进行遗传多样性检测和亲缘关系重建分析,并构建繁育体系指导大黄鱼配组。遗传多样性检测显示,103尾亲鱼在23个座位共获得等位基因数134个,平均5.82个,总平均观察杂合度0.5993,表明该繁育群体尚保持一定水平的遗传多样性。采用似然率和组合优化法统计模型重建的同胞关系不尽相同,但结果均证实了这些繁育亲本亲缘关系十分相近。配组比对分析结果显示,两种方法的配组方案一致性高达85%,最终选择组合优化法的分组方案指导大黄鱼配组繁育。 常玉梅 徐万土 池炳杰 高国强 韩启霞 何薇 孙效文 梁利群关键词:大黄鱼 微卫星标记 亲缘关系 近交 ENU诱变银鲫F_1的遗传差异分析 被引量:2 2010年 本研究采用乙酰基亚硝基脲(ENU)浸泡的方法诱变银鲫(Carassius autatus gibeblio Bloch)持续2周,后经清水反复漂洗,再进行人工催产得到诱变银鲫同源自交F1,利用AFLP技术对诱变银鲫F1(30尾)和对照银鲫(25尾)进行DNA指纹图谱分析,发现了Ⅰ型(缺失型)特异位点和Ⅱ型(插入型)特异位点;同时对6尾诱变银鲫F1和2尾对照银鲫mtDNA进行全序列测序分析,发现诱变组突变位点几乎覆盖整个线粒体DNA,主要集中在13个蛋白质编码基因、12SrRNA基因、16SrRNA基因和D-Loop控制区;通过对诱变组(55尾)和对照组(17尾)mtDNA的NADH1与NADH2部分序列比对发现,诱变银鲫F1诱变率约为38%。以上实验结果表明,诱变银鲫F1核质遗传物质同时发生变异,且变异位点基本相同,银鲫雄性子代的突变率大于雌性子代。这为探索提高ENU诱导银鲫突变的效率和开发养殖鱼类新的育种技术提供了新的理论依据。 韩启霞 常玉梅 梁利群 高国强 池炳杰 曹顶臣 孙效文关键词:方正银鲫 ENU AFLP MTDNA 鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选 被引量:12 2011年 采用双标准曲线相对实时荧光定量PCR法,分别以23℃常温对照组和6℃低温待测组的黑龙江鲤脑组织cDNA为模板,以18S rRNA为内参基因,检测26个候选基因的相对表达量。实验数据经显著性分析发现,有5个候选基因在低温条件下表达量显著上升(P<0.01),与对照组相比它们的表达量分别上升了2.11倍、13.9倍、2.52倍、7.38倍和1.83倍,基因功能比对结果表明其编码蛋白产物分别是脂肪酸链延伸蛋白、酰基辅酶A脱氢酶、转录起始因子IIB、肌醇-1-磷酸合成酶、血脑屏障HT7抗原;有7个候选基因在低温下表达量分别下降了21.8%、25.9%、16.6%、23.7%、15.8%、16.3%、42.5%,但对照组和待测组差异不显著(P>0.05),基因功能比对发现它们主要参与抑制糖酵解,促进细胞凋亡和干扰神经系统的重塑活动。上述低温下表达量显著上升的5个冷诱导候选基因的获得为今后进行不耐低温鱼类的基因工程育种提供了基因元件。 徐丽华 常玉梅 刘春雷 梁利群 刘金亮 池炳杰关键词:候选基因 实时荧光定量PCR